Az Európai Unió (EU) fontos szereplője a globális egészségügynek és a nemzetközi ügyeknek, és határozottan támogatja a WHO vezető egészségügyi ügynökségként betöltött szerepét mind globálisan, mind a régióban.

Az EU a WHO/Európa természetes partnere. Földrajzilag a WHO Európai Régió tagállamainak több mint fele tartozik hozzá, vagy törekszik a csatlakozásra.

A WHO/Európa legfőbb partnere az EU-ban az Európai Bizottság, adminisztratív, végrehajtó, jogalkotási és igazságügyi feladatai miatt. Emellett az elnökségeken keresztül nagyon szorosan együttműködik az Európai Tanáccsal, az Európai Parlamenttel, a Régiók Európai Bizottságával és az érintett uniós ügynökségekkel, mint például:

• az Európai Betegségmegelőzési és Járványvédelmi Központ (ECDC)
• az Európai Gyógyszerügynökség (EMA)
• az Európai Élelmiszerbiztonsági Hatóság (EFSA)
• az Európai Környezetvédelmi Ügynökség (EEA)
• a Kábítószer és Kábítószerfüggőség Európai Megfigyelőközpontja (EMCDDA)
• az Európai Munkahelyi Biztonsági és Egészségvédelmi Ügynökség (EU-OSHA)
• Eurostat
• Európai Beruházási Bank (EBB).