Viimeisin R-arvo ja kasvuvauhti

R-arvo 0,7 ja 1,0 välillä tarkoittaa, että keskimäärin 10 tartunnan saanutta ihmistä tartuttaa 7-10 muuta ihmistä.

Kasvuvauhti, joka on välillä -5 % ja -2 %, tarkoittaa, että uusien tartuntojen määrä vähenee joka päivä 2-5 %.

Yhdistyneessä kuningaskunnassa käytetyt R- ja kasvuvauhti-arviot ovat keskiarvoja erilaisista epidemiologisista tilanteista, ja niitä olisi pidettävä pikemminkin yleissuuntauksen suuntaa-antavina tekijöinä kuin epidemiatilanteen kuvauksena. Kun otetaan huomioon, että epidemian hallinnassa noudatetaan yhä enemmän paikallista lähestymistapaa, erityisesti kansakuntien välillä, Yhdistyneen kuningaskunnan tason arviot eivät ole yhtä merkityksellisiä kuin aiemmin.

Nämä arviot edustavat COVID-19:n leviämistä viimeisten viikkojen aikana, mikä johtuu viiveestä, joka kuluu tartunnan saamisen, oireiden ilmaantumisen ja terveydenhuollon tarpeen välillä.

Viimeisimmät NHS Englandin alueittain

Nämä ovat viimeisimmät R- ja kasvuvauhti-arviot NHS Englandin alueittain.

Kun tapausten tai kuolemantapausten määrät ovat alhaisia ja/tai tartuntojen leviämisessä on suurta vaihtelua eri alueilla, R- ja kasvuvauhti-arvioita tulkittaessa on oltava varovainen. Esimerkiksi paikallisen taudinpurkauksen aiheuttama huomattava vaihtelu eri puolilla aluetta voi merkitä sitä, että yksittäinen keskiarvo ei anna tarkkaa kuvaa siitä, miten tartunnat muuttuvat koko alueella.

SAGE:n asiantuntijoiden näkemyksen mukaan tämän viikon arviot ovat kuitenkin luotettavia.

R- ja kasvuvauhtiarviot esitetään vaihteluvälinä, ja todelliset arvot ovat todennäköisesti tämän vaihteluvälin sisällä.

Seuraa julkaistujen R- ja kasvuvauhtiarvioiden aikasarjaa (ODS, 20KB) 29.5.2020 alkaen seuraaville alueille:

• Yhdistynyt kuningaskunta
• Englannissa
• NHS Englandin seitsemällä eri alueella

Aikasarjadokumentti päivitetään säännöllisesti.

Viimeisimmät hajautettujen hallintoalueiden osalta

Viimeisimmät R-arvojen vaihteluvälit hajautetuissa hallintoalueissa julkaistaan niiden omilla verkkosivustoilla:

• Pohjois-Irlannin R-estimaatti
• Skotlannin R-estimaatti
• Walesin R-estimaatti (Cymraeg)

Muut keskeiset tilastotiedot

Onsin infektiotutkimus antaa tietoa seuraavista asioista:

• määritellyn ajanjakson aikana todettujen uusien tautitartuntojen määrästä (ilmaantuvuus)
• väestön osuudesta, joka testataan positiivisesti taudille yhteisössä tiettynä ajankohtana (positiivisuusaste tai prevalenssi)

Muita tietoja testauksesta, tautitapauksista, terveydenhoidosta ja kuolemantapauksista on saatavissa osoitteesta Coronavirus (COVID-19) in the UK dashboard.

Tietoa R:stä ja lisääntymisnopeudesta

R

Väestön lisääntymisluku (R) on yksittäisen tartunnan saaneen henkilön tuottamien sekundaaritartuntojen keskimääräinen määrä.

R-arvo 1 tarkoittaa, että keskimäärin jokainen tartunnan saanut henkilö tartuttaa yhden toisen henkilön, mikä tarkoittaa, että tartuntojen kokonaismäärä on vakaa. Jos R-arvo on 2, jokainen tartunnan saanut henkilö tartuttaa keskimäärin 2 muuta ihmistä. Jos R-arvo on 0,5, niin keskimäärin jokaista kahta tartunnan saanutta kohti tulee vain yksi uusi tartunta. Jos R on suurempi kuin 1, epidemia kasvaa, jos R on pienempi kuin 1, epidemia supistuu. Mitä suurempi R on yli 1, sitä enemmän ihmisiä yksi tartunnan saanut tartuttaa ja sitä nopeammin epidemia siis kasvaa.

R voi muuttua ajan myötä. Se esimerkiksi laskee, kun ihmisten välisten kontaktien määrä vähenee, mikä vähentää tartuntaa. R kasvaa, kun ihmisten välisten kontaktien määrä kasvaa, mikä johtaa viruksen leviämisen lisääntymiseen.

Kasvunopeus

Kasvunopeus kuvastaa sitä, kuinka nopeasti tartuntojen määrä muuttuu päivä päivältä. Se on likimääräinen arvio tartuntojen määrän prosentuaalisesta muutoksesta joka päivä. Jos kasvuvauhti on suurempi kuin 0 (+ positiivinen), epidemia kasvaa. Jos kasvuvauhti on pienempi kuin 0 (- negatiivinen), epidemia kutistuu.

Kasvuvauhdin suuruus kertoo muutoksen nopeuden. Kasvuvauhti +5 % tarkoittaa, että epidemia kasvaa nopeammin kuin kasvuvauhti +1 %. Vastaavasti kasvuvauhti -4 % osoittaa, että epidemia kutistuu nopeammin kuin kasvuvauhti -1 %. Lisää teknistä tietoa kasvuvauhdista löytyy Plus-lehdestä.

Miten kasvuvauhti eroaa R-estimaateista

R yksinään ei kerro, kuinka nopeasti epidemia muuttuu. Eri taudit, joilla on sama R, voivat synnyttää epidemioita, jotka kasvavat hyvin eri nopeudella. Esimerkiksi kahdella taudilla, joilla molemmilla on R=2, voi olla hyvin eripituiset ajat siihen, että yksi tartunnan saanut yksilö tartuttaa kaksi muuta ihmistä; toisella taudilla voi kestää vuosia, kun taas toisella taudilla voi kestää päiviä.

Kasvunopeus antaa meille tietoa muutoksen koosta ja nopeudesta, kun taas R-arvo antaa meille tietoa vain muutoksen suunnasta.

R:n laskemiseksi tarvitaan tietoa siitä, mikä aika kuluu kunkin tartuntasukupolven välillä. Tämä tarkoittaa sitä, kuinka kauan kestää, että yksi joukko ihmisiä tartunnan saaneessa ryhmässä tartuttaa uuden joukon ihmisiä seuraavassa ryhmässä. Tämä voi riippua useista erilaisista biologisista, sosiaalisista ja käyttäytymiseen liittyvistä tekijöistä. Kasvunopeus ei riipu ”sukupolven ajasta”, joten sen arvioiminen vaatii vähemmän oletuksia.

Kumpikaan mittari, R tai kasvunopeus, ei ole toista parempi, mutta kumpikin antaa tietoa, joka on hyödyllistä taudin leviämisen seurannassa.

Kasvunopeuden ja R:n estimaatteja päivitetään säännöllisesti. Ne eivät kuitenkaan ole ainoita tärkeitä epidemian mittareita. Molempia olisi tarkasteltava yhdessä muiden taudin leviämisen mittareiden kanssa, kuten tietyn ajanjakson aikana todettujen uusien tautitapausten määrä (ilmaantuvuus) ja tautia sairastavien osuus väestöstä tiettynä ajankohtana (esiintyvyys). Jos R on yhtä suuri kuin 1, kun 100 000 ihmistä on saanut tartunnan, tilanne on hyvin erilainen kuin jos R on yhtä suuri kuin 1 000 ihmistä on saanut tartunnan. Koronavirustartunnan (COVID-19) saaneiden – ja siten viruksen siirtämiseen kykenevien – ihmisten määrä on siis hyvin tärkeä.

Miten R- ja kasvulukuja arvioidaan

Yksittäiset mallinnusryhmät käyttävät kasvulukujen ja R-arvojen arviointiin erilaisia tietoja, mm:

• epidemiologisia tietoja, kuten testaustietoja, sairaalahoitoja, teho-osastohoitoon otot ja kuolemantapaukset – yleensä kestää jopa kolme viikkoa ennen kuin taudin leviämisessä tapahtuvat muutokset näkyvät arvioissa, koska alkutartunnan ja sairaalahoidon tarpeen välillä on viive
• kontaktitutkimukset, joissa kerätään tietoa käyttäytymisestä – nämä voivat olla nopeampia (viive noin viikko), mutta ne voivat olla alttiita harhapainotteisuudelle, koska ne perustuvat usein omaan käyttäytymiseen.
• kotitalouksien tartuntatutkimukset, joissa yksilöiltä otetaan pyyhkäisynäytteet – näistä voidaan saada arvioita siitä, kuinka moni on saanut tartunnan. Pitkittäistutkimukset (joissa näytteet otetaan toistuvasti samoilta ihmisiltä) mahdollistavat suoremman arvion tartuntamäärien kasvusta

Erilaiset mallinnusryhmät käyttävät eri tietolähteitä näiden arvojen arvioimiseksi käyttäen matemaattisia malleja, jotka simuloivat tartuntojen leviämistä. Jotkut saattavat jopa käyttää kaikkia näitä tietolähteitä mukauttaakseen mallinsa vastaamaan paremmin todellista tilannetta. Kaikkiin näihin tietolähteisiin liittyy epävarmuutta, joten arviot voivat vaihdella eri mallien välillä, joten emme luota vain yhteen malliin. Useista malleista saatuja tietoja tarkastellaan, niistä keskustellaan ja ne yhdistetään, minkä jälkeen kasvuvauhti ja R esitetään vaihteluväleinä. Todennäköisimmät todelliset arvot ovat jossakin näiden vaihteluvälien sisällä.

Rauhoitus ja erot näissä yhdistetyissä yksittäisissä mallituloksissa käytetyissä tietovirroissa selittävät R:n ja arvioitujen kasvulukujen estimaattien väliset erot.

Kuka arvioi R:n ja kasvulukuja

Kasvulukuja ja R:ää arvioivat useat riippumattomat mallinnusryhmät eri yliopistoissa ja Englannin julkisessa terveydenhuollossa (Public Health England, PHE). Mallinnusryhmät keskustelevat yksittäisistä R-arvioistaan Science Pandemic Influenza Modelling group (SPI-M) -ryhmässä, joka on SAGE:n alaryhmä.

Estimaattien aikaviive

SPI-M käyttää useita malleja, joista kukin käyttää R:n ja kasvuvauhdin estimaateissaan tietoja eri lähteistä. Epidemiologiset tiedot, kuten sairaalahoitoon otot, teho-osastohoitoon otot ja kuolemantapaukset, vievät yleensä jopa 3 viikkoa, ennen kuin ne heijastavat taudin leviämisessä tapahtuvia muutoksia.

Tämä johtuu viiveestä alkutartunnan, oireiden saamisen ja sairaalahoidon tarpeen välillä. Tämän vuoksi viimeisimmät julkaistut luvut edustavat pikemminkin viime viikkojen kuin tämän päivän tilannetta. Nämä arviot eivät vielä täysin heijasta hyvin viimeaikaisia muutoksia tartunnassa, jotka johtuvat esimerkiksi viimeaikaisista poliittisista muutoksista Yhdistyneessä kuningaskunnassa.

R:n rajoitukset

R on keskiarvo, joka voi vaihdella maan eri osissa, yhteisöissä ja väestön osa-alueilla. Sitä ei voida mitata suoraan, joten sen tarkkaan arvoon liittyy aina epävarmuutta. Tästä tulee vielä suurempi ongelma, kun R:n laskennassa käytetään pieniä tapausmääriä, jotka johtuvat joko alhaisemmista tartuntamääristä tai pienemmistä maantieteellisistä alueista. Tämä epävarmuus voi johtua taustalla olevien tietojen vaihtelusta, mikä johtaa R:n laajempaan vaihteluväliin ja arvioiden tiheämpiin muutoksiin.

Silloinkin kun Yhdistyneen kuningaskunnan yleinen R-arvio on alle 1, joillakin alueilla R-arviot voivat olla yli 1:n, esimerkiksi 0,7:stä 1,1:een; tämä ei välttämättä tarkoita, että epidemia on lisääntymässä kyseisellä alueella, vaan ainoastaan sitä, että epävarmuuden vuoksi sitä ei voida sulkea pois. On myös mahdollista, että epidemian puhkeaminen yhdessä tietyssä paikassa voi johtaa siihen, että R-arvo on yli 1 koko alueella.

Kasvunopeuden rajoitukset

Kasvunopeus on keskiarvo, joka voi vaihdella. Kun tapausmäärät ovat pieniä, epävarmuus kasvaa. Näin voi tapahtua, kun vain hyvin pieni osa ihmisistä on saanut tartunnan tai kun tarkasteltavalla maantieteellisellä alueella on hyvin pieni väestö. Pienempi tapausmäärä tarkoittaa, että taustalla olevien tietojen vaihtelevuus vaikeuttaa kasvuvauhdin arviointia; kasvuvauhdille annetaan laajempi vaihteluväli ja arviot muuttuvat usein. Näin tapahtuu sekä R:n että kasvuvauhdin osalta. Kasvuvauhdin arviointi edellyttää kuitenkin vähemmän oletuksia taudista kuin R.

Silloinkin, kun Yhdistyneen kuningaskunnan yleinen kasvuvauhtiarvio on negatiivinen (alle 0), joillakin alueilla kasvuvauhtiarviot voivat sisältää vaihteluvälejä, jotka ovat positiivisia (yli 0), esimerkiksi -4 %:sta +1 %:iin. Tämä ei välttämättä tarkoita, että epidemia on lisääntymässä kyseisellä alueella, vain sitä, että epävarmuuden vuoksi sitä ei voida sulkea pois. On myös mahdollista, että epidemian puhkeaminen yhdessä tietyssä paikassa voi johtaa positiiviseen (yli 0) kasvuvauhtiin koko alueella.

Kasvuvauhtiarviot alueellista tasoa pienemmillä alueilla eivät ole yhtä luotettavia, ja on tarkoituksenmukaisempaa tunnistaa paikalliset kriisipesäkkeet esimerkiksi seuraamalla tapausten, sairaalahoitojaksojen ja kuolemantapausten määrää.