2015. szeptember 30., szerda

Nagy örömmel jelentjük be legújabb Single Molecule, Real-Time sequencerünket, a Sequel™ Systemet. Nézze meg ezt a rövid videót, hogy megismerje az SMRT® szekvenálás ezen izgalmas evolúcióját.

A Sequel rendszer a PacBio® RS II rendszerhez képest nagyobb áteresztőképességet, nagyobb skálázhatóságot, kisebb alapterületet és alacsonyabb szekvenálási projektköltségeket biztosít, miközben megtartja az SMRT technológia előnyeit. A Sequel rendszer lényege az újratervezett SMRT-cellák kapacitása, amelyek induláskor egymillió null-módú hullámvezetőt (ZMW) tartalmaznak, szemben a PacBio RS II 150 000 ZMW-jával. Az aktív egyedi polimerázok a ZMW-ken belül immobilizálódnak, ablakokat biztosítva a DNS-szekvenálás valós idejű megfigyelésére és rögzítésére.

Mivel az SMRT Cellenként körülbelül hétszer annyi leolvasás érhető el, mint a PacBio RS II esetében, az ügyfeleknek alacsonyabb költségeket és rövidebb határidőket kell realizálniuk a szekvenálási projekteknél, a korábbi technológiához képest körülbelül feleakkora kezdeti tőkebefektetéssel. A Sequel System a PacBio RS II-hez képest kisebb alapterületet foglal el – kevesebb mint egyharmad akkora és súlyú – mint a PacBio RS II. Mivel az új rendszer a vállalat bevált SMRT technológiájára épül, a szekvenálási munkafolyamat legtöbb aspektusa változatlan.

A Sequel System ideális az olyan projektekhez, mint például a nagyobb genomok, például az emberi, növényi és állati genomok gyors és költséghatékony, kiváló minőségű, teljes genom de novo összeállításainak előállítása. A genomi variációtípusok széles skálájának jellemzésére alkalmas, beleértve a rövid leolvasású vagy szintetikus hosszú szekvenálási technológiákkal nem hozzáférhető komplex régiókban található variációkat is, miközben egyidejűleg epigenetikai információkat tár fel. A rendszer a teljes hosszúságú transzkriptomok és célzott transzkriptumok adatainak előállítására is használható a vállalat IsoSeq™ protokollja segítségével. A Sequel System megnövelt áteresztőképessége megkönnyíti az SMRT technológia alkalmazását a metagenomikai és célzott génalkalmazásokban is, amelyeknél fontos a nagyobb számú egyedi DNS-molekula lekérdezése.

A mai sajtóközleményben Michael Hunkapiller, Ph.D., a Pacific Biosciences vezérigazgatója így nyilatkozott: “Rendkívül büszkék vagyunk a Sequel rendszer bevezetésére, amely hozzáférést biztosít az SMRT szekvenálás meglévő előnyeihez, beleértve a hosszú leolvasásokat, a nagy konszenzus pontosságot, az egységes lefedettséget és az integrált metilációs információkat – az alapvető tulajdonságok egy sorát, amelyeket először a PacBio RS-sel vezettek be. A rendszer alacsonyabb költsége és kisebb alapterülete továbbra is a technológiánk skálázhatóságának és az SMRT szekvenálás egyedi jellemzőinek kihasználása iránti elkötelezettségünket képviseli.”

“Továbbra is támogatni fogjuk a PacBio RS II ügyfeleinket, és várhatóan olyan fejlesztéseket vezetünk be a mintaelőkészítés, a szekvenálási kémia és a szoftver terén, amelyek növelik a rendszer teljesítményét, ahogyan azt a PacBio RS 2011-es és a PacBio RS II 2013-as kezdeti forgalmazása óta minden évben megtettük. A Sequel rendszer esetében is hasonló, jelentős teljesítményjavulásra számítunk minden évben” – tette hozzá Dr. Hunkapiller. “Ezen túlmenően a Sequel architektúra lehetővé teszi az áteresztőképesség skálázását a ZMW-k számának jelentős változtatásával a jövőbeli SMRT-cellákon, ezáltal optimalizálva az áteresztőképességet és a működési költségeket az egyes alkalmazásokhoz.”

Az ASHG éves találkozón

A Sequel rendszert a standunkon (#907) mutatjuk be az Amerikai Humángenetikai Társaság éves találkozóján, amely 2015. október 6-án kezdődik a marylandi Baltimore-ban.

Ha részt vesz a találkozón, akkor is részt vehet a “Addressing Hidden Heritability through Long Read Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing” című workshopunkon október 7-én, szerdán 13:00-14:30 között. Az esemény házigazdái Michael Hunkapiller és Jonas Korlach a Pacific Biosciences-től, és előadást tart Richard Gibbs a Baylor College of Medicine-től és Richard Wilson a St. Louis-i Washington University-től. A baltimore-i konferencián résztvevők itt regisztrálhatnak. Élő közvetítést és hozzáférést biztosítunk a felvételhez is.

A Sequel rendszerrel kapcsolatos további információkért látogasson el a pacb.com/sequel.

weboldalra.