cLogP-laskenta

Yhdisteen logP-arvo, joka on n-oktanolin ja veden välisen jakaantumiskertoimen logaritmi log(oktanoli/vesi),on vakiintunut yhdisteen hydrofiilisyyden mitta. Alhainen hydrofiilisyys ja siten korkeat logP-arvot aiheuttavat huonon imeytymisen tai läpäisevyyden. On osoitettu, että jos yhdisteillä on kohtuullinen todennäköisyys imeytyä hyvin, niiden logP-arvo ei saa olla suurempi kuin 5,0. Yli 3000 markkinoilla olevan lääkkeen laskettujen logP-arvojen jakauma korostaa tätä tosiasiaa (ks. kaavio)

Meidän sisäinen logP-laskentamenetelmämme on toteutettu inkrementtijärjestelmänä, johon lisätään jokaisen atomin osuus sen atomityypin perusteella. Kaiken kaikkiaan cLogP-ennustemoottori erottaa 368 atomityyppiä, jotka koostuvat sekä itse atomin (atomin numero ja rengasjäsenyys) että sen suorien naapureiden (sidostyyppi, aromaattisuuden tila ja koodattu atomin numero) eri ominaisuuksista. Yli 5000 yhdistettä, joilla on kokeellisesti määritetyt logP-arvot, käytettiin harjoitusjoukkona atomityyppeihin liittyvien 369 kontribuutioarvojen optimoimiseksi. Korrelaatiokuvio (ks. kaavio) osoittaa, että yli 5000 yhdisteen riippumattoman testijoukon lasketut ja kokeellisesti määritetyt logP-arvot eroavat harjoitusjoukosta.