Mercredi 30 septembre 2015
Nous sommes ravis d’annoncer notre tout nouveau séquenceur mono-moléculaire en temps réel, le Sequel™ System. Regardez cette courte vidéo pour en savoir plus sur cette évolution passionnante du séquençage SMRT®.
Le système Sequel offre un débit plus élevé, une plus grande évolutivité, une empreinte réduite et des coûts de projet de séquençage plus faibles par rapport au système PacBio® RS II, tout en conservant les avantages de la technologie SMRT. Le cœur du système Sequel est la capacité de ses cellules SMRT redessinées, qui contiennent un million de guides d’ondes à mode zéro (ZMW) au lancement, contre 150 000 ZMW dans le PacBio RS II. Les polymérases individuelles actives sont immobilisées dans les ZMW, offrant des fenêtres pour observer et enregistrer le séquençage de l’ADN en temps réel.
Avec environ sept fois plus de lectures par cellule SMRT que le PacBio RS II, les clients devraient être en mesure de réaliser des coûts inférieurs et des délais plus courts pour les projets de séquençage, avec environ la moitié de l’investissement initial en capital par rapport à la technologie précédente. Le Sequel System occupe un espace plus réduit – moins d’un tiers de la taille et du poids – par rapport au PacBio RS II. Comme le nouveau système est construit sur la technologie SMRT établie de la société, la plupart des aspects du flux de travail de séquençage sont inchangés.
Le système Sequel est idéal pour des projets tels que la génération rapide et rentable d’assemblages de novo de génomes entiers de haute qualité pour des génomes plus grands, tels que les humains, les plantes et les animaux. Il peut fournir la caractérisation d’une grande variété de types de variations génomiques, y compris celles situées dans des régions complexes non accessibles avec les technologies de séquençage à lecture courte ou synthétique à longue portée, tout en révélant simultanément des informations épigénétiques. Le système peut également être utilisé pour générer des données sur les transcriptomes complets et les transcriptions ciblées à l’aide du protocole IsoSeq™ de la société. Le débit accru du système Sequel devrait également faciliter les applications de la technologie SMRT dans les applications de métagénomique et de gènes ciblés pour lesquelles l’interrogation d’un plus grand nombre de molécules d’ADN individuelles est importante.
Dans le communiqué de presse d’aujourd’hui, Michael Hunkapiller, Ph.D., PDG de Pacific Biosciences, a commenté : « Nous sommes extrêmement fiers de présenter le système Sequel, qui donne accès aux avantages existants du séquençage SMRT, notamment les longues lectures, la précision élevée du consensus, la couverture uniforme et les informations intégrées sur la méthylation – un ensemble d’attributs fondamentaux dont le PacBio RS a été le premier pionnier. Le coût inférieur et l’empreinte plus petite du système représentent notre engagement continu à tirer parti de l’évolutivité de notre technologie et des caractéristiques uniques du séquençage SMRT. »
« Nous continuerons à soutenir nos clients PacBio RS II, et nous prévoyons d’introduire des améliorations dans la préparation des échantillons, la chimie de séquençage et les logiciels qui étendront les performances de ce système, comme nous l’avons fait chaque année depuis la commercialisation initiale du PacBio RS en 2011 et du PacBio RS II en 2013. Nous prévoyons d’apporter des améliorations de performance similaires et substantielles chaque année pour le système Sequel « , a ajouté le Dr Hunkapiller. « En outre, l’architecture Sequel offre la possibilité de faire évoluer le débit en faisant varier substantiellement le nombre de ZMW sur les futures cellules SMRT, optimisant ainsi le débit et les coûts d’exploitation pour des applications spécifiques. »
En exposition lors de la réunion annuelle de l’ASHG
Nous présenterons le système Sequel sur notre stand (#907) lors de la réunion annuelle de l’American Society of Human Genetics qui se déroule à Baltimore, Maryland, à partir du 6 octobre 2015.
Que vous assistiez ou non à la réunion, vous pouvez toujours assister à notre atelier, » Addressing Hidden Heritability through Long Read Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing « , le mercredi 7 octobre, de 13 h à 14 h 30. L’événement sera animé par Michael Hunkapiller et Jonas Korlach de Pacific Biosciences, et comprendra des exposés de Richard Gibbs du Baylor College of Medicine et de Richard Wilson de l’Université Washington de St. Louis. Les personnes qui assisteront à la conférence de Baltimore peuvent s’inscrire ici. Nous proposerons également un streaming en direct et un accès à l’enregistrement.
Pour plus d’informations sur le système Sequel, rendez-vous sur pacb.com/sequel.
.