Latest R e a taxa de crescimento

Um valor R entre 0,7 e 1,0 significa que, em média, cada 10 pessoas infectadas infectarão entre 7 e 10 outras pessoas.

Uma taxa de crescimento entre -5% e -2% significa que o número de novas infecções está diminuindo entre 2% e 5% a cada dia.

As estimativas do Reino Unido de R e taxa de crescimento são médias sobre diferentes situações epidemiológicas e devem ser consideradas como um guia para a tendência geral e não como uma descrição do estado da epidemia. Dada a abordagem cada vez mais localizada da gestão da epidemia, particularmente entre nações, as estimativas a nível do Reino Unido são menos significativas do que anteriormente.

Estas estimativas representam a transmissão da COVID-19 nas últimas semanas devido ao tempo de espera entre alguém que está infectado, que tem sintomas e que precisa de cuidados de saúde.

Latest by NHS England regions

Estas são as mais recentes estimativas de R e taxa de crescimento pelas regiões do NHS England.

Quando o número de casos ou mortes está em níveis baixos e/ou há um alto grau de variabilidade na transmissão através de uma região, então deve-se ter cuidado ao interpretar as estimativas de R e a taxa de crescimento. Por exemplo, uma quantidade significativa de variabilidade em uma região devido a um surto local pode significar que um único valor médio não reflete com precisão a maneira como as infecções estão mudando em toda aquela região.

É a visão especialista da SAGE, no entanto, que as estimativas desta semana são confiáveis.

Os estimados para R e taxas de crescimento são mostrados como um intervalo, e os valores verdadeiros provavelmente estão dentro deste intervalo.

Veja uma série temporal de estimativas publicadas de R e taxas de crescimento (ODS, 20KB) de 29 de Maio de 2020 para:

• UK
• England
• As 7 regiões do NHS England

O documento da série temporal é actualizado regularmente.

A última estimativa para as administrações devolvidas

Os últimos intervalos para os valores R nas administrações devolvidas são publicados nos seus respectivos websites:

• Estima R da Irlanda do Norte
• Estima R da Escócia
• Estima R do País de Gales (Cymraeg)

Outras estatísticas chave

O Inquérito de Infecção ONS fornece informação sobre:

• o número de novas infecções da doença identificadas durante um período de tempo especificado (incidência)
• a proporção da população que apresenta um resultado positivo para a doença na comunidade em qualquer momento (taxa de positividade ou prevalência)

Outros dados sobre testes, casos, cuidados de saúde e mortes estão disponíveis no painel do Coronavirus (COVID-19) no Reino Unido.

Sobre R e taxa de crescimento

R

O número de reprodução (R) é o número médio de infecções secundárias produzidas por uma única pessoa infectada.

Um valor R de 1 significa que em média cada pessoa infectada infectará 1 outra pessoa, o que significa que o número total de infecções é estável. Se R for 2, em média, cada pessoa infectada infecta mais 2 pessoas. Se R for 0,5, em média para cada 2 pessoas infectadas, haverá apenas 1 nova infecção. Se R for maior que 1 a epidemia está a crescer, se R for menor que 1 a epidemia está a diminuir. Quanto maior for R acima de 1, mais pessoas 1 pessoa infectada infecta e assim, mais rápido a epidemia cresce.

R pode mudar com o tempo. Por exemplo, ela cai quando há uma redução no número de contatos entre as pessoas, o que reduz a transmissão. R aumenta quando o número de contatos entre pessoas aumenta, levando a um aumento na transmissão viral.

Crescimento

A taxa de crescimento reflete a rapidez com que o número de infecções está mudando dia a dia. É uma aproximação da variação percentual do número de infecções em cada dia. Se a taxa de crescimento for superior a 0 (+ positivo), então a epidemia está a crescer. Se a taxa de crescimento for inferior a 0 (- negativo), então a epidemia está a diminuir.

O tamanho da taxa de crescimento indica a velocidade da mudança. Uma taxa de crescimento de +5% indica que a epidemia está a crescer mais rapidamente do que uma taxa de crescimento de +1%. Da mesma forma, uma taxa de crescimento de -4% indica que a epidemia está a encolher mais rapidamente do que uma taxa de crescimento de -1%. Mais informações técnicas sobre a taxa de crescimento podem ser encontradas na revista Plus.

Como as taxas de crescimento são diferentes das estimativas R

R só por si não nos diz a rapidez com que uma epidemia está a mudar. Doenças diferentes com o mesmo R podem gerar epidemias que crescem a velocidades muito diferentes. Por exemplo, 2 doenças, ambas com R=2, podem ter durações muito diferentes para 1 indivíduo infectado infectar 2 outras pessoas; uma doença pode levar anos, enquanto a outra pode levar dias.

A taxa de crescimento nos dá informações sobre o tamanho e a velocidade da mudança, enquanto o valor de R só nos dá informações sobre a direção da mudança.

Para calcular R, são necessárias informações sobre o tempo que leva entre cada geração de infecções. Isso é quanto tempo leva para que um conjunto de pessoas de um grupo infectado infecte um novo conjunto de pessoas no grupo seguinte. Isto pode depender de vários factores biológicos, sociais e comportamentais diferentes. A taxa de crescimento não depende do ‘tempo de geração’ e, portanto, requer menos suposições para estimar.

Nem uma medida, R nem a taxa de crescimento, é melhor que a outra, mas cada uma fornece informações úteis para monitorar a propagação de uma doença.

As estimativas das taxas de crescimento e R são atualizadas regularmente. Não são, no entanto, as únicas medidas importantes da epidemia. Ambas devem ser consideradas juntamente com outras medidas de propagação da doença, tais como o número de novos casos da doença identificados durante um determinado período de tempo (incidência) e a proporção da população com a doença num determinado momento (prevalência). Se R equivale a 1 com 100.000 pessoas infectadas actualmente, é uma situação muito diferente de R equivale a 1 com 1.000 pessoas infectadas actualmente. O número de pessoas actualmente infectadas com o vírus corona (COVID-19) – e por isso capazes de transmitir o vírus – é, portanto, muito importante.

Como R e taxas de crescimento são estimadas

Grupos de modelagem individual usam uma gama de dados para estimar taxas de crescimento e valores de R, incluindo:

• Dadosepidemiológicos, tais como dados de testes, internamentos hospitalares, Internações na UTI e óbitos – geralmente leva até 3 semanas para que as mudanças na propagação da doença sejam refletidas nas estimativas devido ao tempo decorrido entre a infecção inicial e a necessidade de cuidados hospitalares
• pesquisas de padrão de contato que reúnem informações sobre o comportamento – estas podem ser mais rápidas (com um atraso de cerca de uma semana), mas podem ser abertas a enviesamentos, uma vez que muitas vezes dependem de autocomportamento relatado e fazer suposições sobre como a informação recolhida se relaciona com a propagação da doença
• inquéritos de infecção domiciliária onde são feitos esfregaços em indivíduos – estes podem fornecer estimativas de quantas pessoas estão infectadas. Os inquéritos longitudinais (onde são repetidamente recolhidas amostras das mesmas pessoas) permitem uma estimativa mais directa do crescimento das taxas de infecção

Diferentes grupos de modelação usam diferentes fontes de dados para estimar estes valores usando modelos matemáticos que simulam a propagação das infecções. Alguns podem até usar todas essas fontes de informação para ajustar seus modelos para refletir melhor a situação do mundo real. Há incerteza em todas estas fontes de dados, por isso as estimativas podem variar entre diferentes modelos, por isso não dependemos apenas de um modelo. As evidências de vários modelos são consideradas, discutidas, combinadas, e a taxa de crescimento e R são então apresentadas como intervalos. Os valores verdadeiros mais prováveis estão algures dentro dos intervalos.

Rounding e diferenças entre os fluxos de dados usados nestes modelos individuais que são combinados contabilizam diferenças entre estimativas de R e taxas de crescimento estimadas.

Quem estima R e taxas de crescimento

Taxas de crescimento e R são estimadas por vários grupos de modelação independentes baseados em universidades e na Saúde Pública da Inglaterra (PHE). Os grupos de modelagem discutem suas estimativas individuais de R no Science Pandemic Influenza Modelling group (SPI-M) – um subgrupo de SAGE.

Atraso temporal das estimativas

SPI-M usam vários modelos, cada um usando dados de uma variedade de fontes em suas estimativas de R e taxa de crescimento. Dados epidemiológicos, como internações hospitalares, internações em UTI e óbitos, geralmente levam até 3 semanas para refletir mudanças na propagação da doença.

Isso se deve ao tempo de atraso entre a infecção inicial, com sintomas e a necessidade de cuidados hospitalares. Como resultado, os últimos números publicados representam a situação nas últimas semanas em vez de hoje. Estas estimativas ainda não refletem completamente quaisquer mudanças muito recentes na transmissão devido, por exemplo, a mudanças recentes de políticas no Reino Unido.

Limitações de R

R é um valor médio que pode variar em diferentes partes do país, comunidades e subsecções da população. Não pode ser medido directamente, pelo que existe sempre incerteza em torno do seu valor exacto. Isto torna-se ainda mais problemático quando se calcula R usando um pequeno número de casos, seja devido a taxas de infecção mais baixas ou a áreas geográficas menores. Esta incerteza pode ser devida à variabilidade dos dados subjacentes, levando a um intervalo maior para R e a alterações mais frequentes nas estimativas.

Even quando a estimativa global de R do Reino Unido é inferior a 1, algumas regiões podem ter estimativas de R que incluem intervalos que excedem 1, por exemplo de 0,7 a 1,1; isto não significa necessariamente que a epidemia esteja a aumentar naquela região, apenas que a incerteza significa que não pode ser excluída. Também é possível que um surto num local específico possa resultar num R acima de 1 para toda a região.

Limitações das taxas de crescimento

A taxa de crescimento é um valor médio que pode variar. Quando os números de casos são baixos, a incerteza aumenta. Isto pode acontecer quando apenas uma proporção muito pequena de pessoas está infectada, ou quando a área geográfica considerada tem uma população muito pequena. Um número menor de casos significa que a variabilidade nos dados subjacentes torna difícil estimar a taxa de crescimento; haverá uma gama mais ampla dada para a taxa de crescimento e alterações frequentes nas estimativas. Isto irá acontecer tanto para o R como para a taxa de crescimento. Contudo, a estimativa da taxa de crescimento requer menos hipóteses sobre a doença do que R.

Even quando a estimativa global da taxa de crescimento do Reino Unido é negativa (abaixo de 0), algumas regiões podem ter estimativas da taxa de crescimento que incluem intervalos que são positivos (acima de 0), por exemplo de -4% a +1%. Isto não significa necessariamente que a epidemia esteja a aumentar naquela região, apenas que a incerteza significa que não pode ser excluída. Também é possível que um surto num local específico possa resultar numa taxa de crescimento positiva (acima de 0) para toda a região.

As estimativas da taxa de crescimento para geografias menores do que o nível regional são menos fiáveis e é mais apropriado identificar pontos críticos locais através, por exemplo, da monitorização do número de casos, hospitalizações e mortes.