Saccharomyces genome database

L’obiettivo del Saccharomyces Genome Database (SGD) è di fornire informazioni sul genoma di questo lievito, sui geni che codifica e sulle loro funzioni biologiche. La sequenza del genoma di S. cerevisiae fornisce la struttura attorno alla quale sono organizzate le informazioni in SGD; il valore è aggiunto alla sequenza da un’attenta annotazione biologica tratta da una serie di fonti. SGD raccoglie e archivia informazioni sul DNA del lievito in erba e sulle sequenze proteiche, sulla genetica, sulla biologia cellulare e sulla comunità di ricercatori associata. SGD fornisce anche strumenti di ricerca e analisi progettati per aiutare i ricercatori ad estrarre i dati alla ricerca di pezzi o modelli di informazioni biologiche rilevanti per i loro interessi. Una sfida continua per lo staff di SGD è quella di presentare informazioni aggiornate sui geni del lievito in un formato che sia intuitivo e utile per i ricercatori biomedici, rispondendo al contempo alle esigenze di questa comunità fornendo risorse e strumenti per esplorare i dati in modi nuovi. Questo capitolo descrive l’organizzazione di SGD, le fonti dei dati memorizzati in SGD, alcuni metodi per recuperare informazioni dal database, le connessioni che SGD ha con database esterni e comunità di ricerca non-lievito, e il repository di SGD di informazioni sulla comunità del lievito.