Il valore logP di un composto, che è il logaritmo del suo coefficiente di ripartizione tra n-ottanolo e acqua log(coctanolo/acqua), è una misura ben stabilita dell’idrofilia del composto. Basse idrofilia e quindi alti valori logP causano scarso assorbimento o permeazione. È stato dimostrato che affinché i composti abbiano una ragionevole probabilità di essere ben assorbiti, il loro valore logP non deve essere maggiore di 5,0. La distribuzione dei valori logP calcolati di più di 3000 farmaci sul mercato sottolinea questo fatto (vedi diagramma)

Il nostro metodo di calcolo logP interno è implementato come sistema di incremento che aggiunge i contributi di ogni atomo in base al suo tipo. Complessivamente il motore di previsione LogP distingue 368 tipi di atomi che sono composti da varie proprietà dell’atomo stesso (numero atomico e appartenenza all’anello) e dei suoi vicini diretti (tipo di legame, stato di aromaticità e numero atomico codificato). Più di 5000 composti con valori logP determinati sperimentalmente sono stati usati come set di allenamento per ottimizzare i 369 valori di contributo associati ai tipi di atomo. Il diagramma di correlazione (vedi diagramma) mostra i valori logP calcolati rispetto a quelli determinati sperimentalmente di un set di prova indipendente di oltre 5000 composti diversi dal set di addestramento.