Karolina Południowa Akademia Wojskowa była poprzedniczką, instytucją o dwóch kampusach do The Citadel. Został on ustanowiony w 1842 roku przez South Carolina Legislature.

South Carolina zbudował serię arsenałów wokół stanu po Dania Vesey planowane buntu niewolników z 1822 roku; te zostały skonsolidowane w Columbia i Charleston arsenałów. Nie postrzegane już jako militarnie konieczne, stały się w 1842 roku Akademią Wojskową Karoliny Południowej, składającą się z Akademii Arsenału w Kolumbii i Akademii Cytadeli w Charleston. Podczas wojny secesyjnej studenci z obu uczelni służyli jako Batalion Kadetów Stanowych; zajęcia odbywały się z przerwami. Kadeci SCMA oddali pierwsze strzały podczas wojny secesyjnej 9 stycznia 1861 roku, kiedy to obsadzili stanowisko artyleryjskie na Morris Island w Karolinie Południowej, które ostrzelało unijny statek parowy Star of the West; Batalion Kadetów Stanowych stanowił ponad jedną trzecią sił konfederackich, które broniły strategicznego mostu kolejowego w bitwie pod Tulifinny w 1864 roku, jedynej okazji, kiedy całe ciało studenckie amerykańskiego college’u walczyło w bitwie.

Akademia Arsenału została spalona przez wojska Unii w 1865 roku i nigdy nie została ponownie otwarta; jedyny ocalały budynek stał się rezydencją gubernatora Karoliny Południowej. Akademia Cytadeli i Akademia Wojskowa Karoliny Południowej zostały zamknięte w 1865 roku; jej budynki były w rękach federalnych do 1882 roku. Ustawa Legislatury Karoliny Południowej z 1882 roku ponownie otworzyła Akademię Wojskową Karoliny Południowej, wykorzystując jedynie kampus w Charleston. Znany powszechnie jako The Citadel Academy, szkoła została przemianowana w 1910 roku na The Citadel, po tym jak nazwa „Academy” stała się wspólna dla szkół średnich, a nie uczelni.