Nykyinen hullun lehmän taudin diagnoosi perustuu lääketieteen tohtori Lawrence Broxmeyerin mukaan yksinomaan myöhään esiintyvien prionien havaitsemiseen, mikä on lyhenne oletetuille, geenittömille, väärinmuodostuneille proteiineille, joiden jotenkin väitetään aiheuttavan taudin. Kuitenkin prionien laboratoriovalmisteet sisältävät muitakin asioita, kuten tunnistamattomia bakteereja tai viruksia. Lisäksi pelkkä prionien puhdistuksen vaativuus on saattanut tappaa aiheuttajaviruksen tai -bakteerin. Näin ollen, vaikka näytteet näyttäisivät tartuttavan eläimiä, on mahdotonta todistaa, että prionit ovat aiheuttajia eivätkä vain infektioprosessin lopputulos.

Broxmeyer jatkaa: Lisäksi Manuelidis löysi viruksen kaltaisia hiukkasia, jotka, vaikka ne erotettiin prioneista, olivat vastuussa spongiformisista STE:istä. Myöhemmin Lasmezassin tutkimus osoitti, että 55 prosentilla hiiristä, joihin oli ruiskutettu naudan BSE:tä ja jotka sairastuivat, ei ollut havaittavissa prioneja. Uskomatonta kyllä, prioneja pidetään edelleen TSE-dogmana, ja Heino Dringer, joka teki uraauurtavaa työtä niiden luonteen selvittämiseksi, ennustaa avoimesti, että prionikäsitys osoittautuu vääräksi. Monissa eläimissä, jotka kuolevat spongiformisiin TSE-tauteihin, ei koskaan näy merkkejä vääristyneistä proteiineista, ja tohtori Frank Bastian Tulanen yliopistosta uskoo, että sairaus johtuu bakteeri-DNA:sta, jonka hän löysi tästä tautiryhmästä.

Hiljattain Broxmeyer, Roels ja Walravens lisäsivät Broxmeyerin, Roelsin ja Walravensin mukaan, että he saivat eristettyä Mycobacterium boviksen (nautojen tuberkuloosin) lehmän aivoistakin, joilla oli hullun lehmän kliinisiä ja histopatologisia oireita. Lisäksi epidemiologiset kartat hullun lehmän taudin synnystä ja esiintyvyyden huipusta Yhdistyneessä kuningaskunnassa, jossa kaikki alkoi, sopivat hyvin yhteen Englannin Lounais-Englannin alueiden kanssa, joilla esiintyy eniten nautojen tuberkuloosia. Lehmien tuberkuloosin neurotoksinen potentiaali osoitettiin ennen 1960-lukua Englannissa, jossa neljännes kaikista tuberkuloottisen aivokalvontulehduksen uhreista sairastui lehmien Mycobacterium bovis -infektioon. Harleyn tutkimus osoitti, että nautojen systeeminen M. bovis -bakteeri aiheutti tuberkuloottisen spongiformisen enkefaliitin, joka oli identtinen hullun lehmän taudin kanssa.

Kaiken tämän lisäksi, Broxmeyer sanoo, prionit on kuvattu amyloidiksi, ja aiemmin amyloidi oli yleensä laskeuma, joka tapahtui kroonisen tulehdussairauden, lähinnä tuberkuloosin, sen tavanomaisen saostavan syyn vuoksi. M. bovis eli lehmän tuberkuloosi, lintutuberkuloosi tai Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis aiheuttaa Johnesin taudin, joka on tunnettu ja laiminlyöty ongelma naudoilla ja lampailla lähes vuosisadan ajan ja joka nousee nopeasti uuden vuosituhannen taudiksi. M. paratuberculosis -bakteeria on löydetty ihmisen Crohnin taudissa, mutta sekä Crohnin tauti että Johnes-tauti reagoivat ristiin naudan paratuberkuloosin antigeenien kanssa. Lisäksi Crohnin taudin keskeiset neurologiset ilmenemismuodot eivät ole tuntemattomia.

Broxmeyer lisää: Ei ole mitään tunnettua tautia, joka sopisi paremmin siihen, mitä Hullun lehmän taudissa ja spongiformisissa enkefalopatioissa esiintyy, kuin naudan tuberkuloosi ja sen veri-aivoesteen läpäisevät, viruksen kaltaiset, soluseinämäpuutteiset muodot. Näistä syistä tulevaa tutkimusta on suunnattava tähän suuntaan. Webb arvelee vuonna 1932 tekemässään historiallisessa katsauksessa, että ihminen sai tuberkuloosin ensimmäisen kerran käyttöönsä, kun hän alkoi kotieläintaloudessa kasvattaa nautaeläimiä noin 5 000 vuotta eKr. Näin ollen voidaan olettaa, että ihmisen tuberkuloosi sai alkunsa siirtämällä M. bovis -bakteeri, jolla on potentiaalia tarttua ihmisiin, ihmiskehoon, jossa se sopeutui tuberkuloosibasilliksi. Garnier kyseenalaisti kuitenkin hiljattain tämän deletioanalyysin avulla ja totesi ihmisen M. tuberculosis -bakteerin tulleen ensin ja tartuttaneen lehmät karjan kesyttämisen aikaan 10 000015 000 vuotta sitten. Sitä ennen tuberkuloosibakteerit, jotka syntyivät aina maaperässä, saastuttivat ja tartuttivat ensin nisäkkäitä, sekä märehtijöitä että kädellisiä. Nykyaikainen genetiikka on vahvistanut, että ihmisen (M. tuberculosis) ja lehmän (M. bovis) tuberkuloosin välinen DNA on lähes identtinen, mikä osoittaa, että ne ovat käytännössä samaa lajia. Jopa viljelylevyissä niiden ulkonäkö on samankaltainen.

Naudan tuberkuloosi oli aikoinaan naudan yleisin tartuntatauti Yhdysvalloissa, ja se aiheutti tämän vuosisadan alkupuolella enemmän tappioita yhdysvaltalaisten tuotantoeläinten keskuudessa kuin kaikki muut tartuntataudit yhteensä. M. bovis aiheuttaa edelleen maailmanlaajuisesti 3 miljardin dollarin vuotuiset tappiot maataloudelle. Nobel-palkintopuheessaan vuonna 1901 Von Behring totesi: ”Kuten tiedätte, nautojen tuberkuloosi on yksi maataloutta eniten vahingoittavista tartuntataudeista.”

Broxmeyer toteaa lopuksi: ”Tänä päivänä suurin este TSE:iden parannuskeinon löytämiselle piilee juuri siinä teoriassa, johon ne ovat juurtuneet. Santanan usein siteeraama se, joka ei muista menneisyyttä, on tuomittu kokemaan sen uudelleen tulevaisuudessa, näyttää tässä yhteydessä selvältä. 1900-luvun alkupuolella lehmän tuberkuloosin leviäminen tunnustettiin selvästi, ja aikoinaan amerikkalaisessa maidossa luki: ”tuberculin tested” (tuberkuliinitestattu), mikä oli muistokirjoitus sille, että jopa 30 prosenttia ennen pastörointia ilmenneistä tuberkuloositapauksista ihmisillä oli naudan tai lehmän tuberkuloosin aiheuttamaa.