Le fumier est utilisé depuis des siècles comme engrais pour l’agriculture, car il est riche en azote et autres nutriments qui facilitent la croissance des plantes. Le lisier provenant des exploitations porcines est généralement épandu (injecté) directement dans le sol pour réduire les odeurs désagréables. Le fumier des porcs et des bovins est épandu sur les champs à l’aide d’un épandeur à fumier. En raison de la teneur relativement faible en protéines des herbes, dont se nourrissent les herbivores, le fumier des bovins a une odeur plus douce que celle des carnivores – par exemple, le fumier des éléphants est pratiquement inodore. Toutefois, en raison de la quantité de fumier épandu sur les champs, l’odeur peut constituer un problème dans certaines régions agricoles. Les fientes de volaille sont nocives pour les plantes lorsqu’elles sont fraîches, mais après une période de compostage, elles constituent de précieux engrais.
Le fumier séché des animaux a été utilisé comme combustible tout au long de l’histoire. Le fumier séché (généralement connu sous le nom de bouse) des vaches était, et est toujours, une importante source de combustible dans des pays comme l’Inde, tandis que la bouse de chameau peut être utilisée dans les régions sans arbres comme les déserts. Sur la piste de l’Oregon, les familles de pionniers ramassaient de grandes quantités de « copeaux de bison » pour remplacer le bois de chauffage, qui était rare. Il a été utilisé à de nombreuses fins, dans les feux de cuisson et pour combattre les nuits froides du désert.
Une autre utilisation du fumier est la fabrication de papier. Cela a été fait avec le fumier des éléphants où c’est une petite industrie en Afrique et en Asie, et aussi des chevaux, des lamas et des kangourous. A part le lama, ces animaux ne sont pas des ruminants et ont donc tendance à laisser passer les fibres végétales non digérées dans leurs excréments.