Marokko indtager en 105. plads i 2012 Environmental Performance Index, en rangliste over 132 lande, som er udarbejdet af Yale University på grundlag af miljømæssig folkesundhed og økosystemets vitalitet. Det placerer landet blandt nogle af de dårligst præsterende lande internationalt og blandt de arabiske stater: Algeriet, Libanon og Tunesien, der er i samme gruppe, har alle bedre resultater, og den næsthøjeste gruppe (“beskedne præsterende lande”) omfatter Egypten, Israel, De Forenede Arabiske Emirater og Saudi-Arabien. Kort sagt, Marokkos resultater er dårlige. Omkostningerne ved forurening i Marokko er høje: UNDP rapporterede i 2011, at miljøforringelse koster det, der svarer til 3,7 % af BNP, og dette har særligt alvorlige konsekvenser for befolkningen i de mest skrøbelige regioner.

Mangel på rent vand

Mens 100 % af bybefolkningen blev rapporteret at have adgang til forbedret drikkevand i 2006, var tallet kun 57 % for landbefolkningen, hvilket er det laveste for nogen af de arabiske lande i Middelhavsområdet. Procentdelen af den samlede befolkning, der benytter forbedrede sanitære faciliteter, var ligeledes den laveste blandt alle de arabiske lande i Middelhavsområdet. Der er en betydelig vandforurening. Målt ved biokemisk iltforbrug (den mængde ilt, som bakterier i vandet forbruger ved nedbrydning af affald) er udledningen af organiske vandforurenende stoffer høj: 73 989 kg om dagen i 2009, hvoraf 43,5 % kom fra tekstilindustrien, efterfulgt af fødevareindustrien. (Til sammenligning producerede Syrien 80.444 og Jordan 29.147). Der er generelt mangel på vand, men nogle områder er udsat for oversvømmelser. Det engang store sæsonbestemte vådområde Merja Ras Douara, som er næsten helt forsvundet (se Biodiversitet), blev oversvømmet i november 2002, og 60 mennesker mistede livet.

Luftforurening

Miljøministeriet anslog i 2012, at virkningerne af luftforurening udgjorde 1,03 % af BNP. Marokko var et af de sidste lande til helt at forbyde salg af benzin tilsat bly, selv om denne proces var afsluttet i 2008. CO2-udledningen i 2009 var 1,5 ton pr. indbygger (til sammenligning udledte Libanon 5 ton pr. indbygger, Syrien 3,3 og Algeriet 3,5).

Affaldsbortskaffelse

I 2000 var lidt under 70 procent af det affald, der blev indsamlet i byområder, organisk (sammenlignet med 10 procent i Frankrig og 55 procent i Egypten). (Tal fra State of the Environment and Development in the Mediterranean – 2000).

For at håndtere disse og andre problemer vedtog regeringen i 2009 Charte nationale de l’environnement et du développement durable (det nationale charter for miljø og bæredygtig udvikling), som søgte at prioritere miljøforvaltning ved at skitsere generelle principper, der forbandt økonomien med et mønster for bæredygtig udvikling. Det lagde stor vægt på organisatorisk samarbejde mellem centrale regeringsmyndigheder, regionale og provinsielle regeringer og NGO’er. Den centrale regerings ansvar for miljøet hører nu under et superministerium (som også omfatter energi, vand og miner), der i øjeblikket ledes af et medlem af Istiqlal-partiet.

Ministeriet har foreslået både en storstilet og en lokal indsats for at håndtere miljøforringelsen. Med hensyn til vandproblemet er der blevet iværksat en kampagne for at bygge dæmninger og udvikle underjordiske vandforsyninger, for at rense og genbruge brugt vand, for at forbedre forvaltningen af kunstvanding, for at fremme tørkeresistente afgrøder og for at indføre strengere kontrol med vandforbruget. Forurening af landdistrikterne på grund af vandmangel og dårlig affaldshåndtering blev gjort til genstand for to omfattende lokale programmer for at forbedre vandforsyningen og de sanitære forhold, især i skoler og moskeer i landdistrikterne. Arbejdet med forurening omfatter en landsdækkende indsats for at bekæmpe brugen af plastikposer og indsamle et enormt og stærkt forurenende efterslæb (160 tons plastikposer blev destrueret i 2010) og for at rydde op i kystforurening – Mar Chica-lagunen nær Nador på Middelhavskysten er et stort projekt – og industriforurening, især i Casablanca-regionen.

Naturkatastrofer

Når ikke alle miljøtrusler er menneskeskabte. To permanente problemer er græshoppeangreb, der forårsager store skader på afgrøderne, og jordskælv.

Græshoppeangreb

Marokko ligger i den nordvestlige udkant af sommerens udvandring af græshopper, der har deres oprindelse i Tchad. Der var alvorlige græshoppeplager i 1987-1989 og 2004, da sværme invaderede det sydlige Marokko og Vestsahara efter at have krydset fra Algeriet. Ved disse lejligheder dækkede de enkelte sværme mellem 5 000 og 30 000 hektar. Mindre sværme nåede så langt mod nord som til Meknes. I 2003-2004 brugte den marokkanske regering ca. 38,8 mio. USD på foranstaltninger til bekæmpelse af græshopper, som delvis blev dækket af støtte fra Spanien, Sydkorea, Saudi-Arabien, Nederlandene, FAO og USAID. De marokkanske myndigheder leverede pesticider til Sahel-landene for at forsøge at forhindre, at sværmene spredte sig. I 2012, da en anden plage var på vej, donerede de 60 000 liter pesticider til brug i Mali og Niger.

Jordskælv

Marokko ligger i et tektonisk komplekst område med hyppige moderate til kraftige jordskælv. Disse er forbundet med konvergensen mellem Afrika og Europa, der går gennem Gibraltarstrædet. På land er der forkastninger i de tre vigtigste bjergkæder – Rif, Mellematlas og Høje Atlas – hvilket har betydet en lang historie med jordskælv i Marokko. En artikel i Seismological Research Letters (2007) indeholder en liste over jordskælv helt tilbage til 1045. Jordskælvet i Agadir (styrke 5,7) den 29. februar 1960, der kostede 12 000 mennesker livet, var det værste jordskælv, der nogensinde er registreret i Marokko. Mindst 35 000 mennesker blev hjemløse.

Det alvorligste jordskælv for nylig fandt sted i februar 2004 med epicenter i Gibraltarstrædet og en magnitude på 6,4. Det hårdest ramte område var provinsen al-Hoceima. Al-Hoceima by har 100 000 indbyggere, men de værste skader skete i de omkringliggende landsbyer, hvor lerklinkerbygninger ikke kunne modstå et større jordskælv. Regeringen anslog, at jordskælvet dræbte mindst 572 mennesker, sårede 427 andre og gjorde 13.000 hjemløse.