Luennot:
1. Johdanto: Terve ja sairas kasvi Kasvitaudit ja kasvipatogeeniset mikro-organismit: peruskäsitteet. Kasvitautien diagnosointi, merkitys ja torjunta – historiallinen katsaus.
2. Kasvipatogeeniset mikro-organismit: Johdanto Katsaus tärkeimpiin kasvipatogeenisten virusten, viroidien, bakteerien, fytoplasmojen ja sienten ryhmiin. Näiden ryhmien yleiset ominaisuudet. Kasvipatogeenisten virusten, viroidien, bakteerien, fytoplasmojen ja sienten aiheuttamat epidemiat.
3. Tartuntaprosessi – peruskäsitteet Tartuntaprosessi. Tartunnan saaneiden kasvien reaktiot. Alttius ja vastustuskyky tartunnalle. Taudin oireista vastaavat kasvien aineenvaihduntatuotteet. Kasvien fysiologisen tilan merkitys taudinkestävyydessä.
4. Kasvipatogeeniset virukset ja viroidit: johdanto Kasvipatogeenisten virusten ja viroidien yleinen luonnehdinta. Kasvipatogeenisten virusten ja viroidien tärkeimmät ryhmät.
5. Kasvipatogeeniset virukset ja viroidit: tartuntaprosessi Kasvivirusten siirtyminen: mekaaninen siirtyminen, siirtyminen siementen välityksellä, kasvullinen lisäys (varttaminen) sekä hyönteis-, sukkulamato- ja sienivektorit. Kasvivirusten aiheuttamat oireet. Fysiologiset muutokset tartunnan saaneissa kasveissa. RNA-virusten ja DNA-virusten lisääntyminen. Virusten replikaation molekulaarinen perusta.
6. Kasvipatogeeniset virukset ja viroidit: virusinfektioiden torjunta Klassiset agrotekniset torjuntamenetelmät. Geneettiset, biologiset ja integroidut torjuntamenetelmät. Bioteknisiin välineisiin perustuvat torjuntamenetelmät.
7. Kasvipatogeeniset bakteerit: johdanto Kasvipatogeenisten bakteerien yleinen luonnehdinta. Kasvien ja kasvipatogeenisten bakteerien väliset vuorovaikutukset solu- ja molekyylitasolla. Kasvipatogeenisten bakteerien aiheuttamat kasvitaudit. Bakteeriperäisten kasvitautien torjuntamenetelmät.
8. Kasvipatogeeniset bakteerit: infektioprosessi Bakteerit kasvin kudoksissa tai niiden päällä – vuorovaikutukset ritsosfäärissä ja fyllosfäärissä. Tunkeutuminen kasvikudoksiin. Bakteerien entsyymien, solunulkoisten lipopolysakkaridien ja toksiinien merkitys tunkeutumisprosessissa. Kasvihormonien rooli infektioprosessissa. Kasvin ja bakteerien vuorovaikutuksen geneettinen perusta.
9. Kasvipatogeeniset sienet: johdanto Parasitismi sienikunnassa: kasvipatogeenisten sienten yleiset ominaisuudet. Fysiologiset muutokset tartunnan saaneissa kasveissa. Sienten aiheuttamien kasvitautien tyypit. Sienten aiheuttamien kasvitautien torjunta.
10. Kasvipatogeenisten sienten ryhmät Gymnomycota-, Oomycota-, Chytridiomycetes- ja Zygomycetes-heimoihin kuuluvien kasvipatogeenien yleinen luonnehdinta. Ascomycetes- ja Basidiomycetes-sukuihin kuuluvien kasvipatogeenisten sienten yleinen luonnehdinta.
11. Kasvipatogeenisten sienten geneettinen monimuotoisuus Sienten genomin yleiset ominaisuudet. Kasvipatogeenisten sienten monimuotoisuus: muutokset virulenssissa ja fungisidiresistenssissä; uusien patotyyppien ja rotujen syntyminen; uusien kasvipatogeenien syntyminen; muutokset suvuttomassa/sukupuolisessa lisääntymisessä. Näiden ilmiöiden geneettinen perusta: seksuaaliset ja suvuttomat rekombinaatiot, lajien väliset hybridisaatiot, mutaatiot, mykovirukset ja transposonit.
12. Kasvien taudinkestävyys: resistenssimekanismit Sisäsyntyinen ja hankittu kasvien resistenssi. Kasvien vastustuskyvyn molekulaarinen perusta. Resistenssigeenit kasveissa.
13. Kasvinsuojelu: klassiset ja nykyaikaiset torjuntamenetelmät Katsaus klassiseen agrotekniseen, kemialliseen, biologiseen ja integroituun kasvinsuojeluun. Kasvitaudeille vastustuskykyisten kasvien jalostus klassisia ja molekulaarisia keinoja käyttäen. Kasvitaudeille vastustuskykyiset siirtogeeniset kasvit.Kasvipatogeenien biologinen torjunta.
14. Kasvipatogeenien tunnistaminen käyttäen klassisia ja nykyaikaisia välineitä Kasvipatogeenisten virusten, bakteerien ja sienten diagnosointi käyttäen klassisia menetelmiä ja molekulaarisia välineitä proteiini- ja nukleiinihappoprofiilien perusteella.
15. Kasvitaudit, joilla on monimutkainen etiologia. Luonnonvaraisten kasvien taudit. Kasvitautien ekologia Kasvitauteja aiheuttavat fysiologiset tekijät. Fysiologisten tekijöiden aiheuttamien tautien oireet. Kasvitaudit, joilla on monimutkainen etiologia. Kasvitautien esiintyminen luonnon ekosysteemeissä – ekologisia näkökohtia.