Alekszisz 1629. március 10-én (O.S.) született Moszkvában, Mihail Romanovnak, az Oroszországot 1917-ig uraló dinasztia első tagjának a fia volt. Amikor Mihály 1645-ben meghalt, a mindössze 16 éves Alekszisz lépett a trónra. Bár formális iskolázottsága kezdetleges volt, és 10 éves korában abbamaradt, Alekszisz moszkvai mércével mérve valójában jól képzett volt, és irodalmi igényei voltak, még versírással is próbálkozott.

Alekszisz uralkodását számos népfelkelés kísérte, a legsúlyosabb a Stenka Razin kozák vezér vezette Délkelet-Oroszországban. További kitörések közé tartozott a szolovecsei kolostor szerzeteseinek felkelése, valamint polgári lázadások Pszkov, Novgorod és Moszkva városaiban. Bár Alekszisz elfojtotta a felkeléseket, az általános elégedetlenség lecsillapítása érdekében lépéseket tett a közigazgatás és az igazságszolgáltatás javítása érdekében is. Különösen fontos volt, hogy 1649-ben új törvénykönyvet vezetett be. Bár nagy előrelépés volt elődeihez képest, a reformnak az volt a szerencsétlen következménye, hogy a parasztokat még szorosabban a földhöz és földesuraikhoz kötötte.

Alekszisz a korábbi moszkovita uralkodók hagyományainak megfelelően újbóli orosz terjeszkedést irányított, de korántsem volt harcias uralkodó. Jelzésértékű, hogy legfőbb területi szerzeményét, a Dnyeper folyó köré összpontosuló nagy lengyel területet és a későbbi Ukrajna egy részét az ukrán kozák lakosság meghívására szerezte meg. A Lengyelországgal való hosszas konfliktus után az elcsatolt terület határait a Lengyelországgal kötött andrusovói fegyverszünet erősítette meg 1667-ben.

Alekszisz uralkodásának fontos részét képezte a konfliktus Nikónnal, az orosz ortodox egyház pátriárkájával is. A vita és Nikónnak egy északi kolostorba való száműzetése ellenére a pátriárka Alekszisz jóváhagyásával végrehajtotta azokat az egyházi reformokat, amelyek az orosz egyházon belüli nagy szakadáshoz vezettek.

A nem hivatalos “a legcsendesebb” címet viselő Alekszisz durvább jellemvonásokat is mutatott. Gyakran elvesztette a türelmét, és egyszer arcon ütötte apósát, meghúzta a szakállát, kirúgta a szobából, és rácsapta az ajtót.

Alekszisz kétszer ment férjhez, először Mária IIiniszna Miloszlavszkijhoz, majd annak halála után Natalja Kirillovna Nariskinához. Alekszisz 1676. jan. 29-én (O.S.), 47 éves korában Moszkvában hirtelen halt meg. Három fia és hat lánya maradt utána, a két idősebbik fiú, Fjodor és Iván az első feleségétől, Péter, a későbbi császár pedig a második feleségétől.