Seizoen 1Edit

Wanneer Bryce de Intersect computer steelt, voelt Sarah zich zowel persoonlijk als professioneel verraden, zonder te beseffen dat hij dit deed om de Intersect computer te beschermen tegen een groep spionnen genaamd Fulcrum. Sarah krijgt vervolgens opdracht van Graham om te proberen het intersect terug te krijgen. De enige aanwijzing is de e-mail die Bryce naar Chuck stuurde, en ze spoort Chuck op naar de Buy More waar ze, zich voordoend als een klant met een kapotte telefoon, voor het eerst contact maakt.

Sarah wordt al snel een van Chuck Bartowski’s twee regeringsbegeleiders. Ze werkt samen met NSA agent John Casey en krijgt de taak Chuck te beschermen. Dit strekt zich uit tot het handelen naar aanleiding van informatie die Chuck “doorflitst”.

Als onderdeel van haar dekmantel, doet Sarah alsof ze Chuck’s vriendin is. Een van de complicaties en de belangrijkste focus op de ontwikkeling van haar karakter gedurende de serie is dat, hoewel ze aanvankelijk volhoudt dat dit slechts een deel van haar dekmantel is, er een echte romantische interesse tussen hen groeit. Terwijl Sarah zelf aanvankelijk traag is om haar gevoelens te herkennen of te erkennen, pikken andere personages haar aantrekkingskracht voor Chuck snel op. Sarah’s DEA-vriendin Carina is een van de eersten die inziet dat Sarah’s gevoelens voor Chuck meer zijn dan louter professioneel. Casey ziet ook in dat ze voor hem valt, iets waar hij haar en Chuck regelmatig mee plaagt.

De ontwikkeling van een relatie tussen Sarah en Chuck stuit in de loop van de serie op twee grote obstakels. Ten eerste wordt Sarah verondersteld romantische verwikkelingen te vermijden, en haar genegenheid voor Chuck brengt hem soms wel in gevaar. Ten tweede worden beide personages jaloers op concurrerende romantische belangen, waaronder gevallen waarin een van hen iemand moet verleiden voor een missie.

Er zijn twee bijzonder opmerkelijke gevallen van deze liefdesdriehoeken in het eerste seizoen. Chucks interesse in het vinden van een echte relatie leidt ertoe dat Chuck zijn dekmantelrelatie met Sarah “verbreekt” en achter Lou het sandwichmeisje aangaat, wat ervoor zorgt dat Sarah jaloers en beschermend wordt. Net na de “breuk” kust Sarah Chuck hartstochtelijk vlak voordat een bom zou ontploffen. Kort daarna keert Bryce Larkin terug en dingt mee naar Sarah’s affectie. Sarah is verscheurd maar besluit uiteindelijk bij haar missie te blijven om Chuck te beschermen in plaats van Bryce te volgen, grotendeels vanwege haar gevoelens voor Chuck.

Tegen het einde van het seizoen toont Sarah een bereidheid om tot het uiterste te gaan voor Chuck, en is zelfs bereid om schurkachtig te worden en haar pistool te trekken op een andere CIA-agent die probeert hem in hechtenis te nemen.

Seizoen 2Edit

In het tweede seizoen komen Chuck en Sarah aarzelend in de richting van een echte relatie. Sarah stemt toe in een eerste “echte” date met Chuck als blijkt dat hij weer wordt vrijgelaten in het burgerleven. Echter, het herbouwde Intersect wordt gesaboteerd, waardoor Chuck terug in zijn spionnenleven wordt getrokken en Sarah’s professionele barrière wordt hersteld.

Toen, als Chuck toch Sarah probeert te achtervolgen, keert Larkin een tweede keer terug. Deze keer zijn Sarah’s gevoelens duidelijk voor Chuck, maar wanneer haar genegenheid voor Chuck zowel haar leven als dat van Chuck in gevaar brengt, overtuigt Bryce Chuck om het “uit te maken” met haar.

Kort daarna loopt Chuck zijn ex-vriendin Jill Roberts tegen het lijf, waardoor een andere liefdesdriehoek ontstaat die Sarah jaloers en beschermend over Chuck maakt. Maar deze keer toont ze meer terughoudendheid en probeert ze zich er niet mee te bemoeien, tenminste totdat ze ontdekt dat Jill lid is van Fulcrum. Nog een andere driehoeksverhouding ontstaat later in het seizoen met de komst van Cole Barker, die (net als Bryce) een suave en formidabele spion is, maar dat gaat niet verder dan een kus.

Chuck biedt Sarah emotionele steun wanneer een missie haar dwingt om een deel van haar jeugd opnieuw te bezoeken, en later wanneer Sarah’s vader terugkeert. Chuck maakt een aantal sterke suggesties dat hij van Sarah houdt, waaronder met name in de mid-season finale wanneer hij Sarah de bedelarmband van zijn moeder geeft, een geschenk waarvan Sarah zegt dat het iets is dat hij moet bewaren voor een “echte vriendin.”

Sarah’s persoonlijke gevoelens voor Chuck leiden tot haar tijdelijke vervanging als Chuck’s handler in “Chuck Versus the Broken Heart”, omdat Beckman bezorgd is dat die gevoelens de missie in gevaar brachten. De vervangende agent, Forrest (Tricia Helfer), slaagde er echter niet in Chuck effectief te beschermen en hij weigerde met haar samen te werken omwille van haar methodes. Sarah’s gevoelens gaven haar ook een goed inzicht dat haar waarschuwde dat er iets mis was, terwijl Forrest dat niet kon. Beckman erkende met tegenzin dat Sarah en Chuck’s gevoelens voor elkaar eigenlijk een voordeel waren voor hun werkrelatie in plaats van een gevaar en stond Sarah toe haar rol als zijn handler te hervatten.

In de tussentijd, terwijl Sarah’s professionele verplichtingen aan Chuck worden opgeschort, raakt ze meer persoonlijk betrokken. Sarah doet een ongeoorloofde en illegale zoektocht in de CIA-database in Langley om Chucks vader te vinden nadat zijn eigen pogingen falen, en uiteindelijk neemt ze Chuck mee om zijn vader te ontmoeten.

In “Chuck Versus the First Kill” geeft Generaal Beckman Sarah de opdracht om Chuck naar Castle te lokken zodat hij in hechtenis kan worden genomen en teruggebracht naar Washington. Sarah maakt bezwaar, maar staat op het punt haar orders uit te voeren als ze op het laatste moment Chuck waarschuwt dat het een valstrik is en hem meeneemt op de vlucht.

Terwijl ze op de vlucht zijn, brengen Chuck en Sarah de nacht door in een motel en delen een bed. Terwijl ze niet in de gaten worden gehouden, kussen ze en staan op het punt seks te hebben, maar worden onderbroken door het ontbreken van een condoom, gevolgd door de verschijning van Agent Casey. Nadat Chuck met succes het Intersect uit zijn hoofd heeft verwijderd, wordt Sarah overgeplaatst om aan het nieuwe Intersect project te werken met Bryce, maar besluit al snel niet te gaan en in plaats daarvan bij Chuck te blijven. Maar zelfs nadat ze hoort dat ze de opdracht heeft afgewezen, herstelt Chuck bewust de professionele barrière door het nieuwe Intersect te uploaden.

Seizoen 3Edit

Aan het begin van “Chuck Versus the Pink Slip” is Sarah’s relatie met Chuck verbrijzeld. Flashbacks door de aflevering heen onthullen dat kort na het uploaden van de nieuwe Intersect, Sarah Chuck vroeg om AWOL te gaan en met haar weg te lopen, zodat ze samen konden zijn. Chuck was aanvankelijk enthousiast, maar tegen de tijd dat ze elkaar ontmoetten, weigerde hij zodat hij zijn spionnentraining kon voortzetten. Sarah was er kapot van en verbrak zijn relatie. Ze werd gedwongen weer contact te maken toen Chuck zich bemoeide met een operatie tegen de Ring. Uiteindelijk werd Chuck weer in het team opgenomen en kreeg Sarah van Beckman de opdracht om Chuck te helpen trainen. Hun relatieproblemen kwamen weer tot een hoogtepunt tijdens een opdracht met Carina. Omdat Chuck nog steeds gevoelens voor haar had, vroeg ze een overplaatsing aan bij Beckman omdat ze een blok aan het been was, maar dat werd haar geweigerd. Ze slaagden erin om hun situatie gedeeltelijk op te lossen, en Carina toonde Sarah beveiligingsbeelden van Chuck die haar probeerde uit te leggen dat hij ervoor koos om zijn spionnentraining te volgen vanwege Sarah’s eigen aanmoediging, en zijn realisatie dat hij mensen kon helpen en een verlangen om degenen die hij liefhad te beschermen – waaronder haar.

Team Bartowski’s nieuwe leider, Daniel Shaw, begon Sarah romantisch te benaderen in “Chuck Versus the Mask.” Hoewel Sarah aanvankelijk zijn avances luidkeels afwees, gaf Sarah toe dat ze overdreef toen zij en Shaw werden blootgesteld aan cyclosarin-gas en dat ze enigszins genoot van Shaw’s aandacht. Sarah en Chuck kwamen overeen dat ze vrij waren om relaties met andere mensen na te streven, en Sarah begon Shaw toe te laten om dichterbij te komen. In Chuck Versus the Fake Name vertelt Sarah Shaw dat ze door deze baan langzaam vergeet wie ze vroeger was en zegt dat ze de afgelopen drie jaar nog nooit iemand haar echte naam heeft verteld. Als Shaw haar vraagt wat haar echte naam is, onthult Sarah dat haar echte naam Sam is (hoogstwaarschijnlijk van Samantha). Chuck komt ook achter haar echte naam nadat hij dit gesprek afluistert terwijl hij zich voordoet als een huurmoordenaar die de Ring heeft ingehuurd om Shaw te vermoorden. Ze is aanvankelijk nog terughoudend om zich met hem in te laten, maar tegen het einde van de aflevering geeft ze toe.

Sarah diende Chuck’s “eindexamen” als spion toe aan de zijde van Shaw in “Chuck Versus the Final Exam.” Tijdens de missie probeerde Chuck te praten over wat er in Praag was gebeurd, maar de missie onderbrak hen. Hoewel blij met Chuck’s succesvolle afhandeling van de opdracht, was Sarah erg verontrust toen Shaw haar opdroeg hem de opdracht te geven een losgeslagen CIA-agent te doden. Ze probeerde zich te verzetten, uit angst voor wat Chuck daardoor zou worden, maar gaf Chuck uiteindelijk toch zijn instructies. Toen Chuck eindelijk zijn doelwit in het nauw gedreven had, aarzelde hij en Casey voltooide de aanslag vanuit de schaduw, maar vanuit Sarah’s perspectief leek het alsof Chuck de trekker overhaalde. Na de missie weigerde ze op te nemen toen hij probeerde te bellen en sprak ze Shaw haar afkeer uit over wat ze van Chuck had gemaakt. Toen Shaw haar vroeg of ze nog steeds verliefd was op Chuck, antwoordde ze dat ze dat niet meer was.

In “Chuck Versus the American Hero” zet Chuck haar onder druk over hoe hij zich voelt en vraagt om een tweede kans bij Praag. Sarah is aan het inpakken om hem te ontmoeten als Casey arriveert. Hoewel ze volhoudt dat wat hij haar te vertellen heeft haar beslissing niet zal veranderen, geeft Casey toe dat hij de mol heeft gedood, tot Sarah’s zichtbare opluchting, waardoor alle bedenkingen die Sarah tegen Chuck had, worden weggenomen. Maar voor ze kan vertrekken, komt Shaw aan en vertelt haar dat ze een nieuwe missie hebben en dat er geen tijd is om Chuck te contacteren. In Shaw’s auto is Sarah verontrust dat er geen signaal is om Chuck te bellen en vraagt waar ze heen gaan. Shaw vertelt haar alleen dat ze “een oude rekening gaan vereffenen.”

“Chuck Versus the Other Guy” onthulde dat Sarah door Shaw naar een Ring faciliteit werd gebracht, waar hij, vermomd dat ze nog steeds op een missie waren, aan Sarah onthulde dat ze erin was geluisd om Evelyn te vermoorden. Ondanks deze onthulling bleef Sarah Shaw vertrouwen, ondanks Chucks twijfels. Zij en Chuck verzoenden hun gevoelens voor elkaar, toen ze toegaf dat ze voor hem viel voor de climax van de Seizoen 1 pilot. Terwijl ze zich voorbereidden om een relatie te beginnen, lokte Shaw haar naar Parijs en nam haar mee naar de straat waar Evelyn was vermoord, onthullend dat hij zich tot de Ring had bekeerd en van plan was Sarah te doden als vergelding voor de dood van zijn vrouw. Met de hulp van Morgan Grimes, raadde Chuck correct Grimes Shaw’s bedoeling en bestemming en arriveerde op tijd om Sarah’s leven te redden door Shaw neer te schieten toen hij weigerde zich terug te trekken. In tegenstelling tot de dood van Perry, stelde Chuck’s dood van Shaw om haar leven te redden (en zijn aanpak van de situatie als geheel) Sarah gerust, omdat hij zich realiseerde dat hoewel Chuck in staat is om iemand te doden, hij dat pas zal doen als alle andere opties zijn uitgeput. De twee kozen ervoor om een paar dagen samen door te brengen in Parijs voordat ze terugkeerden naar Burbank.

Zij en Chuck deden een poging om samen weg te lopen van het spionnenleven in “Chuck Versus the Honeymooners”, totdat een ontmoeting met een overlopende Baskische terrorist hen hielp beseffen dat ze “het allemaal wilden,” en vastbesloten waren om hun relatie op te bouwen zonder hun carrière op te geven. Hoewel Beckman niet blij was toen ze van het stel hoorde, merkte zelfs zij op: “Het werd verdomme tijd.”

In “Chuck Versus the Role Models” vraagt Chuck haar om bij haar in te trekken, maar ze weigert aanvankelijk. Ze zegt hem dat ze geen “normaal stel” zijn en dus niet moeten doen alsof ze een “normaal leven” hebben. Generaal Beckman geeft hen de opdracht een ervaren spionnenkoppel, de Turners, te observeren. Na het zien van de wankele relatie van de Turners, ontdekken Chuck en Sarah dat hun relatie wel eens een grotere uitdaging zou kunnen zijn dan ze dachten. Sarah stemt er echter mee in om aan het eind van de aflevering bij Chuck in te trekken, zodat ze iets hebben “om op terug te vallen als het spionnenleven voorbij is.”

In “Chuck Versus the Tooth” heeft Sarah, ook al wonen ze samen, nog steeds moeite om haar emoties te uiten aan Chuck. Wanneer Chuck tekenen van een zenuwinzinking begint te vertonen en wordt opgesloten in een psychiatrisch ziekenhuis van de CIA, gelooft en steunt Sarah zijn beweringen dat een Zamibische wetenschapper connecties heeft met de Ring. Hoewel haar onderzoek uitwijst dat Chuck het mis heeft, gaat ze naar zijn dokter en vertelt hem dat ze van Chuck houdt en hem wil helpen zijn problemen op te lossen. Aan het einde van de aflevering vertelt ze Chuck openhartig dat ze van hem houdt.

Sarah worstelt met Chuck die tegen haar liegt in “Chuck Versus the Living Dead” over zijn droom dat Shaw nog leeft. Nadat ze de waarheid van Morgan te weten is gekomen, confronteert ze Chuck en gaat ze samen met Casey door haar relatie met Shaw om aanwijzingen te vinden over zijn verblijfplaats of plannen. Ze breekt met Chuck in Shaw’s penthouse in en haalt Shaw’s Intelligence Safe terug na een confrontatie met een Ring-agent. Als Chucks vader vertrekt, geeft ze Chuck zijn adres en brengt hem naar de hut van Stephen, waar ze Chuck redt uit een val van Ring-agenten. Aan het einde van de aflevering geeft Sarah haar spionnentestament aan Chuck, zeggende dat hij de enige is die ze wil hebben voor het geval er iets met haar gebeurt.

In “Chuck Versus the Subway”, wordt Sarah, samen met Casey en Chuck, gearresteerd door Shaw op beschuldiging van verraad nadat Shaw zijn plan in gang zet om de CIA over te nemen. Terwijl ze zogenaamd naar een detentiefaciliteit worden vervoerd, stopt Shaw de truck en vertelt hen om zich los te maken, van plan om hen te doden en het te laten lijken alsof ze probeerden te ontsnappen, op welk moment Morgan en Devon Casey’s sterk gemodificeerde Crown Victoria gebruiken om de truck op te blazen, Team Bartowski reddend.

In “Chuck Versus the Ring: Part II”, voeren Sarah en Team Bartowski een plan uit om Shaw te ontmaskeren op een beveiligingsconventie. Het plan slaagt en ze zijn in staat om de Ring Elders te identificeren en vast te houden, maar Shaw slaagt erin om te ontsnappen net als Sarah zijn kantoor binnenloopt om Chuck te vinden zwaar verzwakt door zijn laatste poging om te knipperen zonder de gouverneur. Sarah brengt Chuck terug naar Castle als Shaw de Buy More binnenkomt en een aantal bommen plaatst, dreigend de winkel op te blazen tenzij Chuck hem ontmoet. Sarah laat Chuck achter in Castle en ontmoet Shaw alleen, net als Jeff, Lester en Big Mike het brandalarm laten afgaan, waardoor de winkel leegloopt, hoewel Shaw kan voorkomen dat Sarah ontsnapt. Chuck ziet via de monitors in Castle dat Shaw Sarah gegijzeld houdt in de Buy More en slaagt erin op te staan en hem te ontmoeten. Na hun confrontatie besluit Chuck om Shaw niet te doden en Sarah slaat hem bewusteloos, neemt de gouverneur van hem over en geeft hem terug aan Chuck. Later accepteert ze Chucks besluit om zijn belofte aan Ellie na te komen en te stoppen bij de CIA.

Seizoen 4Edit

Aan het begin van het vierde seizoen blijft Sarah werken voor de CIA samen met Casey, terwijl Chuck met pensioen is. “Chuck Versus the Anniversary’ onthult dat de twee opdracht hebben gekregen om Volkoff Industries te onderzoeken, gerund door een beruchte zwarte markt wapenhandelaar. Hun missie sluit aan bij Chuck’s eigen zoektocht naar zijn moeder, waarbij zij en Casey bereid zijn te helpen. De meeste van Sarah’s acties voor de rest van het seizoen draaien rond deze gecombineerde missie en rond de persoonlijke uitdagingen uit haar verleden die ze confronteert als zij en Chuck besluiten om zich te verbinden aan het huwelijk.

Sarah confronteert haar oude middelbare school vijand Heather Chandler opnieuw in “Chuck Versus the Cubic Z.” Heather geeft toe dat ze de route die Sarah momenteel aflegt (met Chuck als haar persoonlijke morele baken) heeft geprobeerd, maar haar aard overweldigde elke neiging tot een normaal leven; ze betwijfelt verder dat Sarah anders zal zijn. Sarah ontkent onder vuur dat ze op Heather lijkt; de twee komen tot een overeenkomst en als vredesaanbod geeft Heather alles op wat ze weet over Project Beacon en Frost (Chuck’s moeder).

In Chuck Versus Phase Three, nadat Chuck gevangen is genomen, gaat Sarah op een losgeslagen missie om hem te vinden, waarbij Casey haar acties beschrijft als die van Langston Graham’s “wild card enforcer,” een kant van haar die hij niet leuk vond. Sarah is het uiteindelijk met Casey eens en zegt: “Ik ben anders zonder Chuck, en dat bevalt me niet.” Wanneer ze hem eindelijk vindt, lost Sarah haar uitgesproken angst voor het huwelijk in meerdere eerdere afleveringen op door een bewusteloze Chuck te vertellen dat ze van hem houdt en de rest van haar leven met hem wil doorbrengen, met of zonder het Intersect.

Sarah vertelt Beckman in “Chuck Versus the Balcony” dat als er iets is dat ze kan doen om Chuck’s moeder terug te brengen, ze haar dat moet laten doen. Net als Chuck op het punt staat haar een aanzoek te doen, wordt ze weggetrokken om haar dekmantel als malafide CIA-agente op te zetten en gaat ze undercover in Volkoff Industries om Mary te helpen deze neer te halen. Nadat Alexei Volkoff is verslagen, doet Chuck uiteindelijk een aanzoek aan Sarah terwijl ze wacht op de komst van Clara Woodcomb.

Het aanstaande huwelijk met Chuck stelt Sarah voor een aantal persoonlijke hindernissen als gevolg van haar jeugd. In “Chuck Versus the Seduction Impossible” begint Chuck’s familie het stel lastig te vallen met vragen over hun trouwplannen, waardoor Sarah in paniek raakt. Ze stelt voor om weg te lopen, omdat ze dan niemand kan uitnodigen voor de grote familiebruiloft die Chuck wenst. Om haar te helpen weer aansluiting te vinden bij haar vrienden, herenigt Chuck Sarah met haar oude team, in “Chuck Versus the Cat Squad”, wat de terugkeer van hun aartsvijand Augusto Gaez en wat interne wrok teweegbrengt. Sarah verdacht haar teamgenoot Zondra er al lang van een verrader te zijn die met Gaez samenwerkte, nadat ze een zender in haar laars had gevonden. Toen bleek dat Amy de verrader was, herstelde Sarah haar vriendschap met Zondra en nodigde haar en Carina uit om haar bruidsmeisjes te zijn. Sarah verdiept ook de vriendschap met Ellie, stemt ermee in om haar familieproblemen te bespreken, en nodigt haar uit om bruidsmeisje te zijn.

In “Chuck Versus the First Bank of Evil”, is Sarah in eerste instantie niet echt enthousiast over het maken van trouwplannen, maar Ellie legt uit dat een portie ervoor zal zorgen dat ze de situatie realistischer maakt, zinspelend op haar eigen factor in haar en Devon’s bruiloft: hun trouwringen. Sarah twijfelt, maar als ze de juiste jurk probeert te vinden, blijkt Ellie’s voorspelling gerechtvaardigd. Aan het eind van de aflevering is Sarah een Bridezilla geworden, tot afschuw van zowel Ellie als Chuck.

Sarah komt weer in contact met haar vader, “Jack Burton,” in “Chuck Versus the Wedding Planner” wanneer de weddingplanner die ze samen met Chuck inhuurt hun spaargeld steelt. Ze slaagt er niet in haar aanstaande huwelijk voor hem te verbergen, en uiteindelijk hebben Jack en Sarah een vader/dochter dans op de receptie. Jack betreurt dat het misschien de enige dans is die ze hebben. Chuck nodigt Jack uit om te blijven, maar hij zegt dat hij geen beloftes aan Sarah wil doen die hij niet kan nakomen. In plaats daarvan laat Jack Sarah haar oude spaarvarken na, waaraan hij alleen geld heeft toegevoegd, nooit heeft genomen, om de kosten van hun bruiloft te dekken.

In “Chuck Versus the Last Details”, ontdekt Vivian dat Chuck’s moeder en vader verantwoordelijk waren voor de ondergang van haar eigen vader, Alexi Volkoff/Hartley Winterbottom. Ze neemt wraak door Sarah aan te vallen met het Norseman-apparaat. Sarah klampt zich ternauwernood vast aan het leven gedurende het grootste deel van Chuck Versus the Cliffhanger, maar wordt gered wanneer Chuck en Hartley het tegengif voor de Norseman van Vivian bemachtigen. Zij en Chuck zijn dan eindelijk getrouwd. Als ze twee weken later terugkomen van hun huwelijksreis, onthullen zij en Chuck aan Casey en Morgan dat Hartley alle rijkdom van Volkoff Industries aan hen heeft overgedragen. Zij en Chuck gebruiken dit geld om de Buy More en Castle te kopen en kondigen aan dat ze van plan zijn om voor zichzelf te beginnen als onafhankelijke spionnen.

Seizoen 5Edit

Sarah’s toewijding aan het spionnenleven neemt af, eerst subtiel, maar in latere afleveringen veel duidelijker. Haar beslissingen worden meer gericht op het gebruiken van haar emoties en het geloven in haar vrienden in plaats van te vertrouwen op wantrouwen, achterdocht en zelfredzaamheid. Het begin van deze mentaliteit begon het meest opmerkelijk in “Chuck Versus the Frosted Tips”, toen ze (correct) geloofde dat Morgan’s drastische verandering in houding meer te wijten was aan een slecht functionerende Intersect dan aan een power trip, zelfs toen Chuck geloofde dat Morgan zich gewoon gedroeg als een overmoedige ezel.

Ze toont verder een afkeer voor haar spionnenleven wanneer ze Chuck vraagt om zich niet te laten re-integreren in de CIA. Deze afkeer gaat verder als ze voorstelt dat Carmichael Industries een Electronic Security Company wordt, waarbij ze zich concentreert op Chuck’s primaire kracht met computers, en de hoeveelheid vuurgevechten minimaliseert waaraan ze zouden worden onderworpen in “Chuck Versus Bo”. Nicholas Quinn’s opkomst en de herintroductie van de Intersect bril leiden er echter toe dat het team een “laatste missie” heeft, die succesvol is, hoewel Quinn Chuck ontvoert in ruil voor de bril. Sarah en Casey gaan hem redden maar lopen in een hinderlaag van Quinn’s mannen en zijn zwaar in de minderheid. Sarah, nadat haar munitie op is, zet de bril op en uploadt het Intersect in haar hoofd, waardoor ze zowel haar als Casey kan redden nadat ze flitst over hoe ze Quinn’s mannen kan neutraliseren en Chuck gaat redden, maar Sarah begint kort daarna last te krijgen van oncontroleerbare flitsen.

Ze wordt ontvoerd door Quinn nadat hij zich realiseert dat ze het Intersect heeft en dwingt haar om te flitsen op Intersect beelden, waardoor haar herinneringen worden gewist, inclusief die van haar relatie met Chuck. Hij manipuleert Sarah dan om te geloven dat hij haar CIA handler is en dat ze orders heeft om hem de Intersect bril te brengen en Chuck te vermoorden. Sarah slaagt erin de bril te bemachtigen, maar Chuck was erin geslaagd ze om te wisselen. Sarah gijzelt Ellie dan als pressiemiddel tegen Chuck en Chuck gaat akkoord om haar de bril te geven en Sarah dreigt Ellie te doden als ze merkt dat het een valstrik is. Terwijl ze naar de plek rijden waar Chuck de bril heeft verstopt, merkt Ellie dat Sarah haar veiligheidsgordel niet draagt en vertelt haar dat als ze haar herinneringen terug had, ze zou willen dat ze alles zou doen om Chuck te beschermen en dan crasht haar auto, waardoor Sarah bewusteloos raakt. Chuck vertelt Ellie dan dat hij weet waar hij Sarah heen moet brengen om haar te helpen haar herinneringen terug te krijgen. Sarah ontwaakt in het huis dat Chuck en zij hadden gepland om te kopen en Chuck vertelt haar dat hij haar daarheen heeft gebracht in de hoop dat zij zich het huis zou herinneren, maar niet hem. Sarah vertelt hem dat hun relatie niets meer was dan een dekmantel en hij slechts een opdracht. Chuck vertelt haar dat hij een opdracht was, maar dat ze verliefd op hem werd. Met tranen in zijn ogen vertelt hij haar dat hun eerste echte, niet-cover kus was toen ze dachten dat ze zouden sterven door een bom en hoe hij zijn ogen sloot en voelde hoe ze hem vastpakte en kuste en hoe ze probeerden te doen alsof het nooit gebeurd was en hoe hij er op een dag zo zeker van was dat ze nooit van een nerd als hij kon houden, ze naar hem toe kwam en hij vroeg of ze van hem hield en dat ze ja zei. Chuck vertelt haar dan dat toen hij haar ten huwelijk vroeg, ze wisten dat ze voor de rest van hun leven samen zouden zijn, in dit huis zouden wonen en een gezin zouden stichten.

Chuck vertelt Sarah dan dat hij haar een keuze gaat geven: ze kunnen opnieuw beginnen of ze kan de bril nemen en hem nooit meer zien. Sarah vraagt dan of Chuck echt van haar houdt, waarop hij antwoordt: “Met heel mijn hart.” Sarah vertelt Chuck dan dat het haar spijt dat ze haar werk te goed heeft gedaan en dat ze de missie gaat afmaken. Als ze probeert de bril te pakken, pakt Chuck hem voor haar weg en ze krijgen een handgemeen, waarbij Chuck weigert terug te vechten. Dan schopt ze hem van de trap en neemt de bril en richt dan haar pistool op zijn hoofd. Chuck zegt haar dat ze hem kan doden, maar dat hij haar nooit pijn zal doen. Sarah ziet dan het houtsnijwerk met hun namen en herinnert zich dat ze die heeft geschreven. Op dat moment arriveert Quinn, neemt de bril af en vertelt Sarah dat Chuck gelijk had over hem en haalt een pistool tevoorschijn om haar mee neer te schieten. Chuck springt dan voor de kogel en wordt in de rug geschoten. Sarah probeert Quinn neer te schieten, maar hij ontsnapt. Ze knielt dan naast Chuck neer om te zien of hij in orde is en hij vertelt haar dat hij een vest draagt. Als ze de sirenes hoort, vertelt Chuck haar dat de CIA voor haar komt en zegt haar dat ze moet vluchten.

Terug bij haar thuis is Sarah snel haar spullen aan het pakken als Casey door de deur loopt. Ze trekt een mes, maar Casey vertelt haar dat hij er niet is om te vechten. Hij vraagt wat ze zich van hem herinnert waarop Sarah zijn reputatie antwoordt: dat hij onvriendelijk is, niet vergevingsgezind en zonder vragen te stellen over bevelen. Casey grinnikt en zegt dat mensen hetzelfde over haar zeiden toen ze elkaar voor het eerst ontmoetten en zegt dat dat waarschijnlijk de reden was dat ze nooit met elkaar konden opschieten. Sarah vraagt als ze niet met elkaar konden opschieten, waarom hij dan nu hier was en Casey haalt een envelop uit zijn jas en legt die voor haar neer, terwijl hij zegt dat Chuck hen uiteindelijk allebei zacht heeft gemaakt. Hij vertelt haar dat de twee in de afgelopen vijf jaar zijn veranderd en dat ze vrienden zijn geworden. Casey zegt Sarah dat ze voor zichzelf moet zorgen en gaat dan weg. Sarah opent dan de enveloppe die hij achterliet en haalt er een schijfje met missielogs uit. Ze bekijkt ze en er staat op hoe ze verliefd is geworden op Chuck en zelfs een bevestiging van de kus waar Chuck haar over had verteld.

Sarah verschijnt dan bij Chuck’s appartement net als hij op het punt staat naar binnen te gaan. Sarah vertelt hem dat ze alles gelooft wat hij over hen heeft gezegd, maar dat ze het niet voelt. Chuck vraagt haar waarom ze daar nu is en Sarah vertelt hem dat ze sorry wilde zeggen voor alles wat er gebeurd is en dat ze afscheid wilde nemen. Ze vertelt Chuck dat ze Quinn gaat zoeken. De twee nemen afscheid en dan vertrekt Sarah.

Sarah zet vervolgens de achtervolging in op Quinn, en komt erachter dat hij probeert om The Key weer in elkaar te zetten, een apparaat dat de oorspronkelijke functie van de Intersect kan wijzigen. Wanneer ze er niet in slaagt hem in een vliegtuig te stoppen, gaat ze terug naar Chuck om zijn hulp te vragen. Ze sporen Quinn op naar Berlijn, waar ze per toeval de gebeurtenissen uit de piloot begint na te spelen. Ze maakte echter de fout ervan uit te gaan dat Chuck Quinn zou doden, waardoor Quinn niet alleen kon ontsnappen, maar ook per ongeluk Casey’s helikopter neerschoot in het proces. Terug opgesloten in Castle, werd Sarah overtuigd om met het team samen te werken als ze Quinn probeerden te stoppen. Sarah wordt gedwongen Quinn neer te schieten als hij naar zijn wapen grijpt, waardoor hun kansen om de bom waar Beckman op zit te deactiveren verkeken zijn. Chuck besluit dan dat hij het Intersect terug in zijn hoofd moet uploaden om uit te zoeken hoe hij de bom onschadelijk kan maken, en zo de enige kans voor Sarah om haar herinneringen terug te krijgen te elimineren. Hij krijgt het Intersect, maar kan er niet achter komen hoe de bom onschadelijk te maken als hij eenmaal op de computer zit. Sarah stelt voor om op internet te zoeken naar “Irene Demova” (een pornovirus), wat Chuck doet en verbaasd is dat ze dat weet, erop wijzend dat het van vijf jaar geleden is en dat de bom onschadelijk wordt gemaakt nadat het virus het heeft laten crashen

Na afloop voelt Sarah zich onzeker over zichzelf omdat haar herinneringen nog steeds niet volledig zijn teruggekeerd en vertelt Chuck dat ze tijd alleen nodig heeft om erachter te komen wie ze is. Chuck vindt haar later op het strand, erop wijzend dat het hetzelfde strand was waar ze waren na hun eerste “date” toen Sarah hem vertelde om haar te vertrouwen en dat hij nu hetzelfde doet, haar vragen om hem te vertrouwen. Hij vertelt Sarah dat het niet uitmaakt waar ze naartoe gaat, hij zal er altijd voor haar zijn. Sarah vraagt Chuck om haar over hun verhaal te vertellen, wat hij doet. Als hij klaar is, stelt Chuck voor dat ze Morgan’s theorie proberen en een “magische kus” geven om te zien of haar herinneringen zullen terugkeren. Sarah zegt Chuck haar te kussen. Ze delen een kus, waarmee de serie eindigt. Of dit betekent dat Sarah’s herinneringen terug zullen komen of dat ze helemaal opnieuw verliefd zal moeten worden op Chuck blijft onbekend.