Esimerkkejä vetysidoksesta

Kun vety on kovalenttisesti sitoutunut erittäin elektronegatiiviseen atomiin, kuten fluoriin, klooriin, happiin tai typpeen, H-atomilla on osittainen positiivinen varaus, joka kirjoitetaan Hδ+.

Hδ+ on fysikaalisesti hyvin pieni, joten sen varaustiheys on epätavallisen suuri.

Kuvitellaan, että toinen negatiivinen tai elektronegatiivinen atomi, vaikkapa toisessa molekyylissä, lähestyy Hδ+:aa;syntyy molemminpuolinen vetovoima, jolloin syntyy erityisen voimakas dipoli-dipoli-veto.Tätä vetovoimaa kutsutaan vetysidokseksi.

Yleisesti vetysidokset ovat heikompia kuin ionisidokset ja kovalenttiset sidokset, mutta vahvempia kuin van der Waalsin voimat.

van der Waalsin voimat < vetysidokset < ioniset ja kovalenttiset sidokset

Vetysidokset vedessä

Tunnetuin esimerkki vetysidoksista on vesi:

Vetysidokset

Jokaiseen vesimolekyyliin voi liittyä vetysidoksia jopa neljän muun vesimolekyylin kanssa.Huoneenlämpöisessä vedessä vetysidoksia on vesimolekyyliä kohti keskimäärin 3,6.

Molekyylien satunnainen lämpöliike takaa sen, että yksittäisen vetysidoksen elinikä vedessä on lyhyt, keskimäärin vain 10 pikosekuntia.Uuden sidoksen muodostumiseen kuluva aika on kuitenkin vieläkin lyhyempi.

Yksittäisen vetysidoksen pysyvään katkaisemiseen vedessä kuluu 21 kJ mol-1, mikä on merkittävä energiapanos.

Tuloksena on, että veden sulamis- ja kiehumispisteet ovat paljon korkeammat kuin näin pienen molekyylipainon molekyyliltä voisi odottaa.

Vesi vs. metaani

Tarkastellaan vettä vs. metaania.Vesimolekyylit vetävät toisiaan puoleensa melko voimakkaasti vetysidoksin, kun taas metaanissa vallitsevat van der Waalsin voimat.Niinpä vaikka niiden molekyylimassat ovat samankaltaiset, vedellä 18 ja metaanilla 16, niiden fysikaaliset ominaisuudet eroavat toisistaan suuresti.Esimerkiksi vesi sulaa 0,00 °C:ssa ja kiehuu 99,98 °C:ssa; metaani sulaa -182,5 °C:ssa ja kiehuu -161,5 °C:ssa.

Vetysidokset vedessä vs. rikkivety

Rikki on jaksollisen järjestelmän ryhmässä 16, samoin kuin happi. Rikki on happea raskaampi, jotenH2S:llä pitäisi olla korkeammat sulamis- ja kiehumispisteet kuin H2O:lla.Näin ei kuitenkaan ole, koska rikki on vähemmän elektronegatiivinen kuin happi, ja siksi vetysidos H2S:ssä on heikko.

Hsub2/subO

Mol. Mass: 16

Sulatus Pt.: 0.00 °C

Kiehumis Pt.: 99.98 °C

O:n elektronegatiivisuus (Pauling): 3.44

vetysidoksen entalpia: 21 kJ mol-1

Hsub2/subS

Mol. Mass: 34

Sulamispt.: -82 °C

Kiehumispt.: -60 °C

S:n elektronegatiivisuus (Pauling): 2.58

Vetysidonnan entalpia: ≅ 3 kJ mol-1

Vetysidonta ammoniakissa ja fluorivedyssä

Fluori ja typpi ovat elektronegatiivisimpia alkuaineita jaksollisen järjestelmän ryhmissään, ja vetyä sitovaa vetyä havaitaan vetyfluoridissa ja ammoniakissa.

Veden tavoin fluorivedyn ja ammoniakin sulamis- ja kiehumispisteet ovat korkeammat kuin niiden ryhmien raskaampien alkuaineiden hydridien.

Ryhmän 14-17 alkuaineiden hydridien sulamispisteet

hydrogen-bonding-melting-points

Hydrogen bonding in DNA

DNA:n emäsparit yhdistävät sen kahta kierteistä ketjua.emäsparit kantavat DNA:n geneettistä informaatiota.

dna

Toisen kierteen emäsparit liittyvät toisen kierteen emäspareihin vetysidoksin.

Siten vetysidokset pitävät kierteet yhdessä luoden kuuluisan kaksoiskierteen.

DNA:n replikoituessa vetysidokset katkeavat ja mahdollistavat molempien kierteiden irtoamisen toisistaan.

Vetysidoksilla on näin olennainen merkitys DNA:n replikaatiomekanismiin kuuluvassa emäspareiden lukitsemisessa.

dna

Vetysidokset villassa

Villassa, kuten muissakin proteiinikuiduissa, on vetysidoksia.Alla olevassa kuvassa näkyy, miten vetysidokset (oranssit pisteet) yhdistävät villan α-helix-ketjun kierteet (vihreät).

h-bonding-alpha-helix

Jos villavaatetta pestään korkeassa lämpötilassa, vetysidokset tuhoutuvat, käämit menettävät kimmoisuutensa ja vaatteesta tulee huonokuntoinen.