Wednesday, September 30, 2015
We zijn verheugd om onze nieuwste Single Molecule, Real-Time sequencer aan te kondigen, het Sequel™ System. Bekijk deze korte video om meer te weten te komen over deze opwindende evolutie in SMRT®-sequencing.
Het Sequel-systeem biedt een hogere doorvoer, meer schaalbaarheid, een kleinere voetafdruk en lagere sequencingprojectkosten in vergelijking met het PacBio® RS II-systeem, terwijl de voordelen van SMRT-technologie behouden blijven. De kern van het Sequel-systeem is de capaciteit van de opnieuw ontworpen SMRT-cellen, die bij de lancering een miljoen zero-mode waveguides (ZMW’s) bevatten, vergeleken met 150.000 ZMW’s in het PacBio RS II. Actieve individuele polymerasen zijn geïmmobiliseerd binnen de ZMW’s, waardoor vensters ontstaan om DNA-sequencing in real time te observeren en vast te leggen.
Met ongeveer zeven keer zoveel lezingen per SMRT Cell als de PacBio RS II, zouden klanten in staat moeten zijn om lagere kosten en kortere tijdschema’s voor sequencingprojecten te realiseren, met ongeveer de helft van de initiële kapitaalinvestering in vergelijking met vorige technologie. Het Sequel-systeem neemt minder ruimte in beslag – minder dan een derde van de grootte en het gewicht – vergeleken met de PacBio RS II. Aangezien het nieuwe systeem is gebouwd op de gevestigde SMRT-technologie van het bedrijf, zijn de meeste aspecten van de sequencing-workflow ongewijzigd.
Het Sequel-systeem is ideaal voor projecten zoals het snel en kosteneffectief genereren van hoogwaardige, whole-genome de novo assemblies voor grotere genomen, zoals menselijke, planten en dieren. Het kan de karakterisering van een breed scala van genomische variatie typen, met inbegrip van die in complexe regio’s niet toegankelijk met short-read of synthetische lange-afstandsequencing technologieën, terwijl tegelijkertijd onthullen epigenetische informatie. Het systeem kan ook worden gebruikt om gegevens te genereren voor volledige transcriptomen en gerichte transcripten met behulp van het IsoSeq™-protocol van het bedrijf. De grotere verwerkingscapaciteit van het Sequel-systeem moet ook toepassingen van de SMRT-technologie in metagenomica en gerichte gentoepassingen vergemakkelijken, waarbij de ondervraging van grotere aantallen individuele DNA-moleculen belangrijk is.
In het persbericht van vandaag zegt Michael Hunkapiller, Ph.D., CEO van Pacific Biosciences: “We zijn bijzonder trots om het Sequel Systeem te introduceren, dat toegang biedt tot de bestaande voordelen van SMRT Sequencing, waaronder lange reads, hoge consensus nauwkeurigheid, uniforme dekking, en geïntegreerde methylatie informatie – een set van kernattributen die voor het eerst werden gepionierd met de PacBio RS. De lagere kosten en kleinere voetafdruk van het systeem vertegenwoordigen onze voortdurende inzet om de schaalbaarheid van onze technologie en de unieke kenmerken van SMRT Sequencing te benutten.”
“We zullen onze PacBio RS II-klanten blijven ondersteunen en we verwachten verbeteringen in sample prep, sequencing-chemie en software te introduceren die de prestaties van dat systeem zullen uitbreiden, zoals we elk jaar hebben gedaan sinds de initiële commercialisering van de PacBio RS in 2011 en de PacBio RS II in 2013. We verwachten elk jaar soortgelijke, substantiële prestatieverbeteringen voor het Sequel-systeem door te voeren,” voegde Dr. Hunkapiller eraan toe. “Bovendien biedt de Sequel-architectuur de mogelijkheid om de doorvoer te schalen door het aantal ZMW’s op toekomstige SMRT-cellen aanzienlijk te variëren, waardoor de doorvoer en bedrijfskosten voor specifieke toepassingen worden geoptimaliseerd.”
On Display at the ASHG Annual Meeting
Wij zullen het Sequel System demonstreren in onze stand (#907) op de jaarlijkse vergadering van de American Society of Human Genetics die plaatsvindt in Baltimore, Maryland, vanaf 6 oktober 2015.
Of u de bijeenkomst nu wel of niet bijwoont, u kunt nog steeds onze workshop bijwonen, “Addressing Hidden Heritability through Long Read Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing,” op woensdag 7 oktober van 13.00 tot 14.30 uur. Het evenement wordt gehost door Michael Hunkapiller en Jonas Korlach van Pacific Biosciences, en omvat lezingen van Richard Gibbs van Baylor College of Medicine en Richard Wilson van Washington University in St. Louis. Degenen die de conferentie in Baltimore bijwonen kunnen zich hier registreren. We zullen ook live streaming en toegang tot de opname aanbieden.
Voor meer informatie over het Sequel-systeem, ga naar pacb.com/sequel.