cLogP számítás

A vegyület logP értéke, amely az n-oktanol és víz közötti megoszlási együttható logaritmusa log(koctanol/víz), a vegyület hidrofilitásának jól ismert mérőszáma. Az alacsony hidrofilitás és ezért a magas logP-értékek rossz felszívódást vagy permeációt okoznak. Kimutatták, hogy ahhoz, hogy a vegyületek ésszerű valószínűséggel jól felszívódjanak, a logP-értékük nem lehet nagyobb 5,0-nál. A több mint 3000 forgalomban lévő gyógyszer számított logP-értékeinek eloszlása alátámasztja ezt a tényt (lásd az ábrát)

A házon belüli logP-számítási módszerünk növekményes rendszer, amely minden atom hozzájárulását hozzáadja az atom típusa alapján. Összességében a cLogP előrejelző motor 368 atomtípust különböztet meg, amelyek magának az atomnak a különböző tulajdonságaiból (atomszám és gyűrűs tagság), valamint közvetlen szomszédjainak (kötéstípus, aromássági állapot és kódolt atomszám) állnak. Több mint 5000 kísérletileg meghatározott logP-értékkel rendelkező vegyületet használtunk gyakorlóhalmazként az atomtípusokhoz kapcsolódó 369 hozzájárulási értékek optimalizálásához. A korrelációs ábra (lásd az ábrát) azt mutatja, hogy a több mint 5000 vegyületből álló független tesztkészlet számított és kísérletileg meghatározott logP-értékei eltérnek a gyakorlókészlettől.