Este capítulo fornece uma visão geral dos fungos e das algas eucarióticas, uma vez que ambos os grupos partilham uma série de morfologias – isto é, desde filamentosos a celulares. Os fungos ligam o solo pela sua forma filamentosa, exsudados e interacções tróficas com todos os outros grupos de organismos do solo. Os fungos são extremamente importantes no ciclo do carbono e do nitrogênio devido à sua capacidade de degradar substratos complexos de origem vegetal, que representam até 90% da produtividade primária líquida na maioria dos ecossistemas terrestres. Além disso, as simbioses geralmente mutualistas, conhecidas como “micorrizas”, entre muitos fungos e raízes de plantas, assim como as interações parasitárias que levam a muitas doenças das plantas, têm enormes impactos tanto em termos ecológicos como econômicos. As margens temporária ou permanentemente úmidas dos rios, lagos e lagoas e os substratos turfosos de pântanos e pântanos são o lar de muitas algas de água doce que não prosperam longe da água. Os diversos solos da agricultura temperada e tropical, prados, florestas, tundra ártica e alpina e até mesmo desertos também abrigam uma flora surpreendentemente diversa e ativa de algas eucarióticas e cianobactérias. Este capítulo elabora a classificação e características dos fungos e algas eucarióticas, juntamente com os papéis ecológicos destes grupos no solo.