Presentación del sistema Sequel: La plataforma escalable para la secuenciación SMRT

Miércoles, 30 de septiembre de 2015

Nos complace anunciar nuestro más reciente secuenciador de molécula única en tiempo real, el Sequel™ System. Vea este breve vídeo para conocer esta emocionante evolución en la secuenciación SMRT®.

El sistema Sequel proporciona un mayor rendimiento, más escalabilidad, una huella reducida y menores costes de proyecto de secuenciación en comparación con el sistema PacBio® RS II, al tiempo que mantiene las ventajas de la tecnología SMRT. El núcleo del sistema Sequel es la capacidad de sus celdas SMRT rediseñadas, que contienen un millón de guías de onda de modo cero (ZMW) en su lanzamiento, en comparación con las 150.000 ZMW del PacBio RS II. Las polimerasas individuales activas están inmovilizadas dentro de las ZMW, lo que proporciona ventanas para observar y registrar la secuenciación del ADN en tiempo real.

Con unas siete veces más lecturas por SMRT Cell que el PacBio RS II, los clientes deberían ser capaces de obtener costes más bajos y plazos más cortos para los proyectos de secuenciación, con aproximadamente la mitad de la inversión de capital inicial en comparación con la tecnología anterior. El sistema Sequel ocupa un espacio más reducido -menos de un tercio de su tamaño y peso- en comparación con el PacBio RS II. Dado que el nuevo sistema se basa en la tecnología SMRT establecida por la empresa, la mayoría de los aspectos del flujo de trabajo de secuenciación no cambian.

El sistema Sequel es ideal para proyectos tales como la generación rápida y rentable de ensamblajes de novo de genoma completo de alta calidad para genomas más grandes, como el humano, el vegetal y el animal. Puede proporcionar la caracterización de una amplia variedad de tipos de variaciones genómicas, incluidas las de regiones complejas a las que no se puede acceder con tecnologías de secuenciación de corto alcance o de largo alcance sintético, al tiempo que revela información epigenética. El sistema también puede utilizarse para generar datos de transcriptomas de longitud completa y transcripciones dirigidas utilizando el protocolo IsoSeq™ de la compañía. El mayor rendimiento del sistema Sequel también debería facilitar las aplicaciones de la tecnología SMRT en metagenómica y en aplicaciones de genes dirigidos para las que es importante la interrogación de un mayor número de moléculas de ADN individuales.

En el comunicado de prensa de hoy, el doctor Michael Hunkapiller, director general de Pacific Biosciences, comentó: «Estamos muy orgullosos de presentar el sistema Sequel, que proporciona acceso a las ventajas existentes de la secuenciación SMRT, incluidas las lecturas largas, la alta precisión del consenso, la cobertura uniforme y la información de metilación integrada, un conjunto de atributos fundamentales que se introdujeron por primera vez con el PacBio RS. El menor coste y el menor tamaño del sistema representan nuestro compromiso continuo de aprovechar la escalabilidad de nuestra tecnología y las características únicas de la secuenciación SMRT.»

«Seguiremos apoyando a nuestros clientes de PacBio RS II, y esperamos introducir mejoras en la preparación de muestras, la química de secuenciación y el software que ampliarán el rendimiento de ese sistema, como hemos hecho cada año desde la comercialización inicial de PacBio RS en 2011 y de PacBio RS II en 2013. Esperamos realizar mejoras de rendimiento similares y sustanciales cada año para el sistema Sequel», añadió el Dr. Hunkapiller. «Además, la arquitectura de Sequel proporciona la capacidad de escalar el rendimiento variando sustancialmente el número de ZMW en las futuras células SMRT, optimizando así el rendimiento y los costes de funcionamiento para aplicaciones específicas.»

En exhibición en la reunión anual de la ASHG

Mostraremos el sistema Sequel en nuestro stand (#907) en la reunión anual de la Sociedad Americana de Genética Humana que tendrá lugar en Baltimore, Maryland, a partir del 6 de octubre de 2015.

Tanto si asiste a la reunión como si no, puede asistir a nuestro taller, «Addressing Hidden Heritability through Long Read Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing», el miércoles 7 de octubre, de 1:00 a 2:30 p.m. El evento será presentado por Michael Hunkapiller y Jonas Korlach de Pacific Biosciences, e incluirá charlas de Richard Gibbs del Baylor College of Medicine y Richard Wilson de la Universidad de Washington en St. Los asistentes a la conferencia de Baltimore pueden inscribirse aquí. También ofreceremos la transmisión en directo y el acceso a la grabación.

Para más información sobre el sistema Sequel, visite pacb.com/sequel.