Lycours:
1. Introduction : La plante saine et la plante malade Les maladies des plantes et les micro-organismes phytopathogènes : notions de base. Diagnostic, importance et contrôle des maladies des plantes – aperçu historique.
2. Micro-organismes phytopathogènes : introduction Aperçu des groupes les plus importants de virus, viroïdes, bactéries, phytoplasmes et champignons phytopathogènes. Caractéristiques générales de ces groupes. Épidémies causées par les virus, viroïdes, bactéries, phytoplasmes et champignons phytopathogènes.
3. Le processus d’infection – notions de base Le processus d’infection. Réactions des plantes infectées. Susceptibilité et résistance à l’infection. Métabolites végétaux responsables des symptômes de la maladie. Rôle du statut physiologique des plantes dans la résistance aux maladies.
4. Virus et viroïdes phytopathogènes : introduction Caractérisation générale des virus et viroïdes phytopathogènes. Les groupes les plus importants de virus et viroïdes phytopathogènes.
5. Virus et viroïdes phytopathogènes : le processus d’infection Transmission des virus des plantes : transmission mécanique, transmission par les graines, propagation végétative (greffage) et vecteurs insectes, nématodes et champignons. Symptômes causés par les virus des plantes. Changements physiologiques chez les plantes infectées. Réplication des virus à ARN par rapport aux virus à ADN. Base moléculaire de la réplication virale.
6. Virus et viroïdes phytopathogènes : lutte contre les infections virales Méthodes classiques de lutte agrotechnique. Méthodes de lutte génétique, biologique et intégrée. Méthodes de lutte basées sur les outils biotechnologiques.
7. Bactéries phytopathogènes : introduction Caractérisation générale des bactéries phytopathogènes. Interactions entre les plantes et les bactéries phytopathogènes aux niveaux cellulaire et moléculaire. Les maladies des plantes causées par les bactéries phytopathogènes. Méthodes de lutte contre les maladies bactériennes des plantes.
8. Les bactéries phytopathogènes : le processus d’infection Bactéries sur ou dans les tissus végétaux – interactions dans la rhizosphère et la phyllosphère. Pénétration des tissus végétaux. Rôle des enzimes bactériens, des lipopolysaccharides extracellulaires et des toxines au cours du processus de pénétration. Rôle des hormones végétales dans le processus d’infection. Terrain génétique des interactions plantes-bactéries.
9. Champignons phytopathogènes : introduction Le parasitisme dans le règne fongique : caractéristiques générales des champignons phytopathogènes. Modifications physiologiques chez les plantes infectées. Types de maladies des plantes causées par des champignons. Lutte contre les maladies des plantes causées par les champignons.
10. Groupes de champignons phytopathogènes Caractérisation générale des champignons phytopathogènes appartenant aux Gymnomycota, Oomycota, Chytridiomycetes et Zygomycetes. Caractérisation générale des champignons phytopathogènes appartenant aux Ascomycètes et aux Basidiomycètes.
11. Diversité génétique des champignons phytopathogènes Caractéristiques générales du génome fongique. Diversité des champignons phytopathogènes : modifications de la virulence et de la résistance aux fongicides ; émergence de nouveaux pathotypes et races ; émergence de nouveaux phytopathogènes ; modifications de la reproduction asexuée/sexuée. Fondement génétique de ces phénomènes : recombinaisons sexuelles et asexuelles, hybridations interspécifiques, mutations, mycovirus et transposons.
12. Résistance aux maladies chez les plantes : mécanismes de résistance Résistance innée et acquise des plantes. Bases moléculaires de la résistance des plantes. Gènes de résistance chez les plantes.
13. Protection des plantes : méthodes de lutte classiques et modernes.Aperçu des méthodes classiques de protection des plantes agrotechniques, chimiques, biologiques et intégrées. Sélection de plantes résistantes aux maladies des plantes à l’aide d’outils classiques et moléculaires. Plantes transgéniques résistantes aux maladies des plantes.Lutte biologique contre les agents pathogènes des plantes.
14. Identification des agents pathogènes des plantes à l’aide d’outils classiques et modernes Diagnostic des virus, bactéries et champignons phytopathogènes à l’aide de méthodes classiques et d’outils moléculaires basés sur les profils des protéines et des acides nucléiques.
15. Les maladies des plantes à étiologie complexe. Maladies des plantes sauvages. Écologie des maladies des plantes Facteurs physiologiques à l’origine des maladies des plantes. Symptômes des maladies causées par des facteurs physiologiques. Maladies des plantes à étiologie complexe. Les maladies des plantes dans les écosystèmes naturels – considérations écologiques.