Organização nucleolar por bivalentes autossômicos ocorre durante a prófase meiótica masculina em espécies de mamíferos. Durante os estágios posteriores de leptóteno e zigóteno, vários bivalentes autossômicos estão envolvidos na síntese do RNA ribossômico. No estágio de paquíteno, as massas nucleolares destacam-se dos locais de origem autossômica primária, deslocam-se para perto do par cromossômico XY, e os componentes nucleolares tornam-se segregados. No paquíteno inicial, um complexo sinaptonemal extenso na região pseudoautosomal, liga os cromossomos X e Y em justaposição próxima ao longo da maior parte do comprimento do cromossomo Y, exceto por uma região terminal do Y que diverge da região de emparelhamento. À medida que a fase meiótica avança, os cromossomas X e Y dessinaptam progressivamente e, no diploteno, o par XY é associado de ponta a ponta. Xmr (relacionado ao Xlr, meiose regulada) é um componente proteico do nucléolo associado ao par XY e das porções assínapsadas dos núcleos axiais X e Y. Xmr, como o SCP3, é um componente do elemento lateral do complexo sinaptonemal. Ambos partilham a homologia estrutural na sua região C-terminal. Esta região contém vários domínios de putativas bobinas conhecidas por mediar as interações proteína-proteína heterodimérica e por fornecer sítios de ligação às proteínas reguladoras. Como Xmr, a proteína repressora tumoral BRCA1 está presente ao longo dos núcleos não-sinapsados do bivalente XY. Ambos Xmr e BRCA1 foram implicados em um mecanismo que leva à condensação da cromatina e inativação da transcrição do bivalente XY. O complexo de cinase BRCA1-ATR, como sugere uma pesquisa recente, desencadeia a fosforilação da histona H2AX, que predomina na cromatina condensada do par cromossômico XY. Xmr não está presente no bivalente XY quando a expressão da histona H2AX é deficiente. O papel do Xmr na condensação da cromatina do bivalente XY ainda não foi determinado. A homologia estrutural parcial do SCP3 e Xmr, sua distribuição ao longo dos núcleos axiais não sinapsados dos cromossomos X e Y, e a presença de Xmr no nucléolo associado ao par XY, levanta a possibilidade de que Xmr, e outras proteínas incluindo as proteínas kinases, possam ser recrutadas para o nucléolo para realizar funções relacionadas à sinapses cromossômicas, processos de condensação e recombinação da cromatina, bem como a progressão do ciclo celular.