L’ultimo R e il tasso di crescita

Un valore R tra 0,7 e 1,0 significa che, in media, ogni 10 persone infettate infetteranno tra 7 e 10 altre persone.

Un tasso di crescita compreso tra -5% e -2% significa che il numero di nuove infezioni si sta riducendo tra il 2% e il 5% ogni giorno.

Le stime britanniche di R e del tasso di crescita sono medie su diverse situazioni epidemiologiche e dovrebbero essere considerate come una guida alla tendenza generale piuttosto che una descrizione dello stato epidemico. Dato l’approccio sempre più localizzato alla gestione dell’epidemia, in particolare tra le nazioni, le stime a livello del Regno Unito sono meno significative che in precedenza.

Queste stime rappresentano la trasmissione di COVID-19 nelle ultime settimane a causa del ritardo temporale tra l’infezione, i sintomi e la necessità di assistenza sanitaria.

Più recenti per le regioni di NHS England

Queste sono le ultime stime di R e del tasso di crescita per le regioni di NHS England.

Quando il numero di casi o decessi è a livelli bassi e/o c’è un alto grado di variabilità nella trasmissione in una regione, allora bisogna fare attenzione quando si interpretano le stime di R e il tasso di crescita. Per esempio, una quantità significativa di variabilità in una regione a causa di un’epidemia locale può significare che un singolo valore medio non riflette accuratamente il modo in cui le infezioni stanno cambiando in quella regione.

È opinione degli esperti di SAGE, tuttavia, che le stime di questa settimana siano affidabili.

Le stime per R e i tassi di crescita sono mostrati come un intervallo, e i veri valori si trovano probabilmente all’interno di questo intervallo.

Vedi una serie temporale di stime pubblicate di R e tassi di crescita (ODS, 20KB) dal 29 maggio 2020 per:

• UK
• England
• le 7 regioni NHS England

Il documento della serie temporale viene aggiornato regolarmente.

Più recenti per le amministrazioni decentrate

Gli ultimi intervalli per i valori R nelle amministrazioni decentrate sono pubblicati sui rispettivi siti web:

• Stima R dell’Irlanda del Nord
• Stima R della Scozia
• Stima R del Galles (Cymraeg)

Altre statistiche chiave

L’indagine ONS sulle infezioni fornisce informazioni su:

• il numero di nuove infezioni della malattia identificate durante un determinato periodo di tempo (incidenza)
• la proporzione della popolazione che risulta positiva alla malattia nella comunità in un dato momento (tasso di positività o prevalenza)

Altri dati su test, casi, assistenza sanitaria e decessi sono disponibili presso il Coronavirus (COVID-19) nel cruscotto del Regno Unito.

Informazioni su R e tasso di crescita

R

Il numero di riproduzione (R) è il numero medio di infezioni secondarie prodotte da una singola persona infetta.

Un valore R di 1 significa che in media ogni persona che viene infettata contagerà 1 altra persona, il che significa che il numero totale di infezioni è stabile. Se R è 2, in media, ogni persona infettata infetta altre 2 persone. Se R è 0,5 allora in media per ogni 2 persone infettate, ci sarà solo 1 nuova infezione. Se R è maggiore di 1 l’epidemia sta crescendo, se R è minore di 1 l’epidemia si sta riducendo. Più R è superiore a 1, più persone infettate infettano 1 persona e quindi più velocemente l’epidemia cresce.

R può cambiare nel tempo. Per esempio, scende quando c’è una riduzione del numero di contatti tra le persone, che riduce la trasmissione. R aumenta quando il numero di contatti tra le persone aumenta, portando ad un aumento della trasmissione virale.

Tasso di crescita

Il tasso di crescita riflette quanto velocemente il numero di infezioni cambia giorno per giorno. È un’approssimazione del cambiamento percentuale del numero di infezioni ogni giorno. Se il tasso di crescita è maggiore di 0 (+ positivo), allora l’epidemia sta crescendo. Se il tasso di crescita è inferiore a 0 (- negativo), allora l’epidemia si sta riducendo.

La dimensione del tasso di crescita indica la velocità del cambiamento. Un tasso di crescita di +5% indica che l’epidemia sta crescendo più velocemente di un tasso di crescita di +1%. Allo stesso modo, un tasso di crescita di -4% indica che l’epidemia si sta riducendo più velocemente di un tasso di crescita di -1%. Ulteriori informazioni tecniche sul tasso di crescita possono essere trovate sulla rivista Plus.

Come i tassi di crescita sono diversi dalle stime di R

Il solo R non ci dice quanto velocemente sta cambiando un’epidemia. Malattie diverse con lo stesso R possono generare epidemie che crescono a velocità molto diverse. Per esempio, 2 malattie, entrambe con R=2, potrebbero avere tempi molto diversi per 1 individuo infetto per infettare altre 2 persone; una malattia potrebbe richiedere anni, mentre l’altra potrebbe richiedere giorni.

Il tasso di crescita ci fornisce informazioni sulla dimensione e sulla velocità del cambiamento, mentre il valore R ci dà solo informazioni sulla direzione del cambiamento.

Per calcolare R, sono necessarie informazioni sul tempo impiegato tra ogni generazione di infezioni. Cioè quanto tempo ci vuole per un gruppo di persone in un gruppo infetto per infettare un nuovo gruppo di persone nel gruppo successivo. Questo può dipendere da diversi fattori biologici, sociali e comportamentali. Il tasso di crescita non dipende dal “tempo di generazione” e quindi richiede meno ipotesi per la stima.

Nessuna delle due misure, R o tasso di crescita, è migliore dell’altra, ma ciascuna fornisce informazioni utili per monitorare la diffusione di una malattia.

Le stime dei tassi di crescita e R sono aggiornate regolarmente. Non sono, tuttavia, le uniche misure importanti dell’epidemia. Entrambi dovrebbero essere considerati insieme ad altre misure della diffusione della malattia, come il numero di nuovi casi di malattia identificati durante un determinato periodo di tempo (incidenza), e la proporzione della popolazione con la malattia in un dato momento (prevalenza). Se R è uguale a 1 con 100.000 persone attualmente infette, è una situazione molto diversa da R uguale a 1 con 1.000 persone attualmente infette. Il numero di persone attualmente infettate dal coronavirus (COVID-19) – e quindi in grado di trasmettere il virus – è quindi molto importante.

Come vengono stimati R e i tassi di crescita

I singoli gruppi di modellazione usano una serie di dati per stimare i tassi di crescita e i valori R, tra cui:

• dati epidemiologici come i dati dei test, i ricoveri in ospedale, ricoveri in terapia intensiva e decessi – generalmente ci vogliono fino a 3 settimane perché i cambiamenti nella diffusione della malattia si riflettano nelle stime a causa del ritardo temporale tra l’infezione iniziale e la necessità di cure ospedaliere
• indagini sui modelli di contatto che raccolgono informazioni sul comportamento – queste possono essere più veloci (con un ritardo di circa una settimana) ma possono essere soggette a distorsioni perché spesso si basano sul comportamento autocomportamento auto riferito e fanno supposizioni su come le informazioni raccolte si riferiscono alla diffusione della malattia
• indagini sulle infezioni domestiche in cui vengono eseguiti tamponi sugli individui – queste possono fornire stime di quante persone sono infette. Le indagini longitudinali (in cui i campioni vengono prelevati ripetutamente dalle stesse persone) permettono una stima più diretta della crescita dei tassi di infezione

Gruppi diversi di modellazione usano diverse fonti di dati per stimare questi valori usando modelli matematici che simulano la diffusione delle infezioni. Alcuni possono anche usare tutte queste fonti di informazione per aggiustare i loro modelli per riflettere meglio la situazione del mondo reale. C’è incertezza in tutte queste fonti di dati, quindi le stime possono variare tra i diversi modelli, quindi non ci basiamo su un solo modello. L’evidenza di diversi modelli è considerata, discussa, combinata, e il tasso di crescita e R sono poi presentati come intervalli. I valori veri più probabili sono da qualche parte all’interno degli intervalli.

L’arrotondamento e le differenze tra i flussi di dati utilizzati nei risultati di questi modelli individuali che vengono combinati, sono responsabili delle differenze tra le stime di R e i tassi di crescita stimati.

Chi stima R e i tassi di crescita

I tassi di crescita e R sono stimati da diversi gruppi di modellatori indipendenti con sede nelle università e nella Public Health England (PHE). I gruppi di modellazione discutono le loro stime individuali di R al Science Pandemic Influenza Modelling group (SPI-M) – un sottogruppo del SAGE.

Tempo di ritardo delle stime

SPI-M usano diversi modelli, ognuno dei quali usa dati da una varietà di fonti nelle loro stime di R e del tasso di crescita. I dati epidemiologici, come i ricoveri ospedalieri, i ricoveri in terapia intensiva e i decessi, di solito impiegano fino a 3 settimane per riflettere i cambiamenti nella diffusione della malattia.

Questo è dovuto al ritardo temporale tra l’infezione iniziale, i sintomi e la necessità di cure ospedaliere. Di conseguenza, le ultime cifre pubblicate rappresentano la situazione nelle ultime settimane piuttosto che oggi. Queste stime non riflettono ancora completamente i cambiamenti molto recenti nella trasmissione dovuti, per esempio, ai recenti cambiamenti politici nel Regno Unito.

Limitazioni di R

R è un valore medio che può variare in diverse parti del paese, comunità e sottosezioni della popolazione. Non può essere misurato direttamente, quindi c’è sempre incertezza intorno al suo valore esatto. Questo diventa ancora più un problema quando si calcola R usando un piccolo numero di casi, a causa di tassi di infezione più bassi o di aree geografiche più piccole. Questa incertezza può essere dovuta alla variabilità dei dati sottostanti, che porta a un intervallo più ampio per R e a cambiamenti più frequenti nelle stime.

Anche quando la stima complessiva di R nel Regno Unito è inferiore a 1, alcune regioni possono avere stime di R che includono intervalli che superano 1, per esempio da 0,7 a 1,1; questo non significa necessariamente che l’epidemia stia aumentando in quella regione, solo che l’incertezza non può essere esclusa. È anche possibile che un’epidemia in un luogo specifico possa risultare in un R superiore a 1 per l’intera regione.

Limitazioni dei tassi di crescita

Il tasso di crescita è un valore medio che può variare. Quando il numero di casi è basso, l’incertezza aumenta. Questo potrebbe accadere quando solo una percentuale molto piccola di persone è infettata, o l’area geografica considerata ha una popolazione molto piccola. Un numero minore di casi significa che la variabilità dei dati sottostanti rende difficile stimare il tasso di crescita; ci sarà un intervallo più ampio dato per il tasso di crescita e frequenti cambiamenti nelle stime. Questo accadrà sia per R che per il tasso di crescita. Tuttavia, la stima del tasso di crescita richiede meno ipotesi sulla malattia rispetto a R.

Anche quando la stima complessiva del tasso di crescita del Regno Unito è negativa (sotto lo 0), alcune regioni possono avere stime del tasso di crescita che includono intervalli che sono positivi (sopra lo 0), per esempio da -4% a +1%. Questo non significa necessariamente che l’epidemia stia aumentando in quella regione, ma solo che l’incertezza non può essere esclusa. È anche possibile che un’epidemia in un luogo specifico possa risultare in un tasso di crescita positivo (sopra lo 0) per l’intera regione.

Le stime del tasso di crescita per aree geografiche più piccole del livello regionale sono meno affidabili ed è più appropriato identificare gli hotspot locali attraverso, per esempio, il monitoraggio del numero di casi, ricoveri e morti.