A Dél-Karolinai Katonai Akadémia a The Citadel elődje, két kampuszon működő intézmény volt. A dél-karolinai törvényhozás 1842-ben alapította.

Dél-Karolina az 1822-es Denmark Vesey-féle tervezett rabszolgafelkelés után egy sor arzenált épített az államban; ezeket Columbia és Charleston arzenáljaiban egyesítették. Mivel már nem tekintették őket katonailag szükségesnek, 1842-ben létrehozták a Dél-Karolinai Katonai Akadémiát, amely a columbiai Arsenal Akadémiából és a charlestoni Citadella Akadémiából állt. A polgárháború alatt mindkettő diákjai az Állami Kadétok Zászlóaljaként szolgáltak; a tanítás megszakításokkal folytatódott. Az SCMA kadétjai adták le a polgárháború első lövéseit 1861. január 9-én, amikor a dél-karolinai Morris-szigeten egy lövegállást láttak el, amely a Star of the West nevű uniós gőzhajót lőtte; az Állami Kadétok Zászlóalja alkotta a konföderációs erők több mint egyharmadát, amely egy stratégiai fontosságú vasúti hidat védett az 1864-es tulifinny-i csatában, amely az egyetlen alkalom volt, amikor egy amerikai főiskola teljes hallgatósága harcolt a csatában.

Az Arsenal Akadémiát 1865-ben az uniós csapatok felgyújtották, és soha nem nyitották meg újra; az egyetlen megmaradt épület a dél-karolinai kormányzói kúria lett. A Citadella Akadémia és a Dél-Karolinai Katonai Akadémia 1865-ben bezárt; épületei 1882-ig szövetségi kézben voltak. A dél-karolinai törvényhozás 1882-es törvénye újra megnyitotta a Dél-Karolinai Katonai Akadémiát, csak a charlestoni kampuszt használva. A közismert nevén The Citadel Academy, az iskolát 1910-ben nevezték át The Citadel-re, miután az “Akadémia” elnevezés inkább a középiskolákra, mint a főiskolákra vált általánossá.