Indianerna i Amerika skapade en mängd olika jordbrukssystem som lämpade sig för många olika miljöer, från södra Kanada till södra Sydamerika och från höga höjder i Anderna till Amazonflodens lågland. Jordbruket uppstod oberoende av varandra i minst tre regioner: Sydamerika, Mesoamerika och östra Nordamerika. Även om Amerika hade flera inhemska djurarter som domesticerades var ingen av dem av lämplig storlek eller temperament för att användas som dragdjur; därför var plogen och annan teknik som var beroende av tung dragkraft okänd.

Swidden production, även känd som slash-and-burn-jordbruk, praktiserades från det tempererade östra Nordamerika till de tropiska lågländerna i Sydamerika. Fältets bördighet i swidden-system berodde på att träd och buskar brändes för att tillföra näringsämnen till marken. Sådana system hade en hög ekologisk mångfald, vilket gav en rad olika resurser och förlängde användbarheten av vad som annars skulle ha varit kortlivade åkrar och trädgårdar. Bosättningarna flyttades när produktiviteten minskade avsevärt och tillgången på ved var låg.

Komplexa samhällen som Maya och Aztekerna använde sig i viss utsträckning av swidden-jordbruk, men det krävdes utarbetade bevattningssystem och tekniker för förvaltning av tropiska ekosystem för att försörja deras täta befolkningar. I Peru byggde inkafolket terrasserade fält på de branta andinska sluttningarna. Man använde fotplogar och hackor för att förbereda dessa fält. Lama- och alpackadynga samt mänskligt avfall användes som gödningsmedel. Sådana fält var dock inte begränsade till inkafolket; terrasserade fält byggdes även i norra Mexiko.

Majs, eller majs (Zea mays), var den mest använda grödan i Amerika och odlades nästan överallt där det fanns matproduktion. Andra grödor hade en mer begränsad spridning. Viktiga kultingarter som är inhemska i Amerika var potatis, squash, amarant (Amaranthus species), avokado (Persea americana), vanlig böna (Phaseolus vulgaris), scharlakansröd bönan (Phaseolus coccineus), teparybönan (Phaseolus acutifolius), limaböna (Phaseolus lunatus), kakao (Theobroma cacao), koka (Erythroxylon coca), maniok (kassava; Manihot esculenta), papaya (Carica candicans), jordnötter (Arachis hypogea), quinoa (Chenopodium quinoa), huazontle (Chenopodium nutalliae), peppar (Capsicum species), två typer av bomull (Gossypium hirsutum och G. barbadense), ananas (Ananus comosus), tomat (Solanum lycopersicum), tobak (Nicotiana species), sötpotatis (Ipomea batatus) och solros (Helianthus annuus). Djur som domesticerades i Amerika var alpacka (Lama pacos), lama (Lama glama), kavi eller marsvin (Cavia porcellus), myskand (Cairina moschata) och kalkon (Meleagris gallopavo).

De tidigaste beläggen för grödor finns mellan 9000 och 8000 bp i Mexiko och Sydamerika. De första grödorna i östra Nordamerika kan vara nästan lika gamla, men betydande bevis för användning av grödor där börjar mellan 5000 och 4000 bp. Majs, den gröda som så småningom dominerade de flesta jordbrukssystem i Nya världen, dyker upp ganska plötsligt i Mexiko mellan 6300 och 6000 bp, men var uppenbarligen domesticerad tidigare än så. Ursprungsbefolkningen i Amerika domesticerade färre djurarter än sina motsvarigheter i den gamla världen, till stor del på grund av att Amerika var hemvist för färre flocklevande arter av lämplig storlek och temperament. Betydande byar byggdes först efter det att de flesta grödor hade utvecklats; detta står i kontrast till den gamla världens praxis, där bosatta byar och städer tycks ha utvecklats tidigare än, eller samtidigt med, jordbruket.