Loggains serviu como coordenador ofensivo dos Titãs do Tennessee de 2012-2013 como parte da equipa técnica de Mike Munchak. Dias depois de Ken Whisenhunt assumir o cargo de treinador principal dos Titãs em 2014, Loggains foi informado de que ele não permaneceria na organização. Ele tinha sido anteriormente o treinador dos quarterbacks da equipe.
Loggains passou 2014 como o treinador dos quarterbacks para os Cleveland Browns. Ele era um defensor do Texas A&M quarterback Johnny Manziel.
O ano seguinte Loggains estava à procura de um emprego. Ele foi entrevistado para um cargo de coordenador ofensivo pelos New York Giants, mas foi contratado pelos Bears em 23 de janeiro de 2015 como quarterbacks coach. Sob o comando de Loggains, o quarterback Jay Cutler teve uma de suas melhores temporadas, terminando 2015 com 3.629 passes, 21 touchdowns, 11 interceptações e altos índices de carreira na classificação de passes (92,3) e porcentagem de conclusão (64,4). As 11 interceptações foram as mais baixas da sua carreira e resultaram numa percentagem de interceptação de 2,3, a mais baixa de uma temporada em que começou pelo menos 12 jogos, enquanto 21 touchdowns foram os seus segundos desde 2011 e as 3.629 jardas foram as terceiras mais altas da sua carreira. No terceiro down, Cutler teve uma classificação de 103,2 passes (quarto na NFL) após completar 91 de 141 passes em 1.242 jardas, sete touchdowns e duas interceptações. Em contraste, contra o quarterback reserva do Seattle Seahawks Jimmy Clausen completou 9 dos 17 passes em 63 jardas, e incluindo sacos, registrou 48 passes líquidos, a segunda vez desde a temporada de 1990 que o Bears teve menos de 50 passes líquidos. O Bears terminou o ano com 228,9 jardas de passes por jogo, em 23º lugar na liga, com o grupo de quarterbacking a ter uma percentagem combinada de 63,9 de conclusão e 2,3 de interceptação, ambos classificados em terceiro lugar na história da equipa, juntamente com 3.843 jardas de passes brutos e um 42.53% (quarto), 3.660 jardas líquidas de passes (quinto), juntamente com 5.514 jardas líquidas totais e uma classificação de 89,7 passes (sexto).
Loggains foi promovido a coordenador ofensivo em 11 de janeiro de 2016, quando Adam Gase deixou a posição para se tornar o treinador principal dos Miami Dolphins. Os Bears lutaram durante a posse de Loggains como OC, com um ranking de Novembro de 2017 pela ESPN colocando-o em último entre 32 jogadores, enquanto o ataque terminou a temporada 2017 com uma média de apenas 16,5 pontos por jogo (29º no campeonato). Depois que o técnico John Fox foi demitido, Loggains se reencontrou com Gase em Miami, chegando a outra posição de coordenador ofensivo.
Em 23 de janeiro de 2019, Loggains se reencontrou com Adam Gase mais uma vez depois que ele foi contratado como coordenador ofensivo/técnico de quarterbacks do New York Jets.Em 25 de outubro de 2020, em antecipação ao jogo da Semana 7 contra os Buffalo Bills, o treinador principal Adam Gase desistiu do jogo ofensivo, chamando a Loggains. Apesar de um bom desempenho no primeiro tempo com uma vantagem de 10-6, Loggains não conseguiu ganhar impulso no segundo tempo, culminando com uma derrota de 18-10 para Buffalo. Em 28 de outubro de 2020, antes do jogo contra os Kansas City Chiefs, foi relatado que os Loggains voltariam a ter um jogo ofensivo, com deveres de chamada.