Wartość logP związku, która jest logarytmem jego współczynnika podziału między n-oktanolem i wodą log(coctanol/cwater), jest dobrze ugruntowaną miarą hydrofilowości związku. Niska hydrofilowość i dlatego wysokie wartości logP powodują słabe wchłanianie lub przenikanie. Wykazano, że aby związki miały rozsądne szanse na dobrą absorpcję, ich wartość logP nie może być większa niż 5,0. Rozkład obliczonych wartości logP dla ponad 3000 leków dostępnych na rynku podkreśla ten fakt (patrz diagram)

Nasza własna metoda obliczania logP jest zaimplementowana jako system przyrostowy, dodający wkład każdego atomu w oparciu o jego typ. W sumie silnik przewidywania cLogP rozróżnia 368 typów atomów, które składają się z różnych właściwości samego atomu (nr atomowy i przynależność do pierścienia) oraz jego bezpośrednich sąsiadów (typ wiązania, stan aromatyczności i zakodowany nr atomowy). Ponad 5000 związków z eksperymentalnie wyznaczonymi wartościami logP posłużyło jako zbiór treningowy do optymalizacji wartości 369 wkładu związanego z typami atomów. Wykres korelacji (patrz diagram) pokazuje obliczone versus wyznaczone eksperymentalnie wartości logP niezależnego testowego zbioru ponad 5000 związków, różniących się od zbioru treningowego.