Mittwoch, 30. September 2015
Wir freuen uns, unseren neuesten Einzelmolekül-Echtzeit-Sequenzierer, das Sequel™ System, vorzustellen. Schauen Sie sich dieses kurze Video an, um mehr über diese aufregende Entwicklung in der SMRT®-Sequenzierung zu erfahren.
Das Sequel System bietet im Vergleich zum PacBio® RS II System einen höheren Durchsatz, mehr Skalierbarkeit, einen geringeren Platzbedarf und niedrigere Kosten für Sequenzierungsprojekte, wobei die Vorteile der SMRT-Technologie erhalten bleiben. Das Herzstück des Sequel-Systems ist die Kapazität der neu gestalteten SMRT-Zellen, die bei der Markteinführung eine Million Zero-Mode-Waveguides (ZMWs) enthalten, verglichen mit 150.000 ZMWs im PacBio RS II. Aktive einzelne Polymerasen sind innerhalb der ZMWs immobilisiert und bieten Fenster, um die DNA-Sequenzierung in Echtzeit zu beobachten und aufzuzeichnen.
Mit etwa siebenmal so vielen Reads pro SMRT Cell wie beim PacBio RS II sollten Kunden in der Lage sein, niedrigere Kosten und kürzere Zeiträume für Sequenzierungsprojekte zu realisieren, und zwar mit etwa der Hälfte der Vorab-Investitionen im Vergleich zur vorherigen Technologie. Das Sequel System benötigt weniger Platz – weniger als ein Drittel der Größe und des Gewichts – im Vergleich zum PacBio RS II. Da das neue System auf der bewährten SMRT-Technologie des Unternehmens aufbaut, bleiben die meisten Aspekte des Sequenzier-Workflows unverändert.
Das Sequel System eignet sich ideal für Projekte wie die schnelle und kostengünstige Generierung von qualitativ hochwertigen De-novo-Ganzgenom-Assemblies für größere Genome wie das von Menschen, Pflanzen und Tieren. Es ermöglicht die Charakterisierung einer Vielzahl von genomischen Variationen, einschließlich solcher in komplexen Regionen, die mit Short-Read- oder synthetischen Long-Range-Sequenzierungstechnologien nicht zugänglich sind, und deckt gleichzeitig epigenetische Informationen auf. Das System kann auch zur Generierung von Daten für Transkriptome in voller Länge und gezielte Transkripte unter Verwendung des IsoSeq™-Protokolls des Unternehmens verwendet werden. Der erhöhte Durchsatz des Sequel-Systems dürfte auch die Anwendung der SMRT-Technologie in der Metagenomik und bei gezielten Genanwendungen erleichtern, bei denen die Abfrage einer größeren Anzahl einzelner DNA-Moleküle wichtig ist.
In der heutigen Pressemitteilung kommentierte Michael Hunkapiller, Ph.D., CEO von Pacific Biosciences, Folgendes: „Wir sind sehr stolz darauf, das Sequel-System einzuführen, das die bestehenden Vorteile der SMRT-Sequenzierung, einschließlich langer Reads, hoher Konsensgenauigkeit, einheitlicher Abdeckung und integrierter Methylierungsinformationen, zugänglich macht – eine Reihe von Kerneigenschaften, die erstmals mit dem PacBio RS eingeführt wurden.
„Wir werden unsere PacBio RS II-Kunden weiterhin unterstützen und erwarten, dass wir Verbesserungen bei der Probenvorbereitung, der Sequenzierungschemie und der Software einführen werden, die die Leistung des Systems steigern werden, wie wir es jedes Jahr seit der ersten Vermarktung des PacBio RS im Jahr 2011 und des PacBio RS II im Jahr 2013 getan haben. Wir gehen davon aus, dass wir jedes Jahr ähnliche, erhebliche Leistungsverbesserungen für das Sequel-System vornehmen werden“, fügte Dr. Hunkapiller hinzu. „Darüber hinaus bietet die Sequel-Architektur die Möglichkeit, den Durchsatz zu skalieren, indem die Anzahl der ZMWs auf zukünftigen SMRT-Zellen erheblich variiert wird, wodurch der Durchsatz und die Betriebskosten für bestimmte Anwendungen optimiert werden.“
Auf der ASHG-Jahrestagung ausgestellt
Wir werden das Sequel-System an unserem Stand (#907) auf der Jahrestagung der American Society of Human Genetics präsentieren, die ab dem 6. Oktober 2015 in Baltimore, Maryland, stattfindet.
Auch wenn Sie nicht an der Tagung teilnehmen, können Sie unseren Workshop „Addressing Hidden Heritability through Long Read Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing“ am Mittwoch, den 7. Oktober, von 13:00 bis 14:30 Uhr besuchen. Die Veranstaltung wird von Michael Hunkapiller und Jonas Korlach von Pacific Biosciences geleitet und umfasst Vorträge von Richard Gibbs vom Baylor College of Medicine und Richard Wilson von der Washington University in St. Louis. Wer an der Konferenz in Baltimore teilnehmen möchte, kann sich hier anmelden. Wir werden auch Live-Streaming und Zugang zur Aufzeichnung anbieten.
Weitere Informationen über das Sequel-System finden Sie unter pacb.com/sequel.