Patogeneză: Majoritatea speciilor nu sunt agenți patogeni semnificativi și provoacă puține sau nici o boală. Anumite specii, cu toate acestea, sunt extrem de patogene și provoacă enterită catarală sau hemoragică prin eroziunea severă a membranelor mucoasei prin liza celulară, rezultând o diaree abundentă cu apă până la sânge. Boala clinică nu se manifestă, de obicei, decât în momentul în care se produc leziuni tisulare cumulative asociate cu schizogonia de a doua sau a treia generație. Animalele afectate moderat pot prezenta semne progresive, cum ar fi creșterea slabă în greutate sau pierderea în greutate, slăbiciune și emaciere, în timp ce indivizii grav afectați pot muri la scurt timp după apariția bolii. Patogenitatea depinde de mai mulți factori, cum ar fi speciile de paraziți, viabilitatea, infectivitatea, virulența, tropismul, vârsta gazdei, starea nutrițională, competența imunologică, precum și condițiile de mediu predominante (temperatură, umiditate) și practicile de gestionare. Animalele tinere sunt cele mai sensibile la boala clinică, deși supraviețuitorii dezvoltă o puternică imunitate protectoare specifică împotriva infecțiilor și bolilor ulterioare.

Mode de transmitere: Oocistele excretate odată cu fecalele gazdei contaminează mediul extern, dar trebuie să sufere o sporulație internă (formarea de sporozoiți) înainte de a deveni infecțioase. Noile gazde sunt infectate atunci când ingerează oochisturi sporulate care contaminează rezervele de hrană sau apă (transmitere fecală-orală). În urma ingestiei, oocistele și sporocistele se excizează în intestine eliberând sporozoiții conținuți, care invadează celulele gazdei pentru a începe merogonia. Stimulii excistării includ condiții fizico-chimice post-gastrice adecvate, cum ar fi nivelul de oxigen, pH-ul, sărurile biliare, enzimele pancreatice etc.

Diagnostic diferențial: Semnele clinice coincid de obicei cu patența parazitului (perioada de patentare = perioada în care se produc oochisturi). Infecțiile sunt de obicei diagnosticate prin examenul coprologic al fecalelor gazdei pentru oociste coccidiene (concentrate prin diferite tehnici de sedimentare-flotare). Oochisturile necolorate se observă cel mai bine prin microscopie luminoasă, folosind o iluminare transmisă suboptimală (condensator înfășurat în jos pentru a introduce difracția), optică cu contrast de fază sau cu contrast de interferență. Este posibil ca probele fecale proaspete să conțină doar oochisturi nesporulate, astfel încât diagnosticul specific diferențial poate necesita uneori o depozitare pe termen scurt pentru a facilita sporularea (bicromatul de potasiu 2% este adesea utilizat pentru a suprima microflora în timpul depozitării, dar nu și în cazul speciilor de piscine, iar refrigerarea poate încetini procesul, dacă este necesar pentru probele de teren). Cercetătorii au folosit recent o serie de tehnici moleculare pentru a caracteriza variația genetică între și în cadrul speciilor de paraziți, dar puține tehnici sunt adecvate pentru utilizarea de rutină a diagnosticului.

Tratament și control: Progresia bolii este de obicei atât de rapidă încât orice tratament terapeutic (curativ) poate fi pur și simplu prea târziu. Din acest motiv, medicația continuă în alimente sau în apă este adesea utilizată pentru tratamentul profilactic (preventiv) în multe industrii de animale intensive. Este disponibilă o gamă largă de medicamente, inclusiv cele cu activitate coccidio-statică (supresivă reversibilă) sau coccidio-cidă (letală ireversibilă). Principalele grupe de medicamente includ sulfonamide (sulfanilamidă, trimetoprim, ehopabat), piridinoli (clopidol, decoquinat), nitrobenzamide (zoalene), arsenicale organice (roxarsone), nitrofurani (furazolidone, amprolium), quinazolinone (halofuginonă), antibiotice polieter ionoforice (monensin, laslocid, salinomicină, narasin), triazine asimetrice (diclazuril) și simetrice (toltrazuril). Din păcate, există tot mai multe probleme legate de rezistența la medicamente în rândul multor specii de coccidieni, în special la medicamentele de sinteză, care tinde să persiste în cadrul populațiilor de paraziți. Multe industrii recomandă o rotație periodică între diferite grupuri de medicamente și utilizarea de medicamente combinate (cocktail) pentru a minimiza apariția rezistenței. Majoritatea infecțiilor cu coccidieni stimulează dezvoltarea unor răspunsuri imune de protecție puternice, deși tranzitorii dacă nu sunt premergătoare (de scurtă durată dacă paraziții nu persistă). S-a înregistrat un succes considerabil în ceea ce privește controlul prin imunoprofilaxie cu ajutorul tulpinilor atenuate sau precoce de paraziți, în special în industria avicolă. Cercetătorii încearcă în prezent să dezvolte vaccinuri subcelulare recombinante. În general, focarele pot fi controlate prin practici de gestionare bazate pe îmbunătățirea igienei, reducerea aglomerației, îndepărtarea așternutului contaminat și izolarea indivizilor infectați. Dezinfecția chimică este, de obicei, nepractică, deoarece oocistele sunt rezistente la mulți dezinfectanți convenționali.

.