Středa, 30. září 2015
S potěšením představujeme náš nejnovější sekvenátor pro jednu molekulu v reálném čase, Sequel™ System. Podívejte se na toto krátké video, kde se dozvíte o této vzrušující evoluci v sekvenování SMRT®
Systém Sequel poskytuje vyšší propustnost, větší škálovatelnost, menší plochu a nižší náklady na sekvenační projekt ve srovnání se systémem PacBio® RS II při zachování výhod technologie SMRT. Základem systému Sequel je kapacita jeho přepracovaných buněk SMRT, které při spuštění obsahují milion nulových vlnovodů (ZMW) ve srovnání se 150 000 ZMW v systému PacBio RS II. Jednotlivé aktivní polymerázy jsou imobilizovány uvnitř ZMW, což poskytuje okna pro pozorování a záznam sekvenování DNA v reálném čase.
S přibližně sedmkrát větším počtem čtení na buňku SMRT než u systému PacBio RS II by zákazníci měli být schopni realizovat nižší náklady a kratší lhůty pro sekvenační projekty, a to s přibližně poloviční počáteční kapitálovou investicí ve srovnání s předchozí technologií. Systém Sequel zabírá ve srovnání s PacBio RS II menší plochu – méně než třetinovou velikost a hmotnost. Vzhledem k tomu, že nový systém je postaven na zavedené technologii SMRT společnosti, většina aspektů sekvenačního pracovního postupu se nemění.
Systém Sequel je ideální pro projekty, jako je rychlé a nákladově efektivní vytváření vysoce kvalitních celogenomových sestav de novo pro větší genomy, například lidské, rostlinné a živočišné. Může poskytnout charakterizaci široké škály typů genomových variací, včetně těch ve složitých oblastech, které nejsou přístupné pomocí technologií sekvenování s krátkým čtením nebo syntetického sekvenování s dlouhým dosahem, a současně odhalit epigenetické informace. Systém lze také použít k získání dat pro transkriptomy plné délky a cílené transkripty pomocí protokolu IsoSeq™ společnosti. Zvýšená propustnost systému Sequel by také měla usnadnit použití technologie SMRT v metagenomice a aplikacích cílených genů, pro které je důležité dotazování většího počtu jednotlivých molekul DNA.
V dnešní tiskové zprávě Michael Hunkapiller, Ph.D., generální ředitel společnosti Pacific Biosciences, uvedl: „Jsme nesmírně hrdí na to, že můžeme představit systém Sequel, který poskytuje přístup ke stávajícím výhodám sekvenování SMRT, včetně dlouhých čtení, vysoké přesnosti konsenzu, rovnoměrného pokrytí a integrovaných informací o metylaci – což je soubor základních atributů, které byly poprvé použity u systému PacBio RS. Nižší cena a menší rozměry systému představují náš trvalý závazek využívat škálovatelnost naší technologie a jedinečné vlastnosti sekvenování SMRT.“
„Budeme pokračovat v podpoře našich zákazníků systému PacBio RS II a očekáváme, že zavedeme vylepšení v přípravě vzorků, sekvenační chemii a softwaru, která rozšíří výkon tohoto systému, jak jsme to dělali každý rok od počáteční komercializace systému PacBio RS v roce 2011 a systému PacBio RS II v roce 2013. Očekáváme, že u systému Sequel budeme každý rok provádět podobná podstatná zlepšení výkonu,“ dodal Dr. Hunkapiller. „Architektura Sequel navíc poskytuje možnost škálovat výkon podstatnou změnou počtu ZMW na budoucích buňkách SMRT, a tím optimalizovat výkon a provozní náklady pro konkrétní aplikace.“
Na výročním zasedání ASHG
Systém Sequel představíme v našem stánku (#907) na výročním zasedání Americké společnosti pro lidskou genetiku, které se koná v Baltimoru ve státě Maryland od 6. října 2015.
Ať už se setkání zúčastníte, nebo ne, stále se můžete zúčastnit našeho workshopu „Addressing Hidden Heritability through Long Read Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing“ ve středu 7. října od 13:00 do 14:30. Akci povedou Michael Hunkapiller a Jonas Korlach ze společnosti Pacific Biosciences a vystoupí na ní Richard Gibbs z Baylor College of Medicine a Richard Wilson z Washington University in St Louis. Zájemci o účast na konferenci v Baltimoru se mohou registrovat zde. Nabízíme také živý přenos a přístup k záznamu.
Další informace o systému Sequel naleznete na pacb.com/sequel.
.