De logP-waarde van een verbinding, die de logaritme is van zijn verdelingscoëfficiënt tussen n-octanol en water log(coctanol/water), is een gevestigde maatstaf voor de hydrofiliciteit van de verbinding. Lage hydrofielheden en dus hoge logP-waarden veroorzaken een slechte absorptie of permeatie. Er is aangetoond dat de logP-waarde van verbindingen niet hoger mag zijn dan 5,0, willen zij een redelijke kans hebben om goed geabsorbeerd te worden. De verdeling van de berekende logP-waarden van meer dan 3000 geneesmiddelen op de markt onderstreept dit feit (zie diagram)

Onze eigen logP-berekeningsmethode is geïmplementeerd als een incrementensysteem waarbij de bijdragen van elk atoom op basis van zijn atoomtype worden opgeteld. Alles bij elkaar onderscheidt de cLogP-voorspellingsmachine 368 atoomtypen die zijn samengesteld uit verschillende eigenschappen van het atoom zelf (atoomnummer en ringlidmaatschap) en zijn directe buren (bindingstype, aromaticiteitsstatus en gecodeerd atoomnummer). Meer dan 5000 verbindingen met experimenteel bepaalde logP-waarden werden gebruikt als trainingsset om de 369 bijdragewaarden geassocieerd met de atoomtypen te optimaliseren. De correlatieplot (zie diagram) toont berekendeversus experimenteel bepaalde logP-waarden van een onafhankelijke testset van meer dan 5000 verbindingen die verschillen van de trainingsset.