Monsdag, 30. september 2015
Vi er glade for at kunne præsentere vores nyeste enkeltmolekylære realtids-sekventeringsenhed, Sequel™ System. Se denne korte video for at lære mere om denne spændende udvikling inden for SMRT®-sekventering.
Sequel Systemet giver højere gennemløb, større skalerbarhed, et mindre fodaftryk og lavere omkostninger til sekventeringsprojekter sammenlignet med PacBio® RS II Systemet, samtidig med at fordelene ved SMRT-teknologien bevares. Kernen i Sequel-systemet er kapaciteten i dets redesignede SMRT-celler, som indeholder en million zero-mode waveguides (ZMW’er) ved lanceringen, sammenlignet med 150.000 ZMW’er i PacBio RS II. Aktive individuelle polymeraser er immobiliseret i ZMW’erne, hvilket giver vinduer til at observere og registrere DNA-sekventering i realtid.
Med ca. syv gange så mange læsninger pr. SMRT-celle som i PacBio RS II skulle kunderne kunne realisere lavere omkostninger og kortere tidslinjer for sekventeringsprojekter med ca. halvdelen af den indledende kapitalinvestering sammenlignet med tidligere teknologi. Sequel-systemet har et mindre fodaftryk – mindre end en tredjedel af størrelsen og vægten – sammenlignet med PacBio RS II. Da det nye system er bygget på virksomhedens etablerede SMRT-teknologi, er de fleste aspekter af sekventeringsarbejdsgangen uændret.
Sequel-systemet er ideelt til projekter som f.eks. hurtig og omkostningseffektiv generering af de novo-sammensætninger af høj kvalitet af hele genomer for større genomer, f.eks. mennesker, planter og dyr. Det kan give karakterisering af en bred vifte af genomiske variationstyper, herunder dem i komplekse regioner, der ikke er tilgængelige med short-read- eller syntetiske sekventeringsteknologier med lang rækkevidde, samtidig med at det afslører epigenetiske oplysninger. Systemet kan også bruges til at generere data for transkriptomer i fuld længde og målrettede transkriptomer ved hjælp af virksomhedens IsoSeq™-protokol. Sequel-systemets øgede gennemløb bør også lette anvendelsen af SMRT-teknologien i metagenomiske og målrettede genapplikationer, hvor det er vigtigt at afhøre et større antal individuelle DNA-molekyler.
I dagens pressemeddelelse udtalte Michael Hunkapiller, Ph.D., administrerende direktør for Pacific Biosciences, i en kommentar: “Vi er ekstremt stolte over at introducere Sequel-systemet, som giver adgang til de eksisterende fordele ved SMRT-sekventering, herunder lange læsninger, høj konsensusnøjagtighed, ensartet dækning og integrerede methyleringsoplysninger – et sæt af kerneegenskaber, som først blev introduceret med PacBio RS. Systemets lavere omkostninger og mindre fodaftryk repræsenterer vores fortsatte engagement i at udnytte vores teknologis skalerbarhed og de unikke egenskaber ved SMRT-sekventering.”
“Vi vil fortsat støtte vores PacBio RS II-kunder, og vi forventer at introducere forbedringer i prøveforberedelse, sekventeringskemi og software, der vil udvide dette systems ydeevne, som vi har gjort hvert år siden den første kommercialisering af PacBio RS i 2011 og PacBio RS II i 2013. Vi forventer at foretage lignende, væsentlige forbedringer af ydeevnen hvert år for Sequel-systemet”, tilføjede Dr. Hunkapiller. “Desuden giver Sequel-arkitekturen mulighed for at skalere gennemstrømningen ved at variere antallet af ZMW’er på fremtidige SMRT-celler betydeligt og derved optimere gennemstrømningen og driftsomkostningerne for specifikke applikationer.”
På udstilling på ASHG’s årsmøde
Vi vil fremvise Sequel-systemet på vores stand (#907) på American Society of Human Genetics årsmøde, der finder sted i Baltimore, Maryland, fra den 6. oktober 2015.
Hvad enten du deltager i mødet eller ej, kan du stadig deltage i vores workshop “Addressing Hidden Heritability through Long Read Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing” onsdag den 7. oktober fra kl. 13.00-14.30. Arrangementet vil blive afholdt af Michael Hunkapiller og Jonas Korlach fra Pacific Biosciences og indeholde foredrag af Richard Gibbs fra Baylor College of Medicine og Richard Wilson fra Washington University i St. Louis. De, der deltager i konferencen i Baltimore, kan tilmelde sig her. Vi vil også tilbyde live streaming og adgang til optagelsen.
For yderligere oplysninger om Sequel-systemet kan du gå til pacb.com/sequel.