Wednesday, September 30, 2015

Jesteśmy podekscytowani mogąc ogłosić nasz najnowszy sekwenator Single Molecule, Real-Time, Sequel™ System. Obejrzyj ten krótki film, aby dowiedzieć się o tej ekscytującej ewolucji w sekwencjonowaniu SMRT®.

System Sequel zapewnia wyższą przepustowość, większą skalowalność, mniejszą powierzchnię i niższe koszty projektu sekwencjonowania w porównaniu z systemem PacBio® RS II, przy jednoczesnym zachowaniu zalet technologii SMRT. Istotą systemu Sequel jest pojemność przeprojektowanych komórek SMRT, które zawierają milion falowodów o zerowym trybie pracy (ZMW) w porównaniu do 150 000 ZMW w systemie PacBio RS II. Aktywne pojedyncze polimerazy są unieruchomione wewnątrz ZMW, zapewniając okna do obserwowania i rejestrowania sekwencjonowania DNA w czasie rzeczywistym.

Przy około siedmiokrotnie większej liczbie odczytów na komórkę SMRT Cell niż w przypadku PacBio RS II, klienci powinni być w stanie zrealizować niższe koszty i krótsze terminy projektów sekwencjonowania, przy około połowie początkowych inwestycji kapitałowych w porównaniu z poprzednią technologią. System Sequel zajmuje mniejszą powierzchnię – mniej niż jedną trzecią wielkości i wagi – w porównaniu z PacBio RS II. Ponieważ nowy system jest zbudowany w oparciu o uznaną technologię SMRT, większość aspektów procesu sekwencjonowania pozostaje niezmieniona.

System Sequel jest idealny do takich projektów, jak szybkie i efektywne kosztowo generowanie wysokiej jakości całych genomów de novo dla większych genomów, takich jak ludzki, roślinny i zwierzęcy. Może on zapewnić charakterystykę szerokiej gamy zmian genomowych, w tym tych w złożonych regionach niedostępnych przy użyciu technologii sekwencjonowania krótkich odczytów lub syntetycznych sekwencji dalekiego zasięgu, jednocześnie ujawniając informacje epigenetyczne. System może być również wykorzystywany do generowania danych dla transkryptomów o pełnej długości oraz transkryptomów ukierunkowanych przy użyciu firmowego protokołu IsoSeq™. Zwiększona przepustowość systemu Sequel powinna również ułatwić zastosowania technologii SMRT w metagenomice i aplikacjach genów ukierunkowanych, dla których ważne jest przesłuchiwanie większej liczby pojedynczych cząsteczek DNA.

W dzisiejszej informacji prasowej Michael Hunkapiller, Ph.D., CEO Pacific Biosciences, skomentował: „Jesteśmy niezwykle dumni z wprowadzenia systemu Sequel, który zapewnia dostęp do dotychczasowych korzyści z sekwencjonowania SMRT, w tym długich odczytów, wysokiej dokładności konsensusu, jednolitego pokrycia i zintegrowanej informacji o metylacji – zestawu podstawowych atrybutów po raz pierwszy wprowadzonych pioniersko z PacBio RS. Niższy koszt systemu i mniejsza powierzchnia reprezentują nasze stałe zaangażowanie w wykorzystanie skalowalności naszej technologii i unikalnych cech sekwencjonowania SMRT.”

„Będziemy nadal wspierać naszych klientów PacBio RS II i oczekujemy wprowadzenia ulepszeń w przygotowaniu próbek, chemii sekwencjonowania i oprogramowaniu, które zwiększą wydajność tego systemu, tak jak robiliśmy to każdego roku od początkowej komercjalizacji PacBio RS w 2011 roku i PacBio RS II w 2013 roku. Spodziewamy się, że co roku będziemy dokonywać podobnych, znaczących ulepszeń wydajności w przypadku systemu Sequel” – dodał dr Hunkapiller. „Ponadto, architektura Sequel zapewnia możliwość skalowania przepustowości poprzez znaczne zróżnicowanie liczby ZMW na przyszłych komórkach SMRT, optymalizując w ten sposób przepustowość i koszty operacyjne dla konkretnych zastosowań.”

On Display at the ASHG Annual Meeting

Pokażemy System Sequel na naszym stoisku (#907) na corocznym spotkaniu American Society of Human Genetics odbywającym się w Baltimore, Maryland, rozpoczynającym się 6 października 2015 roku.

Czy bierzesz udział w spotkaniu, czy nie, nadal możesz wziąć udział w naszych warsztatach, „Addressing Hidden Heritability through Long Read Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing”, w środę, 7 października, w godzinach 13:00-2:30. Wydarzenie będzie prowadzone przez Michaela Hunkapillera i Jonasa Korlacha z Pacific Biosciences i będzie obejmować prelekcje Richarda Gibbsa z Baylor College of Medicine i Richarda Wilsona z Washington University w St. Louis. Osoby biorące udział w konferencji w Baltimore mogą zarejestrować się tutaj. Będziemy również oferować transmisję na żywo i dostęp do nagrania.

Więcej informacji na temat systemu Sequel można znaleźć na stronie pacb.com/sequel.

.