Militaire hervormingEdit
In 1648, gebruik makend van de ervaring met het oprichten van regimenten van het buitenlandse systeem tijdens het bewind van zijn vader, begon Alexis met de hervorming van het leger.
De belangrijkste richting van de hervorming was de massale oprichting van Regimenten van de Nieuwe Orde: Reiters, Soldaten, Dragonders en Huzaren. Deze regimenten vormden de ruggengraat van het nieuwe leger van tsaar Alexis. Om de hervormingsdoelen te verwezenlijken, werd een groot aantal Europese militaire specialisten in dienst genomen. Dit werd mogelijk door het einde van de Dertigjarige Oorlog, waardoor in Europa een kolossale markt voor militaire vakmensen ontstond.
OpstandenEdit
Tijdens zijn bewind werd Alexei geconfronteerd met opstanden in heel Rusland. Na het oplossen van het Zoutoproer in 1648 werd Alexei in 1650 geconfronteerd met opstanden in de steden Pskov en Groot-Novgorod. Alexei sloeg de opstand in Novgorod snel neer, maar was niet in staat Pskov te onderwerpen en moest de stad amnestie beloven in ruil voor overgave. De metropoliet Nikon onderscheidde zich in Groot-Novgorod en werd in 1651 de belangrijkste minister van de tsaar.
Tegen de jaren 1660 hadden Alexei’s oorlogen met Polen en Zweden de Russische economie en overheidsfinanciën steeds meer onder druk gezet. Als reactie daarop was de regering van Alexei in 1654 begonnen met het slaan van grote aantallen koperen munten om de overheidsinkomsten te verhogen, maar dit leidde tot een devaluatie van de roebel en een ernstige financiële crisis. Als gevolg daarvan kwamen boze inwoners van Moskou in 1662 in opstand in het Koperen Oproer, dat met geweld werd neergeslagen.
In 1669 barstten de Kozakken langs de Don in Zuid-Rusland in opstand uit. De opstand werd geleid door Stenka Razin, een ontevreden Don-Kozak die het Russische eindpunt Astrakan had veroverd. Van 1670 tot 1671 nam Razin meerdere steden langs de rivier de Wolga in. Het keerpunt in zijn campagne was zijn mislukte belegering van Simbirsk in oktober 1670. Razin werd uiteindelijk in april 1671 aan de Don gevangen genomen en in Moskou gelegerd en gevierendeeld.
Oorlog tegen Safavid IranEdit
In 1651 vielen Safavidische troepen Russische vestingwerken in de Noord-Kaukasus aan. De hoofdzaak betrof de uitbreiding van een Russisch garnizoen aan de Koy Su rivier, alsmede de bouw van verschillende nieuwe forten, met name die aan de Iraanse kant van de Terek rivier. Het succesvolle Safavid-offensief leidde tot de vernietiging van het Russische fort en de verdrijving van het garnizoen. In 1653 besloot Alexis, die aanvankelijk overwoog de Zaporozjische Kozakken te sturen, uiteindelijk een gezantschap naar Perzië te sturen voor een vreedzame regeling van het conflict. In augustus 1653 reisden hoveling prins Ivan Lobanov-Rostov en hofmeester Ivan Komynin van Astrakan naar Isfahan. Sjah Abbas II stemde in met een regeling van het conflict, waarbij hij verklaarde dat het conflict zonder zijn toestemming was begonnen.
Oorlogen tegen Polen en ZwedenEdit
In 1653 moedigden de zwakte en wanorde van Polen, dat net uit de opstand van Khmelnytsky was gekomen, Alexei aan om te proberen het oude land van Rus in te lijven. Op 1 oktober 1653 kwam te Moskou een nationale vergadering bijeen om de oorlog goed te keuren en de middelen te vinden om deze uit te voeren, en in april 1654 werd het leger gezegend door Nikon, die in 1652 tot patriarch was gekozen.
De veldtocht van 1654 was een ononderbroken triomf, en tal van steden, waaronder de belangrijke vesting Smolensk, vielen in de handen van de Russen. De Oekraïense Hetman Bogdan Khmelnitsky deed een beroep op Tsaar Alexei voor bescherming tegen de Polen, en het Verdrag van Pereyaslav bracht de Russische overheersing van het Kozakken Hetmanaat op de linkeroever van Oekraïne tot stand.
In de zomer van 1655 vaagde een plotselinge invasie van Karel X van Zweden de Poolse staat kortstondig weg, in wat bekend werd als de Zondvloed. De Russen, zonder tegenstand, eigenden zich snel bijna alles toe wat nog niet door de Zweden bezet was. Toen de Polen aanboden te onderhandelen, was het hele groothertogdom Litouwen wel het minste van de eisen van Alexei. Alexei en de koning van Zweden kregen echter ruzie over de verdeling van de buit, en eind mei 1656 verklaarde Alexei, aangemoedigd door de Habsburgse keizer en de andere vijanden van Zweden, Zweden de oorlog.
Rusland verwachtte grootse dingen van de Zweedse oorlog, maar er kwam niets van terecht. Dorpat werd ingenomen, maar ontelbare massa’s manschappen gingen tevergeefs verloren voor Riga. Polen had zich intussen zo ver hersteld dat het een veel gevaarlijker vijand was geworden dan Zweden, en aangezien het onmogelijk was om met beide tegelijk oorlog te voeren, besloot de tsaar om zich eerst van de Zweden te ontdoen. In de Vrede van Kardis (2 juli 1661) deed Rusland afstand van al haar veroveringen.
De Poolse oorlog sleepte zich nog zes jaar voort en werd toen gesloten met de wapenstilstand van Andrusovo (11 februari 1667), nominaal voor dertien jaar, die het meest duurzame van alle verdragen bleek te zijn. Volgens de wapenstilstand werden Polotsk en Pools Lijfland aan Polen teruggegeven, maar de belangrijkere steden Smolensk en Kiev bleven in handen van Rusland, samen met de hele oostelijke oever van de Dnjepr. Deze wapenstilstand was de verdienste van Afanasja Ordin-Nasjtsjokin, de eerste Russische kanselier en diplomaat in moderne zin, die na de schande van Nikon eerste minister van de tsaar werd tot 1670, toen hij werd vervangen door de even bekwame Artamon Matvejev, wiens weldadige invloed tot het einde van Alexei’s regeerperiode standhield.
Reactie op Engelse burgeroorlogEdit
Toen Karel I van Engeland in 1649 door de parlementariërs onder leiding van Oliver Cromwell werd onthoofd, verbrak een woedende Alexei de diplomatieke betrekkingen met Engeland en aanvaardde Royalistische vluchtelingen in Moskou. Hij verbande ook alle Engelse kooplieden uit zijn land (met name leden van de Compagnie van Moskou) en verleende financiële hulp aan “de troosteloze weduwe van die roemrijke martelaar, koning Karel I.”
Schisma met de OudgelovigenEdit
In 1653 stelde patriarch Nikon een reeks hervormingen in om de praktijken van de Russisch-Orthodoxe Kerk in overeenstemming te brengen met die van haar Griekse tegenhanger. De kerk begon met name het gebruik van drie vingers in plaats van twee verplicht te stellen bij het maken van het kruisteken. Dit leidde tot grote onenigheid binnen de kerkgemeenschap. Niettemin bleef Alexei Nikon steunen tot 1658, toen Nikon zijn ambt neerlegde wegens een persoonlijke belediging, waardoor de zetel van de patriarch onbezet bleef.
In 1666 riep de tsaar de Grote Moskousynode bijeen, die werd bijgewoond door patriarch Macarios III van Antiochië en patriarch Paisius van Alexandrië, om de door Nikon veroorzaakte problemen aan te pakken. De synode stemde in met de formele afzetting van Nikon, en besloot tevens tot de excommunicatie van allen die zich verzetten tegen de hervormingen van de kerk; deze tegenstanders braken met de officiële Russisch-orthodoxe kerk en vormden de beweging van de Oudgelovigen.