Meddagen den 30 september 2015
Vi är glada att kunna presentera vår nyaste sekvenserare för enstaka molekyler i realtid, Sequel™ System. Titta på den här korta videon för att lära dig mer om denna spännande utveckling inom SMRT®-sekvensering.
Sequel System ger högre genomströmning, större skalbarhet, mindre fotavtryck och lägre kostnader för sekvenseringsprojekt jämfört med PacBio® RS II System, samtidigt som fördelarna med SMRT-teknologin bibehålls. Kärnan i Sequel-systemet är kapaciteten hos dess omdesignade SMRT-celler, som vid lanseringen innehåller en miljon Zero Mode Waveguides (ZMWs), jämfört med 150 000 ZMWs i PacBio RS II. Aktiva enskilda polymeraser är immobiliserade i ZMW:erna, vilket ger fönster för att observera och registrera DNA-sekvensering i realtid.
Med ungefär sju gånger så många läsningar per SMRT-cell som PacBio RS II bör kunderna kunna realisera lägre kostnader och kortare tidsramar för sekvenseringsprojekt, med ungefär hälften av den initiala kapitalinvesteringen jämfört med tidigare teknik. Sequel-systemet har ett mindre fotavtryck – mindre än en tredjedel av storlek och vikt – jämfört med PacBio RS II. Eftersom det nya systemet bygger på företagets etablerade SMRT-teknik är de flesta aspekter av arbetsflödet för sekvensering oförändrade.
Sequel-systemet är idealiskt för projekt som att snabbt och kostnadseffektivt generera högkvalitativa de novo-sammansättningar av hela genomet av hög kvalitet för större genomer, t.ex. människor, växter och djur. Det kan ge karaktärisering av en mängd olika typer av genomiska variationer, inklusive de i komplexa regioner som inte är tillgängliga med short-read- eller syntetisk sekvenseringsteknik med lång räckvidd, samtidigt som det avslöjar epigenetisk information. Systemet kan också användas för att generera data för transkriptom i full längd och riktade transkript med hjälp av företagets IsoSeq™-protokoll. Sequel-systemets ökade genomströmning bör också underlätta tillämpningar av SMRT-teknologin inom metagenomik och riktade gentillämpningar för vilka det är viktigt att förhöra ett större antal enskilda DNA-molekyler.
I dagens pressmeddelande kommenterade Michael Hunkapiller, Ph.D., VD för Pacific Biosciences, följande: ”Vi är mycket stolta över att kunna presentera Sequel-systemet, som ger tillgång till de befintliga fördelarna med SMRT-sekvensering, inklusive långa läsningar, hög konsensusnoggrannhet, enhetlig täckning och integrerad metyleringsinformation – en uppsättning kärnegenskaper som först lanserades med PacBio RS. Systemets lägre kostnad och mindre fotavtryck representerar vårt fortsatta engagemang för att utnyttja skalbarheten hos vår teknik och de unika egenskaperna hos SMRT-sekvensering.”
”Vi kommer att fortsätta att stödja våra PacBio RS II-kunder, och vi förväntar oss att introducera förbättringar i provpreparering, sekvenseringskemi och mjukvara som kommer att utöka det systemets prestanda, vilket vi har gjort varje år sedan den första kommersialiseringen av PacBio RS 2011 och PacBio RS II 2013. Vi förväntar oss att göra liknande, betydande prestandaförbättringar varje år för Sequel-systemet”, tillade Dr Hunkapiller. ”Dessutom ger Sequel-arkitekturen möjlighet att skala genomströmningen genom att väsentligt variera antalet ZMWs på framtida SMRT-celler, vilket optimerar genomströmningen och driftskostnaderna för specifika tillämpningar.”
På displayen vid ASHG:s årsmöte
Vi kommer att visa upp Sequel-systemet i vår monter (#907) vid American Society of Human Genetics årsmöte som äger rum i Baltimore, Maryland, med början den 6 oktober 2015.
Oavsett om du deltar i mötet eller inte kan du fortfarande delta i vårt seminarium ”Addressing Hidden Heritability through Long Read Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing” onsdagen den 7 oktober från kl. 13.00 till 14.30. Värdar för evenemanget är Michael Hunkapiller och Jonas Korlach från Pacific Biosciences, och det kommer att innehålla föredrag av Richard Gibbs från Baylor College of Medicine och Richard Wilson från Washington University i St. Louis. De som deltar i konferensen i Baltimore kan registrera sig här. Vi kommer också att erbjuda direktsändning och tillgång till inspelningen.
För mer information om Sequel-systemet, gå till pacb.com/sequel.