Loggains 2012-2013 között Mike Munchak edzői stábjának tagjaként a Tennessee Titans támadó koordinátora volt. Néhány nappal azután, hogy Ken Whisenhunt 2014-ben átvette a Titans vezetőedzői posztját, Loggainst tájékoztatták, hogy nem marad a szervezetnél. Korábban ő volt a csapat irányító edzője.
Loggains 2014-ben a Cleveland Browns irányító edzőjeként dolgozott. Ő volt a Texas A&M irányítójának, Johnny Manzielnek a draftolásának a szószólója.
A következő évben Loggains állást keresett. A New York Giants támadáskoordinátori állásra interjúztatta, de ehelyett 2015. január 23-án a Bears alkalmazta irányítóedzőként. Loggains irányítása alatt Jay Cutler irányító az egyik legjobb szezonját produkálta, mivel 2015-ben 3629 passzolt yarddal, 21 touchdownnal, 11 interceptionnel és karriercsúcsokkal zárta a passer rating (92,3) és a completion percentage (64,4) terén. A 11 interception volt a legalacsonyabb a karrierje során, és 2,3-as interception százalékot eredményezett, ami a legalacsonyabb egy olyan szezonban, amikor legalább 12 mérkőzésen kezdett, míg a 21 touchdown a második legtöbb volt 2011 óta, a 3629 yard pedig a harmadik legtöbb karrierje során. Harmadjára Cutler 103,2-es passer ratinget ért el (negyedik az NFL-ben), miután 141 passzból 91-et teljesített, ami 1242 yardot, hét touchdownt és két interceptiont jelentett. Ezzel szemben a Seattle Seahawks ellen a tartalék irányító, Jimmy Clausen 17 passzból 9-et fejezett be 63 yardra, és a zsákolásokkal együtt 48 nettó passzolt yardot jegyzett, ami az 1990-es szezon óta a második alkalom, hogy a Bears 50 nettó yardnál kevesebbet passzolt. A Bears 228,9 passzolt yarddal zárta az évet meccsenként, ami a 23. helyet jelentette a ligában, az irányító együttesen 63,9-es befejezési és 2,3-as elkapási százalékkal rendelkezett, mindkettő a harmadik a csapat történetében, valamint 3843 bruttó passzolt yarddal és egy 42.5 third down százalékkal (negyedik), 3660 nettó passzolt yarddal (ötödik), valamint 5514 összesített nettó yarddal és 89,7-es passer ratinggel (hatodik).
Loggainst 2016. január 11-én léptették elő támadó koordinátorrá, amikor Adam Gase távozott a pozícióból, hogy a Miami Dolphins vezetőedzője legyen. A Bears küzdött Loggains OC-je alatt, az ESPN 2017. novemberi rangsorában a 32 playcaller közül az utolsó helyre sorolta, míg a támadósor a 2017-es szezont mindössze 16,5 pont/meccs átlaggal zárta (29. a ligában). Miután John Fox vezetőedzőt kirúgták, Loggains újra összeállt Gase-zel Miamiban, és egy újabb támadáskoordinátori pozíciót kapott.
2019. január 23-án Loggains ismét összeállt Adam Gase-zel, miután a New York Jets támadáskoordinátori/quarterbacks edzőjének szerződtette. 2020. október 25-én, a 7. heti, Buffalo Bills elleni mérkőzésre készülve Adam Gase vezetőedző lemondott a támadójáték-összeállítási feladatokról, és átadta azokat Loggainsnek. Annak ellenére, hogy az első félidőben 10-6-os vezetésnél erős teljesítményt nyújtott, Loggains nem tudott lendületet venni a második félidőben, ami a Buffalo elleni 18-10-es vereségben csúcsosodott ki. 2020. október 28-án, a Kansas City Chiefs elleni mérkőzés előtt arról számoltak be, hogy Loggains ismét megkapja a támadójáték-összeállítói feladatokat.