4つの基本的条件のいずれか、あるいは組み合わせによって、乳幼児の一次運動反射機能不全やより深い病態を引き起こすことがあります。

これらの条件はそれぞれ中枢神経系、感覚系、運動系に障害を起こす可能性があります。 また、先天性疾患、外傷、非先天性疾患は、運動反射プログラムを作動させるのに必要な生来の神経経路を遮断したり、損傷させたりすることがあります。

先天性障害

先天性障害は、遺伝子異常（例：色覚異常、ダウン症、嚢胞性線維症）または催奇形性の影響（出生異常を引き起こす母性関連の問題）によって発生することがあります。 これらには、

原因にかかわらず、先天性障害を持つ赤ちゃんがこの世に生まれてくるとき、生来の反射プログラムを働かせるために必要な神経経路が遮断されたり損傷したり、あるいは、乳幼児の一次運動反射が出現し機能するために必要な神経感覚運動系の1つが損なわれる可能性もあります。

外傷または疾患

外傷は、正常な身体的または精神的機能を破壊する衰弱をもたらす、生命を脅かす予期せぬ出来事と定義される。 外傷は身体的および精神的な衰弱をもたらすことがある。 身体的外傷は、子宮内、出産過程、出生時、出生後のどの時点でも起こりうるもので、胎内や出生時の合併症、事故、暴力的攻撃、自然災害などが原因となることがあります。 心の傷は、ネグレクト、虐待、社会的孤立や分離、屈辱、恐ろしい出来事の目撃、愛する人の死などによって引き起こされることがあります。 胎内で、あるいは乳幼児の一次反射の典型的な成熟期にトラウマが起こると、神経経路の閉塞や損傷、神経感覚運動系の障害などが反射の出現、成熟、統合に影響を与えます。

一次反射パターンが統合した後に生命を脅かすトラウマが起こると、自律神経系が行動適応固定化戦略として、再び一次反射を出現させることがあります。 1994年、スティーブン・ポージェスはポリバガル理論の一環として、この行動適応戦略が、自律神経系が身体の生存を確保するために自動的に行う3つの生存戦略のうちの1つであることを提唱しました。 (身体の行動適応戦略に関する詳細については、スティーブン・ポージェスの反射理解への貢献を参照) 幼児の一次運動反射が再び表面化した場合、知識のあるリソースがその存在を確認し、その統合を促進する技術を使用するまで、それはしばしば存在したままとなるのです。

反射機能障害&長期の間欠的ストレスまたは慢性ストレス

Walter Cannonの初期の研究は、自律神経系が日常の正常な機能として体内で2つの一般的な状態を管理していることを明らかにしました。

1. 非アラーム状態
自律神経系の副交感神経サブシステムによって管理される。 副交感神経系は
長期的な生存を確保するために、非警戒状態において体内の機能を正常化する役割を担っている。

2.警報状態
自律神経系の交感神経サブシステムによって管理される。 短期的な生存を確保するために、体内の動員状態
に関与する責任を負う。

これら2つの自律神経サブシステム（副交感神経と交感神経）は、身体の内部アラーム状態に基づいて、一方のシステムが多かれ少なかれコントロールされながら共生的に機能しています。 ハンス・セリエは、副交感神経系が一定の頻度で正常な機能を回復させることなく交感神経系が優位なコントロールを維持すると、身体内部の生理学的損傷を維持するだけでなく、効果的に機能し、感情や行動の安定を維持するための全体的能力が低下し始めることを明らかにした。 これが典型的な乳幼児期の運動反射の成熟期に起こると、基礎となる神経感覚運動機能に問題が生じ、反射が成熟し統合されることが困難になる可能性があります。 乳児の一次運動反射がすべて統合された後に発生した場合、通常は身体の短期的な生存システムによって効果的に管理されている低レベルの外傷が、反射パターンを再浮上させる引き金となります。

非先天性疾患

生後しばらくして発症し、遺伝的な問題に起因しない疾患は、先に述べた神経経路や神経感覚運動系の問題を引き起こす可能性があります。

神経経路の遮断または損傷

神経経路が遮断または損傷すると、体はしばしば代替の関連経路を通じて生来の反射運動プログラムを作動させようとする。 遮断や損傷の大きさによって、その結果生じる幼児の一次的な運動反射は以下のようになる。

Alexander Luriaの研究により、ブロックされた神経経路は「脱抑制」（活性化）でき、損傷した経路は脳の機能関連経路を通じて回復できることが証明された。 生得的な運動反射プログラムは、どのような障害があっても遺伝的にプログラムされているため、神経経路の抑制を解除したり、機能的に関連する経路を通じて回復させると、機能が改善したり、時には回復することもあるのです。 その結果は、存在する問題の大きさに依存します。

Compromised Systems

先天性疾患がある場合、外傷がある場合、または長期にわたる断続的もしくは慢性的なストレスがある場合、問題は、初生児の運動反射統合に必要な基礎となる神経感覚運動系 (感覚系、中枢および末梢系、運動系) がどのように影響を受けているかということです。 これらのシステムのいずれかの組み合わせが正しく機能していない場合、一次乳幼児の反射が適切に統合されない可能性があります。

感覚系

先天性の違いの結果、個人の感覚系は過剰反応、過小反応、または機能しないことがあります。 外傷や長期にわたる慢性的または断続的なストレスの場合、正常に機能していた感覚系が過敏になったり、過少になったり、まったく機能しなくなったりすることがある。 傷は深く切り裂かれたように、軽いタッチは攻撃的に押されたように、日常の音は黒板を引っ掻く爪のように、単純な視線はにらまれたように感じることがあるのです。 同じように、感覚系の反応が鈍い人は、ちょっとした刺激、あるいは適度な刺激にさえ反応しないことがあります。 深い切り傷は簡単な引っかき傷のように感じられ、攻撃的な押しの強さは軽いタッチのように感じられ、黒板の上の爪は他の音のように、まぶしい視線は単純なアイコンタクトのように感じられます。 いずれの場合も、感覚系が環境を誤って解釈し、現実とかけ離れた感覚入力を中枢神経系に送っているのです。

知覚が現実であるため、中枢神経系は受け取った入力に基づいて内外の反応を調節・指示し、対応する過剰反応や過小反応を発生させるのです。 外界からは、感覚系に障害のある人は感情や行動が制御不能に見えるが、実際には、発生する感情の大きさや示される行動は、障害のある感覚系の適切な過剰反応や過小反応を反映している。 過剰に反応した感覚系は、交感神経系の「アラーム状態」動員システムを過剰に作動させ、身体の回復と成長の課題を引き起こす可能性があります。

反応不足の感覚系は、副交感神経系が「非アラーム状態」に過剰に作用する原因となります。 副交感神経系の目的は、長期的な生存を確保するために身体を回復・成長させることですが、感覚入力が危険または生命を脅かすものであるときに身体が理解できなければ、生存を確保するための動員または固定化戦略をとらないことになります。 言い換えれば、反応性の低い感覚系を持つ人は、危険で生命を脅かす状況下で危害を受けやすく、リスクの高い活動に従事しやすい場合が多いのです。

運動系

先天性または外傷性事象の結果として、運動反応は機能不全から病的なものまで様々である。 機能不全の運動反応は、筋肉の緊張が強すぎ、筋肉の緊張が過剰に発達し、筋肉が硬すぎて十分に伸展できず、機能的な可動域が制限される過活動、または筋肉の緊張が弱すぎ、筋肉の緊張が不足し、筋肉が柔らかすぎて身体を制御または支持できない低活動の可能性がある。 機能不全反応よりも性質が重くなる病的な運動反応は、以下のようなものである可能性がある。

機能不全または病理的運動反応を示す乳児一次運動反射は適切に統合されないだろう。

中枢神経系（CNS）

正常な状態では、CNSは体の内外の感覚信号に対する適切な反応を仲介する役割を活発に果たし、基本的な身体機能および活動がうまく調節されるようにします。 先天性障害、外傷、疾患、長期にわたる断続的または慢性的なストレスにより、CNSの機能が低下すると、入力される感覚情報が遮断されたり、誤って解釈されたり（過小または過大）、出力される指令が機能不全（低反応、過敏、過小反応）または病的（非反応、不正確または逆）な運動反応になることがある。 このような理由から、発達段階にそぐわない乳幼児の一次反射の存在は、神経学的な問題の可能性を示すものとして、長い間、医療専門家によって捉えられてきました

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