Acest capitol oferă o privire de ansamblu asupra ciupercilor și algelor eucariote, deoarece ambele grupuri au în comun o serie de morfologii – adică de la cele filamentoase la cele celulare. Ciupercile unesc solul prin forma lor filamentoasă, prin exsudate și prin interacțiunile trofice cu toate celelalte grupuri de organisme din sol. Ciupercile sunt extrem de importante în ciclul carbonului și al azotului, datorită capacității lor de a degrada substraturile complexe de origine vegetală, care reprezintă până la 90% din productivitatea primară netă în majoritatea ecosistemelor terestre. În plus, simbiozele de obicei mutualiste, cunoscute sub numele de „micorize”, dintre multe ciuperci și rădăcinile plantelor, precum și interacțiunile parazitare care duc la multe boli ale plantelor au un impact enorm atât din punct de vedere ecologic, cât și economic. Marginile temporar sau permanent umede ale râurilor, lacurilor și iazurilor, precum și substraturile turbate ale mlaștinilor și fânețelor găzduiesc numeroase alge de apă dulce care nu se dezvoltă departe de apă. Solurile diverse ale agriculturii temperate și tropicale, pajiștile, pădurile, tundra arctică și alpină și chiar deșerturile adăpostesc, de asemenea, o floră surprinzător de diversă și activă atât de alge eucariote, cât și de cianobacterii. Acest capitol elaborează clasificarea și caracteristicile ciupercilor și algelor eucariote, împreună cu rolurile ecologice ale acestor grupuri în sol.

.