A Academia Militar da Carolina do Sul foi uma predecessora, instituição de dois campus para A Cidadela. Foi estabelecida em 1842 pela Legislatura da Carolina do Sul.
A Carolina do Sul tinha construído uma série de arsenais ao redor do estado após a revolta de escravos planejada pela Dinamarca Vesey em 1822; estes foram consolidados em arsenais de Columbia e Charleston. Não mais vistos como militarmente necessários, eles se tornaram em 1842 a Academia Militar da Carolina do Sul, composta pela Academia do Arsenal na Columbia e a Academia da Cidadela em Charleston. Durante a Guerra Civil, estudantes de ambos serviram como Batalhão de Cadetes de Estado; as aulas continuaram, com interrupções. Os cadetes SCMA dispararam os primeiros tiros da Guerra Civil no dia 9 de janeiro de 1861, enquanto eram tripulantes de um posto de tiro na Ilha Morris, na Carolina do Sul, que bombardeou o navio a vapor Union Star of the West; o Batalhão de Cadetes de Estado constituiu mais de um terço de uma força confederada que defendeu uma ponte ferroviária estratégica na Batalha de Tulifinny em 1864, a única ocasião em que todo o corpo estudantil de uma faculdade americana lutou em combate.
A Academia do Arsenal foi queimada pelas tropas da União em 1865 e nunca mais foi reaberta; o único edifício sobrevivente tornou-se a Mansão do Governador da Carolina do Sul. A Academia da Cidadela e a Academia Militar da Carolina do Sul fecharam em 1865; seus prédios ficaram em mãos federais até 1882. Uma lei de 1882 da Legislatura da Carolina do Sul reabriu a Academia Militar da Carolina do Sul, usando apenas o campus de Charleston. Conhecida comumente como The Citadel Academy, a escola foi renomeada em 1910 como The Citadel, depois que o nome “Academia” se tornou comum às escolas secundárias e não às faculdades.