Laatste R-waarde en groeipercentage

Een R-waarde tussen 0,7 en 1,0 betekent dat gemiddeld elke 10 besmette mensen tussen 7 en 10 andere mensen besmetten.

Een groeipercentage tussen -5% en -2% betekent dat het aantal nieuwe besmettingen elke dag met 2% tot 5% afneemt.

De Britse schattingen van R en groeipercentage zijn gemiddelden over verschillende epidemiologische situaties en moeten eerder worden beschouwd als een leidraad voor de algemene trend dan als een beschrijving van de epidemische toestand. Gezien de steeds meer lokale aanpak van de beheersing van de epidemie, met name tussen naties, zijn schattingen op het niveau van het VK minder zinvol dan voorheen.

Deze schattingen geven de overdracht van COVID-19 in de afgelopen weken weer als gevolg van de tijd die verstrijkt tussen het moment dat iemand besmet is, symptomen heeft en gezondheidszorg nodig heeft.

Laatste door NHS England regio’s

Dit zijn de meest recente schattingen van R en groeipercentage door NHS England regio’s.

Wanneer het aantal gevallen of sterfgevallen op een laag niveau ligt en/of er een hoge mate van variabiliteit in de overdracht in een regio is, moet voorzichtigheid worden betracht bij de interpretatie van schattingen van R en het groeipercentage. Zo kan een aanzienlijke variabiliteit in een regio als gevolg van een lokale uitbraak betekenen dat één enkele gemiddelde waarde geen juist beeld geeft van de wijze waarop de infecties in die regio veranderen.

Het is echter de deskundige mening van SAGE dat de schattingen van deze week betrouwbaar zijn.

De schattingen voor R- en groeicijfers worden weergegeven als een bereik, en de werkelijke waarden liggen waarschijnlijk binnen dit bereik.

Zie een tijdreeks van gepubliceerde schattingen van R- en groeicijfers (ODS, 20KB) vanaf 29 mei 2020 voor:

• UK
• England
• de 7 regio’s van NHS England

Het document met tijdreeksen wordt regelmatig bijgewerkt.

Laatste voor gedeconcentreerde administraties

De laatste reeksen voor R-waarden in de gedeconcentreerde administraties worden gepubliceerd op hun respectieve websites:

• Raming van Noord-Ierland
• Raming van Schotland
• Raming van Wales (Cymraeg)

Andere belangrijke statistieken

De ONS-infectie-enquête geeft informatie over:

• het aantal nieuwe infecties van de ziekte dat gedurende een bepaalde periode is vastgesteld (incidentie)
• het deel van de bevolking dat op een bepaald tijdstip in de gemeenschap positief test op de ziekte (positiviteitspercentage of prevalentie)

Andere gegevens over testen, gevallen, gezondheidszorg en sterfgevallen zijn beschikbaar op het dashboard Coronavirus (COVID-19) in het VK.

Over R en groeisnelheid

R

Het reproductiegetal (R) is het gemiddelde aantal secundaire infecties dat door één besmette persoon wordt veroorzaakt.

Een R-waarde van 1 betekent dat gemiddeld elke persoon die besmet is, 1 andere persoon zal besmetten, wat betekent dat het totale aantal infecties stabiel is. Als R 2 is, besmet elke besmette persoon gemiddeld nog eens 2 mensen. Als R 0,5 is, dan zal er gemiddeld voor elke 2 besmette personen slechts 1 nieuwe besmetting zijn. Als R groter is dan 1 groeit de epidemie, als R kleiner is dan 1 krimpt de epidemie. Hoe hoger R boven 1 is, hoe meer mensen 1 besmet persoon infecteert en dus hoe sneller de epidemie groeit.

R kan in de loop van de tijd veranderen. Hij daalt bijvoorbeeld wanneer het aantal contacten tussen mensen afneemt, waardoor de transmissie vermindert. R neemt toe wanneer het aantal contacten tussen mensen toeneemt, waardoor de virale overdracht toeneemt.

Groeisnelheid

De groeisnelheid geeft aan hoe snel het aantal infecties van dag tot dag verandert. Het is een benadering van de procentuele verandering in het aantal infecties per dag. Als het groeipercentage groter is dan 0 (+ positief), dan groeit de epidemie. Is het groeipercentage kleiner dan 0 (- negatief), dan krimpt de epidemie.

De grootte van het groeipercentage geeft de snelheid van de verandering aan. Een groeipercentage van +5% geeft aan dat de epidemie sneller groeit dan een groeipercentage van +1%. Evenzo geeft een groeipercentage van -4% aan dat de epidemie sneller krimpt dan een groeipercentage van -1%. Meer technische informatie over groeipercentages is te vinden op het tijdschrift Plus.

Hoe groeipercentages verschillen van R-schattingen

R alleen zegt ons niet hoe snel een epidemie verandert. Verschillende ziekten met dezelfde R kunnen epidemieën veroorzaken die met zeer verschillende snelheden groeien. Zo kan het bij 2 ziekten, beide met R=2, heel verschillend zijn hoe lang het duurt voordat 1 besmet individu 2 andere mensen besmet; bij de ene ziekte duurt dat jaren, bij de andere dagen.

De groeisnelheid geeft ons informatie over de omvang en de snelheid van de verandering, terwijl de R-waarde ons alleen informatie geeft over de richting van de verandering.

Om R te berekenen is informatie nodig over de tijd die tussen elke generatie van infecties ligt. Dat wil zeggen hoe lang het duurt voordat een groep mensen in een geïnfecteerde groep een nieuwe groep mensen in de volgende groep infecteert. Dit kan afhangen van verschillende biologische, sociale en gedragsfactoren. Het groeipercentage is niet afhankelijk van de “generatietijd” en vereist dus minder aannames om te schatten.

Geen van beide maten, R noch groeipercentage, is beter dan de andere, maar beide geven informatie die nuttig is bij het toezicht op de verspreiding van een ziekte.

De schattingen van groeipercentages en R worden regelmatig bijgewerkt. Zij zijn echter niet de enige belangrijke maatstaven voor de epidemie. Beide moeten worden beschouwd naast andere maatstaven voor de verspreiding van de ziekte, zoals het aantal nieuwe ziektegevallen dat gedurende een bepaalde periode wordt vastgesteld (incidentie), en het deel van de bevolking dat op een bepaald tijdstip de ziekte heeft (prevalentie). Als R gelijk is aan 1 met 100.000 mensen die momenteel besmet zijn, is dat een heel andere situatie dan wanneer R gelijk is aan 1 met 1.000 mensen die momenteel besmet zijn. Het aantal mensen dat momenteel besmet is met het coronavirus (COVID-19) – en dus in staat is het virus door te geven – is dus van groot belang.

Hoe R en groeipercentages worden geschat

Afzonderlijke modelgroepen gebruiken een reeks gegevens om groeipercentages en R-waarden te schatten, waaronder:

• epidemiologische gegevens zoals testgegevens, ziekenhuisopnames, ICU-opnames en sterfgevallen – het duurt in het algemeen tot 3 weken voordat veranderingen in de verspreiding van de ziekte in de schattingen worden weerspiegeld vanwege de tijd die verstrijkt tussen de eerste besmetting en de noodzaak van ziekenhuiszorg
• contactpatroononderzoeken die informatie verzamelen over gedrag – deze kunnen sneller zijn (met een vertraging van ongeveer een week), maar zijn vatbaar voor vertekening omdat zij vaak afgaan op zelfzelfgerapporteerd gedrag en aannames maken over hoe de verzamelde informatie verband houdt met de verspreiding van de ziekte
• onderzoeken naar besmetting van huishoudens waarbij swabs worden afgenomen bij individuen – deze kunnen schattingen opleveren van het aantal mensen dat besmet is. Longitudinale onderzoeken (waarbij herhaaldelijk monsters worden genomen bij dezelfde mensen) maken een meer directe schatting mogelijk van de groei van het aantal infecties

Verschillende modelleringsgroepen gebruiken verschillende gegevensbronnen om deze waarden te schatten met behulp van wiskundige modellen die de verspreiding van infecties simuleren. Sommigen gebruiken zelfs al deze informatiebronnen om hun modellen aan te passen zodat ze de werkelijke situatie beter weerspiegelen. Er is onzekerheid in al deze gegevensbronnen, zodat de ramingen tussen de verschillende modellen kunnen variëren, zodat we ons niet op slechts één model baseren. Gegevens uit verschillende modellen worden in overweging genomen, besproken en gecombineerd, en het groeipercentage en de R worden vervolgens gepresenteerd als bandbreedtes. De meest waarschijnlijke werkelijke waarden liggen ergens binnen de bandbreedtes.

Rounding en verschillen tussen de datastromen die worden gebruikt in deze afzonderlijke modeloutputs die worden gecombineerd, verklaren de verschillen tussen de schattingen van R en de geschatte groeipercentages.

Wie schat R en groeipercentages

Groeipercentages en R worden geschat door verschillende onafhankelijke modelleringsgroepen die zijn gevestigd in universiteiten en Public Health England (PHE). De modelleringsgroepen bespreken hun individuele R-schattingen op de Science Pandemic Influenza Modelling group (SPI-M) – een subgroep van SAGE.

Tijdvertraging van de schattingen

SPI-M gebruiken verschillende modellen, die elk gegevens uit verschillende bronnen gebruiken in hun schattingen van R en groeipercentage. Epidemiologische gegevens, zoals ziekenhuisopnames, IC-opnames en sterfgevallen, hebben gewoonlijk tot 3 weken nodig om veranderingen in de verspreiding van de ziekte weer te geven.

Dit is te wijten aan de tijd die verstrijkt tussen de eerste besmetting, het hebben van symptomen en de noodzaak van ziekenhuiszorg. Als gevolg daarvan geven de laatst gepubliceerde cijfers de situatie van de afgelopen weken weer en niet die van vandaag. Deze schattingen weerspiegelen nog niet volledig eventuele zeer recente veranderingen in de transmissie als gevolg van bijvoorbeeld recente beleidswijzigingen in het VK.

Beperkingen van R

R is een gemiddelde waarde die kan variëren in verschillende delen van het land, gemeenschappen, en subsecties van de bevolking. Zij kan niet rechtstreeks worden gemeten, zodat er altijd onzekerheid bestaat rond haar exacte waarde. Dit wordt nog problematischer wanneer R wordt berekend aan de hand van kleine aantallen gevallen, als gevolg van lagere besmettingspercentages of kleinere geografische gebieden. Deze onzekerheid kan te wijten zijn aan variabiliteit in de onderliggende gegevens, wat leidt tot een breder bereik voor R en frequentere veranderingen in de schattingen.

Zelfs wanneer de algemene Britse R-schatting onder 1 ligt, kunnen sommige regio’s R-schattingen hebben die een bereik hebben dat groter is dan 1, bijvoorbeeld van 0,7 tot 1,1; dit betekent niet noodzakelijk dat de epidemie in die regio toeneemt, alleen dat de onzekerheid betekent dat dit niet kan worden uitgesloten. Het is ook mogelijk dat een uitbraak op één specifieke plaats resulteert in een R boven 1 voor de hele regio.

Beperkingen van groeicijfers

Het groeicijfer is een gemiddelde waarde die kan variëren. Wanneer het aantal gevallen laag is, neemt de onzekerheid toe. Dit kan het geval zijn wanneer slechts een zeer klein deel van de mensen besmet is, of wanneer het geografische gebied in kwestie een zeer kleine bevolking heeft. Een kleiner aantal gevallen betekent dat de variabiliteit in de onderliggende gegevens het moeilijk maakt het groeipercentage te schatten; er zal een grotere marge voor het groeipercentage worden gegeven en de schattingen zullen vaak veranderen. Dit geldt zowel voor R als voor de groeisnelheid. De schatting van de groeisnelheid vereist echter minder veronderstellingen over de ziekte dan R.

Zelfs wanneer de totale Britse schatting van de groeisnelheid negatief is (onder 0), kunnen sommige regio’s schattingen van de groeisnelheid hebben die een bandbreedte omvatten die positief is (boven 0), bijvoorbeeld van -4% tot +1%. Dit betekent niet noodzakelijk dat de epidemie in die regio toeneemt, maar alleen dat zij door de onzekerheid niet kan worden uitgesloten. Het is ook mogelijk dat een uitbraak op één specifieke plaats resulteert in een positief groeipercentage (boven 0) voor de hele regio.

Ramingen van het groeipercentage voor geografische gebieden die kleiner zijn dan het regionale niveau, zijn minder betrouwbaar en het is meer aangewezen lokale hotspots te identificeren door bijvoorbeeld het aantal gevallen, ziekenhuisopnames en sterfgevallen te monitoren.