Base de données du génome de Saccharomyces

Le but de la base de données du génome de Saccharomyces (SGD) est de fournir des informations sur le génome de cette levure, les gènes qu’il code, et leurs fonctions biologiques. La séquence du génome de S. cerevisiae fournit la structure autour de laquelle les informations de la SGD sont organisées ; la valeur est ajoutée à la séquence par une annotation biologique minutieuse provenant d’un certain nombre de sources. La SGD conserve et stocke des informations sur les séquences d’ADN et de protéines de la levure bourgeonnante, la génétique, la biologie cellulaire et la communauté de chercheurs associée. Le SGD fournit également des outils de recherche et d’analyse conçus pour aider les chercheurs à exploiter les données afin de trouver des éléments ou des modèles d’informations biologiques pertinents pour leurs intérêts. Un défi permanent pour le personnel de la SGD est de présenter des informations actualisées sur les gènes de la levure dans un format intuitif et utile pour les chercheurs biomédicaux, tout en répondant aux besoins de cette communauté en fournissant des ressources et des outils pour explorer les données de manière nouvelle. Ce chapitre décrit l’organisation de la SGD, les sources des données stockées dans la SGD, certaines méthodes d’extraction d’informations de la base de données, les connexions que la SGD entretient avec des bases de données extérieures et des communautés de recherche non liées à la levure, ainsi que le dépôt d’informations de la communauté de la levure de la SGD.