Ensimmäinen suuri millenaristinen liike varhaiskristillisten yhteisöjen jälkeen oli montanismi. Sen perustaja Montanus pyrki palauttamaan kirkon alkuaikojen innostuksen. Montanuksen liike alkoi noin vuonna 172 jKr. Hän odotti Herran palaavan Pepuzaan ja Tymioniin, kahteen pieneen kaupunkiin Vähä-Aasiassa. Uusi Jerusalem laskeutuisi pian maan päälle ja Kristuksen tuhatvuotinen valtakausi alkaisi. Montanus kannusti seuraajiaan elämään tiukassa askeesissa valmistautuakseen tähän toiseen tulemiseen. Kirkko kääntyi Montanusta vastaan, koska millenarismi ei ollut keskeinen osa kristillistä oppia ja koska ekstaattinen profetia ja yksityinen tulkinta heikensivät kirkkokuria.

Pyhä Augustinus Hippolaiselta (354-430) sulki vuosisadoiksi tehokkaasti oven millenaristiselta spekulaatiolta kirjoittamalla sellaista Raamatun kirjaimellista tulkintaa vastaan, jossa luvattiin fyysinen paratiisi maan päällä. Keskiajan alkupuolella Joachim Fiore (1130 tai 1135-1201 tai 1202) avasi kuitenkin oven uudelleen monille apokalyptisille ja uudistusliikkeille, kuten hengellisille fransiskaaneille ja fraticelleille. Joachim uskoi oman aikakautensa olevan kriisissä ja saarnasi, että inhimillinen toimijuus auttaisi osaltaan saattamaan kirkon historian viimeiseen vaiheeseen, Pyhän Hengen aikakauteen.

Monissa tapauksissa millenaristiset toiveet ja odotukset kietoutuivat yhteen poliittisten ja sosiaalisten pyrkimysten kanssa ja johtivat väkivaltaiseen sekamelskaan – erityisesti silloin, kun uudistuspyrkimykset, joita jäykät kirkolliset ja maalliset viranomaiset estivät, muuttuivat radikaaleiksi ja äärimmäisiksi. Tällainen tilanne syntyi esimerkiksi 1400-luvulla Böömissä ja Moriassa, kun hussilaisesta uudistusliikkeestä, joka sekoittui epämääräisiin kansallismielisiin tunteisiin ja sosiaalisiin jännitteisiin, tuli hussilainen vallankumous, joka puolestaan synnytti taboriittien radikaalin tuhatvuotisliikkeen. Uskonnollisten mielikuvien ja millenarististen uskomusten avulla taboriitit loivat lyhytikäisen millenaristisen yhteiskunnan, joka taisteli väkivaltaisesti niitä joukkoja vastaan, jotka lähetettiin murskaamaan se.

Kuudennentoista vuosisadan Saksassa luterilaiset uudistukset laukaisivat yhteiskunnallisten ja uskonnollisten muutosten keskellä sekä vapautumisen tunteen että hämmennyksen. Aivan kuten Martin Luther käytti apokalyptista kuvastoa kuvaillessaan paavia Antikristuksena, Thomas Müntzer kuvasi Lutherin maailmanlopun pedoksi, koska Luther vastusti Müntzerin uudistuspyrkimyksiä. Müntzer sitoutui yhteiskunnalliseen ja uskonnolliseen vallankumoukseen ja uskoi, että kaikki, jotka vastustavat tätä lopunajan prosessia, on hävitettävä väkivaltaisesti. Anabaptistiryhmät kanavoivat uudistustoiveet pyrkimyksiksi perustaa uusi kultainen aikakausi. Jotkut ryhmät saarnasivat väkivallatonta lopunajan odotusta, kun taas toiset ryhmät kehittivät fanaattista millenarismia, kun viranomaiset vastustivat heitä. Münsterissä anabaptistit perustivat uuden Siionin kuningaskunnan, joka päättyi väkivaltaisesti ja verisesti vuonna 1535.

Kuudennentoista vuosisadan lopulla ja seitsemännentoista alussa Englannin poliittiset ja uskonnolliset olosuhteet saivat aikaan millenaristisen kiinnostuksen ja innostuksen aallon. Englantilaiset puritaanit tulkitsivat yhä useammin Raamatun profetioita onnettomuuksista ja toisesta tulemisesta siten, että ne viittasivat nykytilanteisiin. Oppineet miehet yrittivät tulkita Raamatusta päivämäärää, jolloin maailmanloppu voisi saapua. Englantilaisista millenaristeista radikaaleimmat tunnettiin nimellä Viidennen monarkian miehet (Danielin kirjan 7. luvussa kerrotun näyn mukaan). Kahdeksantoista vuosisadan alussa Ranskan camisardit eli ”ranskalaiset profeetat” hakivat katoliselta kuninkaalta suvaitsevaisuutta protestanttiselle kulttuurilleen ja käytännöilleen. Camisardit uskoivat, että heidän kärsimyksensä olivat osa Jumalan suunnitelmaa vuosituhannen vaihteen tuloa varten. Maallikkoprofeetat, joiden joukossa oli monia lapsia, paljastivat ravistelun ja kouristusten fyysisten ilmenemismuotojen keskellä, että tuomiopäivä lähestyy pian ja että maailmanlopun pedon valtakausi päättyy pian.