Saccharomyces genome database

Het doel van de Saccharomyces Genome Database (SGD) is informatie te verschaffen over het genoom van deze gist, de genen die erdoor gecodeerd worden, en hun biologische functies. De genoomsequentie van S. cerevisiae biedt de structuur waarrond de informatie in SGD wordt georganiseerd; de sequentie wordt aangevuld door zorgvuldige biologische annotatie uit een aantal bronnen. SGD verzamelt en bewaart informatie over DNA- en eiwitsequenties van kiemgisten, over genetica, celbiologie en over de verwante gemeenschap van onderzoekers. SGD biedt ook zoek- en analyse-instrumenten om onderzoekers te helpen de gegevens te doorzoeken op stukken of patronen van biologische informatie die relevant zijn voor hun interesses. Een voortdurende uitdaging voor het SGD-personeel is actuele informatie over gistgenen te presenteren in een formaat dat intuïtief en nuttig is voor biomedische onderzoekers, en tegelijkertijd in te spelen op de behoeften van deze gemeenschap door middelen en hulpmiddelen te bieden om de gegevens op nieuwe manieren te onderzoeken. Dit hoofdstuk beschrijft de organisatie van SGD, de bronnen van de gegevens die in SGD zijn opgeslagen, enkele methoden om informatie uit de database te halen, connecties die SGD heeft met externe databases en onderzoeksgemeenschappen buiten de gistgemeenschap, en SGD’s repository van informatie over de gistgemeenschap.