Loggains was van 2012 tot 2013 offensief coördinator bij de Tennessee Titans en maakte deel uit van de coachingstaf van Mike Munchak. Enkele dagen nadat Ken Whisenhunt het roer overnam als hoofdcoach van de Titans in 2014, kreeg Loggains te horen dat hij niet bij de organisatie zou blijven. Hij was eerder de quarterbacks coach van het team.
Loggains bracht 2014 door als de quarterbacks coach voor de Cleveland Browns. Hij was een voorstander van het opstellen van Texas A&M quarterback Johnny Manziel.
Het volgende jaar was Loggains op zoek naar een baan. Hij werd geïnterviewd voor een baan als offensive coordinator door de New York Giants, maar werd in plaats daarvan op 23 januari 2015 door de Bears aangenomen als quarterbacks coach. Onder Loggains’ roer had quarterback Jay Cutler een van zijn beste seizoenen, want hij eindigde 2015 met 3.629 passing yards, 21 touchdowns, 11 interceptions, en career highs in passer rating (92.3) en completion percentage (64.4). De 11 interceptions waren de laagste in zijn carrière en resulteerde in een interception percentage van 2.3, de laagste in een seizoen waarin hij ten minste 12 wedstrijden heeft gestart, terwijl 21 touchdowns zijn op een na meeste waren sinds 2011 en de 3.629 yards waren de op twee na meeste in zijn carrière. Op third down, Cutler had een 103.2 passer rating (vierde in de NFL) na het invullen van 91 van 141 passes voor 1.242 yards, zeven touchdowns en twee interceptions. Daarentegen voltooide tegen de Seattle Seahawks reserve quarterback Jimmy Clausen 9 van de 17 passes voor 63 yards, en inclusief sacks, noteerde hij 48 netto passing yards, de tweede keer sinds het seizoen 1990 dat de Bears minder dan 50 netto yards passing hadden. De Bears eindigden het jaar met 228.9 passing yards per wedstrijd, 23e in de competitie, met een gecombineerd quarterbacking percentage van 63.9 completion percentage en 2.3 interception percentage, beide derde in de geschiedenis van het team, samen met 3.843 bruto passing yards en een 42.5 third down percentage (vierde).5 derde down percentage (vierde), 3.660 netto passing yards (vijfde), samen met 5.514 totale netto yards en een 89,7 passer rating (zesde).
Loggains werd gepromoveerd tot offensief coördinator op 11 januari 2016, toen Adam Gase de positie verliet om de hoofdcoach van de Miami Dolphins te worden. De Bears worstelden tijdens Loggains’ ambtstermijn als OC, met een ranglijst van november 2017 door ESPN die hem als dood laatste plaatste onder 32 playcallers, terwijl de offense het seizoen 2017 eindigde met een gemiddelde van slechts 16,5 punten per wedstrijd (29e in de competitie). Nadat hoofdcoach John Fox was ontslagen, herenigde Loggains zich met Gase in Miami, en landde een andere offensieve coördinatorpositie.
Op 23 januari 2019 herenigde Loggains zich opnieuw met Adam Gase nadat hij was ingehuurd als de offensieve coördinator / quarterbacks coach voor de New York Jets.Op 25 oktober 2020, in afwachting van de Week 7 matchup tegen de Buffalo Bills, gaf Hoofd Coach Adam Gase offensieve play calling-taken op en gaf ze aan Loggains. Ondanks een sterke prestatie in de eerste helft met een 10-6 voorsprong, slaagde Loggains er niet in om momentum te krijgen in de tweede helft, culminerend in een 18-10 verlies tegen Buffalo. Op 28 oktober 2020, voor de wedstrijd tegen de Kansas City Chiefs, werd gemeld dat Loggains opnieuw de offensieve speloproepende taken zou krijgen.