O valor logP de um composto, que é o logaritmo do seu coeficiente de partição entre n-octanol e log de água (coctanol/água),é uma medida bem estabelecida da hidrofilicidade do composto. Baixa hidrofilicidade e, portanto, altos valores logP causam má absorção ou permeação. Foi demonstrado que os compostos têm uma propensão razoável para absorver bem o seu logP não deve ser superior a 5,0. A distribuição dos valores logP calculados de mais de 3000 medicamentos no mercado sublinha este facto (ver diagrama)

O nosso método de cálculo logP interno é implementado como um sistema de incremento de contribuições de cada átomo com base no seu tipo de átomo. O motor de previsão cLogP distingue 368 tipos de átomos que são compostos de várias propriedades do próprio átomo (n.º atómico e membro do anel) como seus vizinhos directos (tipo de ligação, estado de aromaticidade e atomicno codificado). Mais de 5000 compostos com valores logP determinados experimentalmente foram usados como conjunto de treinamento para otimizar os 369 valores de contribuição associados aos tipos de átomo. O gráfico de correlação (ver diagrama) mostra os valores de logP determinados experimentalmente de um teste independente de mais de 5000 compostos sendo diferentes do conjunto de treinamento.