Miercuri, 30 septembrie 2015

Suntem încântați să anunțăm cel mai nou secvențiator Single Molecule, în timp real, Sequel™ System. Urmăriți acest scurt videoclip pentru a afla mai multe despre această evoluție interesantă în secvențierea SMRT®.

Sistemul Sequel oferă un debit mai mare, mai multă scalabilitate, o amprentă redusă și costuri mai mici pentru proiectele de secvențiere în comparație cu sistemul PacBio® RS II, păstrând în același timp beneficiile tehnologiei SMRT. Elementul central al sistemului Sequel este capacitatea celulelor sale SMRT reproiectate, care conțin un milion de ghiduri de undă în mod zero (ZMW) la lansare, față de 150.000 de ZMW în PacBio RS II. Polimerazele individuale active sunt imobilizate în cadrul ZMW-urilor, oferind ferestre pentru a observa și înregistra secvențierea ADN-ului în timp real.

Cu aproximativ de șapte ori mai multe citiri per celulă SMRT decât PacBio RS II, clienții ar trebui să poată realiza costuri mai mici și termene mai scurte pentru proiectele de secvențiere, cu aproximativ jumătate din investiția inițială de capital, în comparație cu tehnologia anterioară. Sistemul Sequel ocupă o amprentă mai mică – mai puțin de o treime din dimensiune și greutate – în comparație cu PacBio RS II. Deoarece noul sistem este construit pe baza tehnologiei SMRT consacrate a companiei, majoritatea aspectelor fluxului de lucru de secvențiere rămân neschimbate.

Sistemul Sequel este ideal pentru proiecte cum ar fi generarea rapidă și eficientă din punct de vedere al costurilor a unor ansambluri de novo de genom întreg de înaltă calitate pentru genomuri mai mari, cum ar fi cele umane, vegetale și animale. Acesta poate asigura caracterizarea unei mari varietăți de tipuri de variații genomice, inclusiv a celor din regiuni complexe care nu sunt accesibile cu tehnologiile de secvențiere cu citire scurtă sau sintetică cu rază lungă de acțiune, dezvăluind în același timp informații epigenetice. Sistemul poate fi, de asemenea, utilizat pentru a genera date pentru transcriptome de lungime completă și transcripții țintite utilizând protocolul IsoSeq™ al companiei. Productivitatea crescută a sistemului Sequel ar trebui, de asemenea, să faciliteze aplicațiile tehnologiei SMRT în metagenomică și în aplicațiile de gene țintite pentru care interogarea unui număr mai mare de molecule individuale de ADN este importantă.

În comunicatul de presă de astăzi, Michael Hunkapiller, Ph.D., CEO al Pacific Biosciences, a comentat: „În cadrul comunicatului de presă de astăzi, Michael Hunkapiller, Ph.D., CEO al Pacific Biosciences, a declarat:: „Suntem extrem de mândri să introducem sistemul Sequel, care oferă acces la beneficiile existente ale secvențierii SMRT, inclusiv citirile lungi, precizia ridicată a consensului, acoperirea uniformă și informațiile integrate despre metilare – un set de atribute de bază introduse pentru prima dată cu PacBio RS. Costul mai mic al sistemului și amprenta mai mică reprezintă angajamentul nostru continuu de a valorifica scalabilitatea tehnologiei noastre și caracteristicile unice ale secvențierea SMRT.”

„Vom continua să sprijinim clienții noștri PacBio RS II și ne așteptăm să introducem îmbunătățiri în ceea ce privește pregătirea probelor, chimia de secvențiere și software-ul care vor extinde performanța acestui sistem, așa cum am făcut în fiecare an de la comercializarea inițială a PacBio RS în 2011 și a PacBio RS II în 2013. Ne așteptăm să facem îmbunătățiri similare și substanțiale ale performanței în fiecare an pentru sistemul Sequel”, a adăugat Dr. Hunkapiller. „În plus, arhitectura Sequel oferă capacitatea de a scala debitul prin variația substanțială a numărului de ZMW-uri pe viitoarele celule SMRT, optimizând astfel debitul și costurile de operare pentru aplicații specifice.”

Expusă la întâlnirea anuală ASHG

Vom prezenta Sistemul Sequel în standul nostru (#907) la întâlnirea anuală a Societății Americane de Genetică Umană care va avea loc în Baltimore, Maryland, începând cu 6 octombrie 2015.

Dacă participați sau nu la întâlnire, puteți participa în continuare la atelierul nostru, „Addressing Hidden Heritability through Long Read Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing”, miercuri, 7 octombrie, între orele 13:00 și 14:30. Evenimentul va fi găzduit de Michael Hunkapiller și Jonas Korlach de la Pacific Biosciences și va include discuții susținute de Richard Gibbs de la Baylor College of Medicine și Richard Wilson de la Washington University in St. Louis. Cei care participă la conferința din Baltimore se pot înscrie aici. De asemenea, vom oferi streaming live și acces la înregistrare.

Pentru mai multe informații despre sistemul Sequel, accesați pacb.com/sequel.

.