Jyrsijät isännöivät usein ektoparasiitteja, jotka voivat levittää zoonoottisia tauteja, mutta niiden ektoparasiittiyhdyskunnista tiedetään kuitenkin usein vain vähän, jopa paikoissa, joissa jyrsijät ovat usein vuorovaikutuksessa ihmisten kanssa. Yosemiten kansallispuisto on alue, jossa ihmisten ja eläinten välinen vuorovaikutus on runsasta ja jossa zoonoosien siirtyminen on mahdollista. Siitä huolimatta suhteellisen harvat tutkimukset ovat kartoittaneet nisäkäsisäntien kirppuyhteisöjä tällä alueella, ja vielä harvemmat ovat luonnehtineet saastumista ennustavia ympäristö- ja isäntätekijöitä. Keskityimme kahteen lajiin, alpiiniseen liito-oravaan (Tamias alpinus) ja lodgepole-oravaan (T. speciosus), jotka asuvat Yosemitessa ja sitä ympäröivillä alueilla ja jotka voivat isännöidä kirppuja, jotka levittävät ruttoa. Koska nämä isäntäeläimet reagoivat eri tavoin ympäristön muutoksiin, on arvokasta määrittää niiden kirppuyhteisöjen perusarvot ennen kuin muutokset jatkuvat. Tutkimme näiden liito-orava-isäntien kirppuja kolmen vuoden ajan (2013-2015), myös ruttoepidemian aikana (2015), ja dokumentoimme merkittäviä isäntien välisiä eroja kirppuyhteisöissä ja vuosien välisiä muutoksia. Kirppujen runsaus liittyi isännän ominaisuuksiin, kuten sukupuoleen ja ulosteen glukokortikoidimetaboliittipitoisuuksiin. Keskimääräinen kirppujen määrä yksilöä kohti ja kirppuja kantavien yksilöiden osuus kasvoivat eri vuosina T. speciosus -lajilla mutta ei T. alpinus -lajilla. Ymmärtääksemme näitä malleja paremmin laadimme malleja, joilla tunnistimme ympäristötekijöitä, jotka ennustavat kirppujen määrää kahdelle yleisimmälle kirppulajille, Ceratophyllus ciliatus mononis ja Eumolpianus eumolpi. Tulokset osoittivat, että E. eumolpi- ja C. ciliatus mononis -lajien kirppujen runsauden ympäristölliset ennustetekijät eroavat toisistaan isännästä riippuvaisesti, ja niillä oli huomattavia yhteyksiä ympäristön lämpötilan vaihteluun ja korkeuteen. Nämä tulokset antavat tietoa tekijöistä, jotka vaikuttavat kirppujen runsauteen kahdella liito-oravalajilla, mikä voi olla yhteydessä muuttuvaan ilmastoon ja mahdollisiin tuleviin ruttoepisootioihin.