W 2001 roku Stoner została współgospodarzem Disney Channel Mike’s Super Short Show wraz z Michaelem Alanem Johnsonem, segmentu infomercial dotyczącego nadchodzących wydań Disneya. W 2003 i 2005 roku pojawiła się jako Sarah, jedno z dwunastu dzieci Bakerów, w udanych komediach Cheaper by the Dozen i Cheaper by the Dozen 2. Pojawiła się również w kilku programach telewizyjnych skierowanych do publiczności przednastolatków, w tym The Suite Life of Zack & Cody, That’s So Raven i Drake & Josh.
W 2006 roku miała małą rolę filmową w Step Up jako Camille, młodsza siostra zastępcza postaci Channinga Tatuma. Udzieliła głosu Isabelli Garcia-Shapiro i Jenny (do sezonu 4) w serialu animowanym Disney Channel Fineasz i Ferb w latach 2007-2015, i osobiście wymyśliła powiedzonko Isabelli „Whatcha doin’?”. W 2008 roku wystąpiła w oryginalnym filmie Disney Channel Camp Rock jako Caitlyn Gellar, aspirująca producentka muzyczna. Jej odbiór w Camp Rock był szczególnie silny, z różnymi mediami sugerującymi, że nadszedł czas, aby zagrała główną rolę, po tym jak wspierała inne wielkie nazwiska, takie jak Will Smith i Eminem. Stoner zagrała rolę Alice McKinley w filmie Alicja do góry nogami, opartym luźno na serii filmów o Alicji, a w szczególności na Agonii Alicji autorstwa Phyllis Reynolds Naylor. Była to jej druga główna rola i, zgodnie z wywiadem, który pojawia się na wydaniu direct-to-DVD, stwierdza, że był to pierwszy raz, kiedy musiała pojawić się w każdej scenie w filmie.
W 2008 roku zaśpiewała dwie piosenki, „Lost and Found” i „Free Spirit”, ze ścieżki dźwiękowej filmu Alice Upside Down, w którym gra główną rolę. Nagrała również coverową wersję piosenki Dancing in the Moonlight dla filmu Disneya DVD/Blu-ray z 2009 roku, Space Buddies. W 2010 roku, Stoner pojawiła się w trzecim filmie Step Up 3D u boku Adama Sevani, gdzie ponownie wcieliła się w swoją rolę. Stoner zamieściła na swojej oficjalnej stronie YouTube filmik z ostatniej próby tanecznej, na którym przedstawiła innych członków obsady. W tym samym roku, Stoner powróciła do roli Caitlyn Gellar w Camp Rock 2: The Final Jam, sequelu Camp Rock. Stoner wystąpiła również gościnnie w telewizyjnym serialu dramatycznym House jako skater.
W 2011 roku Stoner rozpoczęła pracę z producentami płyt, autorami piosenek i trenerem wokalnym, aby zmienić swój styl wokalny z „kiddie-pop” na bardziej soulful pop vibe z odrobiną alternatywnej krawędzi dla jej pierwszego albumu studyjnego. 4 kwietnia 2010 roku, Stoner umieściła na swoim kanale YouTube filmik zapowiadający wydanie jej debiutanckiego singla „Flying Forward” 20 kwietnia 2010 roku. Stoner wydała swoją debiutancką EP-kę zatytułowaną Beat the System w 2011 roku. Pojawiła się również w filmach związanych z Wii Fit na kanale Nintendo na konsoli gier wideo Wii demonstrując ćwiczenia równowagi. Stoner zastąpiła Hayden Panettiere jako głos Kairi w Kingdom Hearts Re:Chain of Memories, Xion w Kingdom Hearts 358/2 Days oraz obu postaci w Kingdom Hearts III. Udzieliła głosu postaci Opal w trzecim i czwartym sezonie The Legend of Korra.
TaniecEdit
Po szkoleniu choreograficznym w Los Angeles, Stoner pojawiła się jako tancerka pomocnicza w kilku teledyskach, zwłaszcza w „Work It” Missy Elliott, „Gossip Folks”, „I’m Really Hot”, „Just Lose It” Eminema i „No Tengo Dinero” Kumbia Kings. Była również rezerwową tancerką dla OutKast podczas Kids’ Choice Awards w 2004 roku oraz dla Willa Smitha podczas show w 2005 roku. Stoner tańczyła z grupą taneczną o nazwie The JammX Kids między 2003 a 2006 rokiem. Odeszła z grupy na początku 2006 roku z powodu konfliktów terminarzowych, ale nadal pracuje z poszczególnymi dziećmi przy różnych zleceniach. Była również jednym z tancerzy w specjalnych funkcjach dla Shark Tale DVD.
Stoner uczy klasy hip hop w Millennium Dance Complex, i jest uznawany za najmłodszą osobę do nauczania klasy mistrzowskiej tam. Wystąpiła również w utworze Debby Ryan „We Got the Beat” dla Disney Channel’s Radio Rebel. W lutym 2015 roku wydała taneczny tribute video dla Missy Elliot zawierający mash up medley teledysków Missy Elliott, w których tańczyła, gdy była młodsza. W ciągu pierwszego tygodnia uzyskał on ponad 12 milionów wyświetleń. Missy Elliott zaprosiła Alyson do wykonania „Work It” z nią na 2019 MTV Video Music Awards.
PublishingEdit
Stoner był „redaktorem tańca” dla KEWL Magazine. W lutym 2009 roku Stoner wydała projekt Alyson Stoner opisany jako „hybryda wideo tanecznego – stopienie wielu stylów rozrywki w jeden pakiet”. Został on wyreżyserowany przez Kevina Schmidta, jej współgwiazdę z Cheaper by the Dozen.
.