Mercoledì 30 settembre 2015

Siamo entusiasti di annunciare il nostro nuovo sequenziatore a singola molecola in tempo reale, il sistema Sequel™. Guarda questo breve video per conoscere questa emozionante evoluzione nel sequenziamento SMRT®.

Il sistema Sequel fornisce una maggiore produttività, più scalabilità, un ingombro ridotto e costi di progetto di sequenziamento inferiori rispetto al sistema PacBio® RS II, pur mantenendo i vantaggi della tecnologia SMRT. Il cuore del sistema Sequel è la capacità delle sue celle SMRT riprogettate, che contengono un milione di guide d’onda a modalità zero (ZMWs) al lancio, rispetto alle 150.000 ZMWs del PacBio RS II. Le singole polimerasi attive sono immobilizzate all’interno delle ZMW, fornendo finestre per osservare e registrare il sequenziamento del DNA in tempo reale.

Con circa sette volte il numero di letture per cella SMRT rispetto al PacBio RS II, i clienti dovrebbero essere in grado di realizzare costi inferiori e tempistiche più brevi per i progetti di sequenziamento, con circa la metà dell’investimento di capitale iniziale rispetto alla tecnologia precedente. Il sistema Sequel occupa un ingombro minore – meno di un terzo delle dimensioni e del peso – rispetto al PacBio RS II. Poiché il nuovo sistema è costruito sulla consolidata tecnologia SMRT dell’azienda, la maggior parte degli aspetti del flusso di lavoro di sequenziamento sono invariati.

Il sistema Sequel è ideale per progetti come la generazione rapida ed economica di assemblaggi de novo di alta qualità di interi genomi per genomi più grandi, come quelli umani, delle piante e degli animali. Può fornire la caratterizzazione di un’ampia varietà di tipi di variazioni genomiche, comprese quelle in regioni complesse non accessibili con tecnologie di sequenziamento a corto raggio o sintetiche a lungo raggio, rivelando contemporaneamente informazioni epigenetiche. Il sistema può anche essere usato per generare dati per trascrittomi a lunghezza intera e trascrizioni mirate usando il protocollo IsoSeq™ dell’azienda. La maggiore produttività del sistema Sequel dovrebbe anche facilitare le applicazioni della tecnologia SMRT nella metagenomica e nelle applicazioni genetiche mirate per le quali è importante l’interrogazione di un numero maggiore di singole molecole di DNA.

Nel comunicato stampa di oggi, Michael Hunkapiller, Ph.D., CEO di Pacific Biosciences, ha commentato: “Siamo estremamente orgogliosi di introdurre il sistema Sequel, che fornisce l’accesso ai vantaggi esistenti del sequenziamento SMRT, tra cui lunghe letture, elevata accuratezza del consenso, copertura uniforme e informazioni integrate sulla metilazione – un insieme di attributi fondamentali sperimentati per la prima volta con il PacBio RS. Il costo inferiore del sistema e l’ingombro ridotto rappresentano il nostro continuo impegno a sfruttare la scalabilità della nostra tecnologia e le caratteristiche uniche del sequenziamento SMRT.”

“Continueremo a sostenere i nostri clienti PacBio RS II, e ci aspettiamo di introdurre miglioramenti nella preparazione dei campioni, nella chimica di sequenziamento e nel software che estenderanno le prestazioni di quel sistema, come abbiamo fatto ogni anno dalla commercializzazione iniziale del PacBio RS nel 2011 e del PacBio RS II nel 2013. Ci aspettiamo di fare simili, sostanziali miglioramenti delle prestazioni ogni anno per il sistema Sequel”, ha aggiunto il dottor Hunkapiller. “Inoltre, l’architettura Sequel fornisce la capacità di scalare il rendimento variando sostanzialmente il numero di ZMW sulle future celle SMRT, ottimizzando così il rendimento e i costi operativi per applicazioni specifiche.”

In mostra al meeting annuale ASHG

Vedremo il sistema Sequel nel nostro stand (#907) al meeting annuale dell’American Society of Human Genetics che si svolgerà a Baltimora, Maryland, a partire dal 6 ottobre 2015.

A prescindere dal fatto che partecipiate o meno al meeting, potete comunque partecipare al nostro workshop, “Addressing Hidden Heritability through Long Read Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing”, mercoledì 7 ottobre, dalle 13:00 alle 14:30. L’evento sarà ospitato da Michael Hunkapiller e Jonas Korlach di Pacific Biosciences, e comprenderà interventi di Richard Gibbs del Baylor College of Medicine e Richard Wilson della Washington University di St. Chi partecipa alla conferenza di Baltimora può registrarsi qui. Offriremo anche lo streaming dal vivo e l’accesso alla registrazione.

Per maggiori informazioni sul sistema Sequel, vai su pacb.com/sequel.