Najnowsze R i stopa wzrostu

Wartość R pomiędzy 0,7 a 1,0 oznacza, że średnio każde 10 osób zakażonych będzie zakażać od 7 do 10 innych osób.

Stopa wzrostu wynosząca od -5% do -2% oznacza, że liczba nowych zakażeń zmniejsza się o od 2% do 5% każdego dnia.

Oszacowane w Wielkiej Brytanii wartości R i stopy wzrostu są średnimi dla różnych sytuacji epidemiologicznych i powinny być traktowane raczej jako przewodnik po ogólnej tendencji niż opis stanu epidemii. Biorąc pod uwagę coraz bardziej lokalne podejście do zarządzania epidemią, szczególnie między narodami, szacunki na poziomie Wielkiej Brytanii są mniej znaczące niż poprzednio.

Te szacunki przedstawiają transmisję COVID-19 w ciągu ostatnich kilku tygodni ze względu na opóźnienie między zakażeniem, wystąpieniem objawów i potrzebą opieki zdrowotnej.

Najnowsze według regionów NHS England

To są najnowsze szacunki R i wskaźnika wzrostu według regionów NHS England.

Gdy liczba przypadków lub zgonów jest na niskim poziomie i / lub istnieje wysoki stopień zmienności transmisji w całym regionie, należy zachować ostrożność przy interpretacji szacunków R i wskaźnika wzrostu. Na przykład, znaczna ilość zmienności w całym regionie spowodowana lokalnym wybuchem epidemii może oznaczać, że pojedyncza średnia wartość nie odzwierciedla dokładnie sposobu, w jaki infekcje zmieniają się w całym regionie.

Jednakże ekspercki pogląd SAGE jest taki, że szacunki z tego tygodnia są wiarygodne.

Oszacowania dla R i wskaźników wzrostu są przedstawione jako zakres, a prawdziwe wartości prawdopodobnie mieszczą się w tym zakresie.

Zobacz serię czasową opublikowanych oszacowań R i wskaźników wzrostu (ODS, 20KB) od 29 maja 2020 r. dla:

• UK
• Anglii
• 7 regionów NHS England

Dokument serii czasowej jest regularnie aktualizowany.

Najnowsze dla zdecentralizowanych administracji

Najnowsze zakresy dla wartości R w zdecentralizowanych administracjach są publikowane na ich odpowiednich stronach internetowych:

• Northern Ireland R estimate
• Scotland R estimate
• Wales R estimate (Cymraeg)

Inne kluczowe statystyki

Badanie ONS dotyczące zakażeń dostarcza informacji na temat:

• liczby nowych zakażeń chorobą stwierdzonych w określonym przedziale czasowym (zapadalność)
• odsetka populacji, która w danym momencie uzyskała wynik dodatni testu na obecność choroby w społeczności (wskaźnik pozytywności lub prewalencja)

Inne dane dotyczące testów, przypadków, opieki zdrowotnej i zgonów są dostępne na tablicy rozdzielczej Coronavirus (COVID-19) in the UK.

O R i tempie wzrostu

R

Liczba reprodukcji (R) to średnia liczba wtórnych zakażeń wytwarzanych przez jedną zakażoną osobę.

Wartość R równa 1 oznacza, że średnio każda osoba, która jest zakażona, zakaża 1 inną osobę, co oznacza, że całkowita liczba zakażeń jest stabilna. Jeśli R wynosi 2, to średnio każda osoba zarażona zaraża 2 kolejne osoby. Jeśli R wynosi 0,5 to średnio na każde 2 zakażone osoby przypada tylko 1 nowa infekcja. Jeśli R jest większe niż 1, epidemia rośnie, jeśli R jest mniejsze niż 1, epidemia maleje. Im R jest większe od 1, tym więcej osób zaraża jedna zarażona osoba, a więc tym szybciej epidemia rośnie.

R może się zmieniać w czasie. Na przykład spada, gdy zmniejsza się liczba kontaktów między ludźmi, co ogranicza transmisję. R wzrasta, gdy liczba kontaktów między ludźmi wzrasta, co prowadzi do wzrostu transmisji wirusa.

Stopa wzrostu

Stopa wzrostu odzwierciedla, jak szybko zmienia się liczba zakażeń dzień po dniu. Jest to przybliżona wartość procentowa zmiany liczby infekcji każdego dnia. Jeśli wskaźnik wzrostu jest większy niż 0 (+ dodatni), to epidemia rośnie. Jeśli wskaźnik wzrostu jest mniejszy niż 0 (- ujemny), to epidemia się zmniejsza.

Wielkość wskaźnika wzrostu wskazuje na szybkość zmian. Wskaźnik wzrostu wynoszący +5% oznacza, że epidemia rośnie szybciej niż wskaźnik wzrostu wynoszący +1%. Podobnie, wskaźnik wzrostu wynoszący -4% wskazuje, że epidemia zmniejsza się szybciej niż wskaźnik wzrostu wynoszący -1%. Dalsze informacje techniczne na temat wskaźnika wzrostu można znaleźć w magazynie Plus.

Jak wskaźniki wzrostu różnią się od szacunków R

Samo R nie mówi nam, jak szybko zmienia się epidemia. Różne choroby z tym samym R mogą generować epidemie, które rosną w bardzo różnym tempie. Na przykład, 2 choroby, obie z R=2, mogą mieć bardzo różny czas trwania dla 1 zainfekowanego osobnika, aby zarazić 2 innych ludzi; jedna choroba może trwać lata, podczas gdy druga może trwać dni.

Stopa wzrostu dostarcza nam informacji na temat wielkości i szybkości zmian, podczas gdy wartość R daje nam tylko informacje na temat kierunku zmian.

Aby obliczyć R, potrzebne są informacje na temat czasu pomiędzy każdym pokoleniem infekcji. To znaczy, ile czasu potrzeba, aby jeden zestaw ludzi w zainfekowanej grupie zainfekował nowy zestaw ludzi w następnej grupie. Może to zależeć od kilku różnych czynników biologicznych, społecznych i behawioralnych. Wskaźnik wzrostu nie zależy od „czasu generacji” i dlatego wymaga mniej założeń do oszacowania.

Żadna z miar, R ani wskaźnik wzrostu, nie jest lepsza od drugiej, ale każda z nich dostarcza informacji przydatnych w monitorowaniu rozprzestrzeniania się choroby.

Oszacowania wskaźników wzrostu i R są regularnie aktualizowane. Nie są one jednak jedynymi ważnymi miarami epidemii. Obie powinny być rozważane wraz z innymi miarami rozprzestrzeniania się choroby, takimi jak liczba nowych przypadków choroby zidentyfikowanych w określonym czasie (zapadalność) oraz odsetek populacji z chorobą w danym punkcie czasowym (chorobowość). Jeśli R równa się 1 przy 100 000 osób aktualnie zakażonych, jest to zupełnie inna sytuacja niż R równa się 1 przy 1 000 osób aktualnie zakażonych. Liczba osób obecnie zakażonych koronawirusem (COVID-19) – a więc mogących przekazać wirusa dalej – jest zatem bardzo ważna.

Jak szacuje się R i wskaźniki wzrostu

Poszczególne grupy modelujące wykorzystują szereg danych do szacowania wskaźników wzrostu i wartości R, w tym:

• dane epidemiologiczne, takie jak dane z badań, przyjęcia do szpitala, przyjęcia do szpitala, przyjęcia na OIOM i zgony – zmiany w rozprzestrzenianiu się choroby mogą być odzwierciedlone w szacunkach dopiero po 3 tygodniach ze względu na opóźnienie między początkowym zakażeniem a potrzebą opieki szpitalnej
• badania wzorca kontaktu, które gromadzą informacje o zachowaniu – mogą być szybsze (z opóźnieniem około tygodnia), ale mogą być podatne na błędy, ponieważ często opierają się na samodzielnieBadania dotyczące zakażeń w gospodarstwach domowych, w których wymazy są pobierane od poszczególnych osób – mogą one dostarczyć szacunkowych danych na temat liczby osób zakażonych. Badania podłużne (w których próbki są wielokrotnie pobierane od tych samych osób) pozwalają na bardziej bezpośrednie oszacowanie wzrostu wskaźników zakażeń

Różne grupy modelujące wykorzystują różne źródła danych do oszacowania tych wartości przy użyciu modeli matematycznych, które symulują rozprzestrzenianie się zakażeń. Niektóre z nich mogą nawet wykorzystywać wszystkie te źródła informacji, aby dostosować swoje modele w celu lepszego odzwierciedlenia sytuacji w świecie rzeczywistym. Wszystkie te źródła danych są obarczone niepewnością, więc szacunki mogą różnić się między różnymi modelami, dlatego nie opieramy się tylko na jednym modelu. Dowody z kilku modeli są rozważane, dyskutowane, łączone, a wskaźnik wzrostu i R są następnie przedstawiane jako zakresy. The most likely true values are somewhere within the ranges.

Rounding and differences between the data streams used in these individual model outputs that are combined account for differences between estimates of R and estimated growth rates.

Who estimates R and growth rates

Growth rates and R are estimated by several independent modelling groups based in universities and Public Health England (PHE). Grupy modelujące omawiają swoje indywidualne oszacowania R na forum Science Pandemic Influenza Modelling Group (SPI-M) – podgrupy SAGE.

Opóźnienie czasowe oszacowań

SPI-M używają kilku modeli, z których każdy wykorzystuje dane z różnych źródeł w swoich oszacowaniach R i wskaźnika wzrostu. Dane epidemiologiczne, takie jak przyjęcia do szpitala, przyjęcia na OIOM i zgony, zwykle potrzebują do 3 tygodni, aby odzwierciedlić zmiany w rozprzestrzenianiu się choroby.

Wynika to z opóźnienia czasowego pomiędzy początkowym zakażeniem, wystąpieniem objawów i potrzebą opieki szpitalnej. W związku z tym ostatnie opublikowane dane przedstawiają sytuację z ostatnich kilku tygodni, a nie z dnia dzisiejszego. Te szacunki nie odzwierciedlają jeszcze w pełni żadnych bardzo niedawnych zmian w transmisji spowodowanych, na przykład, ostatnimi zmianami polityki w Wielkiej Brytanii.

Ograniczenia R

R jest wartością średnią, która może się różnić w różnych częściach kraju, społecznościach i podgrupach populacji. Nie może być mierzona bezpośrednio, więc zawsze istnieje niepewność wokół jej dokładnej wartości. Staje się to jeszcze większym problemem przy obliczaniu R na podstawie małej liczby przypadków, ze względu na niższe wskaźniki zakażeń lub mniejsze obszary geograficzne. Niepewność ta może wynikać ze zmienności danych bazowych, co prowadzi do szerszego zakresu dla R i częstszych zmian w szacunkach.

Nawet gdy ogólne brytyjskie szacunki R są poniżej 1, niektóre regiony mogą mieć szacunki R, które obejmują zakresy przekraczające 1, na przykład od 0,7 do 1,1; niekoniecznie oznacza to, że epidemia wzrasta w tym regionie, po prostu niepewność oznacza, że nie można tego wykluczyć. Możliwe jest również, że wybuch epidemii w jednym konkretnym miejscu może spowodować R powyżej 1 dla całego regionu.

Ograniczenia wskaźników wzrostu

Współczynnik wzrostu jest wartością średnią, która może się zmieniać. Kiedy liczba przypadków jest niska, niepewność wzrasta. Może się to zdarzyć, gdy tylko bardzo mały odsetek ludzi jest zakażonych lub gdy dany obszar geograficzny ma bardzo małą populację. Mniejsza liczba przypadków oznacza, że zmienność w danych bazowych utrudnia oszacowanie wskaźnika wzrostu; będzie szerszy zakres podawany dla wskaźnika wzrostu i częste zmiany w szacunkach. Będzie to miało miejsce zarówno w przypadku R, jak i wskaźnika wzrostu. Jednak oszacowanie wskaźnika wzrostu wymaga mniej założeń dotyczących choroby niż R.

Nawet gdy ogólne oszacowanie wskaźnika wzrostu w Wielkiej Brytanii jest ujemne (poniżej 0), niektóre regiony mogą mieć oszacowania wskaźnika wzrostu, które obejmują zakresy dodatnie (powyżej 0), na przykład od -4% do +1%. Nie musi to oznaczać, że epidemia nasila się w tym regionie, a jedynie, że nie można tego wykluczyć ze względu na niepewność. Możliwe jest również, że wybuch epidemii w jednym konkretnym miejscu może skutkować dodatnim (powyżej 0) wskaźnikiem wzrostu dla całego regionu.

Oszacowanie wskaźnika wzrostu dla obszarów geograficznych mniejszych niż poziom regionalny jest mniej wiarygodne i bardziej stosowne jest zidentyfikowanie lokalnych punktów zapalnych poprzez, na przykład, monitorowanie liczby przypadków, hospitalizacji i zgonów.